[发明专利]H10N7禽流感病毒的实时荧光PCR检测试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201710109493.6 | 申请日: | 2017-02-27 |
公开(公告)号: | CN106702028B | 公开(公告)日: | 2020-05-19 |
发明(设计)人: | 徐赛涛;吴勇聪;温小媛;陶瑞 | 申请(专利权)人: | 解码(上海)生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686 |
代理公司: | 上海硕力知识产权代理事务所(普通合伙) 31251 | 代理人: | 刘红梅 |
地址: | 200120 上海市浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | h10n7 禽流感 病毒 实时 荧光 pcr 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种利用实时荧光PCR检测H10N7禽流感病毒的试剂盒,其特征在于包括:
(1)RNA提取试剂、实时荧光定量PCR扩增反应试剂、阳性对照品、阴性对照品;
(2)引物组和探针组;引物组有引物1至引物4,分别对应序列表SEQ.ID.No.1和2、SEQ.ID.No.4和5的碱基序列;探针组有探针A和探针B,分别对应序列表SEQ.ID.No.3和SEQ.ID.No.6的碱基序列。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:
所述RNA提取试剂采用病毒RNA提取试剂盒;
所述实时荧光定量PCR扩增反应试剂包括PCR扩增缓冲液、引物1、引物2、引物3、引物4、探针A、探针B、逆转录酶、DNA聚合酶、RNase抑制剂;
所述阳性对照品采用H10N7阳性对照,阴性对照品采用DEPC H2O。
3.一种非诊断目的的H10N7禽流感病毒的实时荧光PCR检测方法,其特征在于包括如下检测步骤:
S1、标本处理:标本混匀后用于下一步核酸提取;
S2、RNA核酸提取:利用裂解法裂解病毒,利用磁珠法进行核酸提取;
S3、RT-PCR扩增反应:
RT-PCR反应体系包括:RT-PCR反应液,两对特异性正、反向引物和两条特异性探针混合液,逆转录酶,DNA聚合酶,RNase抑制剂,DEPC水,RT-PCR质控品,标本RNA核酸;其中,所述的特异性引物和探针是针对HA和NA基因两个靶标的特异性引物扩增区内设计,能够区别其他病毒株;
所述的特异性引物为:
H10-F:5’-AGTGAAATAGAACACCAAATTGGCA-3’SEQ ID No.01;
H10-R:5’-TGCTACCAGCAATTCAGCCT-3’SEQ ID No.02;
N7-F:5’-AGAGTGAGGAAGCAACTAAGGC-3’SEQ ID No.O4;
N7-R:5’-AGAAGAGAGTCTCACCGGACT-3’SEQ ID No.O5;
所述的特异性探针为:
H10-P:5’-FAM-ACTAAGGATTCCATAACAG-3’SEQ ID No.O3;
N7-P:5’-VIC-ATACCACAAATGTGACGACA-3’SEQ ID No.O6;
将上述混合好的反应液进行PCR扩增及荧光信号检测;
S4、结果判定:对RT-PCR反应产物进行荧光检测,根据荧光检测的最低Ct值和最高荧光强度判断结果,若RT-PCR反应产物的荧光检测结果呈阳性,则待测样品含有H10N7禽流感病毒。
4.根据权利要求3所述的一种非诊断目的的H10N7禽流感病毒的实时荧光PCR检测方法,其特征在于:步骤S2中所述的RNA提取采用病毒RNA提取试剂盒提取,取140ul标本,按照试剂盒说明书中的操作步骤提取RNA,最后用60ul洗脱液洗脱RNA。
5.根据权利要求3所述的一种非诊断目的的H10N7禽流感病毒的实时荧光PCR检测方法,其特征在于:步骤S3中所述的RT-PCR反应体系为:RT-PCR反应液10.0μl,引物探针混合液2.75μl,逆转录酶0.2μl,DNA聚合酶0.2μl,RNase抑制剂0.4μl,DEPC H2O 6.45μl,标本核酸5.0μl。
6.根据权利要求3所述的一种非诊断目的的H10N7禽流感病毒的实时荧光PCR检测方法,其特征在于:步骤S3中所述的RT-PCR扩增的反应条件是:45℃逆转录10min;95℃变性2min;95℃变性5s,60℃退火和延伸60s,40个循环。
7.根据权利要求3所述的一种非诊断目的的H10N7禽流感病毒的实时荧光PCR检测方法,其特征在于:所述探针H10-P的5’端标记有报告荧光染料FAM,3’端标记有淬灭荧光染料Eclipse;所述探针N7-P的5’端标记有报告荧光染料VIC,3’端标记有淬灭荧光染料Eclipse。
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