[发明专利]一种捕获核酸结合蛋白的方法和试剂盒有效
申请号: | 201710080808.9 | 申请日: | 2017-02-15 |
公开(公告)号: | CN108427000B | 公开(公告)日: | 2021-06-08 |
发明(设计)人: | 张必良;米格尔·埃斯特班;鲍习琛;郭亨彭;尹梦回;王玮;克雷格·梅洛 | 申请(专利权)人: | 广州市锐博生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香 |
地址: | 510663 广东省广州市广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 捕获 核酸 结合 蛋白 方法 试剂盒 | ||
1.一种捕获RBP和/或RNA的方法,其特征在于,主要包括以下步骤:
1)将带有亲偶极基团的核苷类似物加入到可合成RNA的生物样品体系中;所述带有亲偶极基团的核苷类似物包括EU、EC、EG、EA或其组合;
2)光激活处理,使RNA与蛋白发生光交联;
3)加入含有1,3- 二偶极基团的第一标记分子的点击反应液,通过点击反应将第一标记分子与掺有核苷类似物的RNA共价连接,使RNA被第一标记分子标记,所述点击反应为亚铜离子催化下的Huisgen三唑反应,所述点击反应液中包括有催化剂和蛋白保护剂,所述蛋白保护剂为氨基胍和THPTA;所述1,3- 二偶极基团为叠氮基;
4)加入细胞裂解液,至样品溶液澄清,所述细胞裂解液中包括有0.15M-1M的Li盐和0.1-1%的含锂离子的去垢剂;
5)加入连接有载体的第二标记分子,第二标记分子能与第一标记分子结合反应,通过第二标记分子与第一标记分子的结合反应,将所形成的RNA-蛋白复合物偶联至带有第二标记分子的载体上;
6)分离获得载体上的RNA-蛋白复合物;
7)分离获得RNA-蛋白复合物中的RBP和/或RNA。
2.根据权利要求1所述的捕获RBP和/或RNA的方法,其特征在于,所述蛋白保护剂为0.3-1.5mM的THPTA和0.5-1.5mM的氨基胍。
3.根据权利要求2所述的捕获RBP和/或RNA的方法,其特征在于,所述蛋白保护剂为0.6mM的THPTA和1mM的氨基胍。
4.根据权利要求1-3任一项所述的捕获RBP和/或RNA的方法,其特征在于,所述细胞裂解液包括有0.45M-0.5M的LiCl和0.5-1%的LiDS。
5.根据权利要求1-3任一项所述的捕获RBP和/或RNA的方法,其特征在于,所述催化剂为一价Cu+或Vitamin C和Cu2+的组合。
6.根据权利要求1-3任一项所述的捕获RBP和/或RNA的方法,其特征在于,所述步骤2)的光为UV254、UV365或其组合。
7.根据权利要求1-3任一项所述的捕获RBP和/或RNA的方法,其特征在于,所述第一标记分子包括生物素、地高辛、金颗粒、纳米颗粒或抗体;所述第二标记分子包括识别第一标记分子生物素的链霉亲和素;所述载体包括磁珠或琼脂糖珠。
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