[发明专利]调控玉米叶夹角主效QTL的分子标记及其应用方法

说明书

本发明属于作物分子育种领域，具体涉及了一种调控玉米叶夹角主效QTL的分子标记及其应用。调控玉米叶夹角主效QTL的分子标记，由LA16和LA19两对SSR标记组成。一种辅助选择株型紧凑叶夹角小的玉米方法，包括待测玉米基因组DNA提取，上述标记LA16和LA19进行PCR扩增，当得到长度为194bp和209bp的扩增产物时，则待测玉米为候选紧凑株型玉米，并将所述的候选紧凑株型玉米应用于育种。通过本发明的分子标记进行辅助选择紧凑株型叶夹角小的玉米，只需要检测分子标记的特征条带即可预测叶夹角的大小，其鉴定方法简单可行、选择效率高，在玉米株型育种领域具有巨大的应用潜力。

技术领域

本发明属于农作物分子育种领域，特别涉及一种调控玉米叶夹角主效QTL的分子标记，本发明还涉及调控玉米叶夹角主效QTL的分子标记在玉米育种中的应用方法。

技术背景

作为重要的粮食、饲料及工业原料，玉米在维护粮食安全、促进畜牧业发展及提供淀粉加工原料上具有举足轻重的作用。叶夹角是评价玉米株型的重要指标，研究表明不同株型的玉米会直接影响群体冠层内的光分布状况及群体的光能利用效率，且最终显著影响玉米产量。国内外诸多玉米株型试验证明株型对提高密植性、抗倒伏及产量具有重要意义。因此，选育株型紧凑、密植性高的新品种已然成为玉米高产育种的有效途径之一。

玉米株型性状是由多基因控制的复杂数量性状，机理极其复杂，且易受环境影响，因此这给玉米株型机理研究带来了诸多困难。随着分子生物学技术的发展，尤其是分子标记的广泛应用，可以对数量性状相关基因/QTL位点进行分析，深入剖析其遗传机理，挖掘候选功能基因，为分子标记辅助选择(Marker-assisted selection,MAS)育种提供理论依据及技术支撑。

目前，有关玉米株型相关性状QTL定位研究引起了许多学者的广泛关注，但由于受以下诸多因素的制约：①亲本材料遗传背景：兰卡斯特种质(Lancaster,Lan)、四平头种质(Singpingtou,SPT)、旅大红骨种质(BSSS)、瑞德种质(Reid)、PA种质、PB种质等；②定位群体类型：F_2:3分离群体、回交群体(Backcross,BC)、重组自交系群体(Recombination inbredlines,RILs)等；③定位群体大小(一般>200)；④定位群体表型环境；⑤遗传连锁图谱精度(一般>200标记)；⑥QTL定位方法：区间作图法(Interval mapping,IM)、复合区间作图法(Composite interval mapping,CIM)、完备区间作图法(Inclusive composite intervalmapping,ICIM)、基于混合线性模型的复合区间作图法(Mixed linear model based oncomposite interval mapping,MCIM)等，导致玉米株型相关性状QTL定位结果存在差异。因此，挖掘不同遗传背景下，在多环境都稳定表达的主效QTL对相关QTL位点的精细定位及MAS育种具有重要意义。

发明内容

本发明要解决的技术问题在于提供一种调控玉米叶夹角主效QTL的分子标记；本发明还提供一种辅助选择株型紧凑叶夹角小的玉米方法；本发明还提供一种调控玉米叶夹角主效QTL的分子标记在玉米育种中的应用方法。

为了解决上述技术问题，本发明采用如下技术方案：一种调控玉米叶夹角主效QTL的分子标记，由LA16和LA19两对引物组成，所述引物LA16的序列为：

Forward:5’-GGCCCTGCTGGTAGTTGAT-3’

Reverse:5’-TAGTTGATGGTCGTCCCGG-3’；

所述引物LA19的序列为：

Forward:5’-TAACTGAGTGGGTGGGGTGT-3’

Reverse:5’-TGTGGGGTGGGTGAGTCAAT-3’。