[发明专利]一种识别切片组织的方法在审
申请号: | 201710040116.1 | 申请日: | 2017-01-18 |
公开(公告)号: | CN106815849A | 公开(公告)日: | 2017-06-09 |
发明(设计)人: | 刘炳宪;谢菊元;王焱辉;王克惠;刘树郁 | 申请(专利权)人: | 宁波江丰生物信息技术有限公司 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/187;G06T7/60;G06T7/90 |
代理公司: | 上海申新律师事务所31272 | 代理人: | 俞涤炯 |
地址: | 315400 浙江省宁*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 识别 切片 组织 方法 | ||
技术领域
本发明涉及病理切片领域,尤其涉及一种识别切片组织的方法。
背景技术
近年来,随着计算机与网络技术的发展和不断完善,数字病理系统应运而生。与传统病理切片相比,数字病理切片在切片浏览、传输、保存及教学与会诊等多方面都发生了巨大变革,使得数字病理系统在今后的医疗病理诊断方面成为一种不可缺少的重要工具。
在切片扫描之前,需要对切片的预览图进行预备处理,较准确的识别出组织,并提取相关信息以便扫描。传统的识别方法是使用图像处理技术,将预览图灰度化,再根据亮度差别区分出切片的组织、背景、杂质、或切片的染色污迹,从而识别并提取组织部分。
传统方法一般是针对某一种或几种特定的切片组织类别进行识别,不适用于大多数切片,且在采用传统的亮度识别方法的过程中,经常出现遗漏组织或者将杂质和污渍误识别为组织的情况,导致很难进行准确有效的识别,从而降低了识别切片组织的准确率和效率。
发明内容
针对目前不能识别大多数切片组织且识别准确低的情况,本发明提供一种识别切片组织的方法。
本发明解决技术问题所采用的技术方案为:
一种识别切片组织的方法,提供一空白切片以及待识别的组织切片,所述方法包括:
步骤1,扫描出所述空白切片的背景图以及待识别的组织切片的预览图;
步骤2,将所述预览图的灰度值减去所述背景图的灰度值,得到一切片信息图;
步骤3,遍历处理所述切片信息图的连通域,剔除所述切片信息图中的污渍;
步骤4,根据所述连通域的属性分别判断所述切片信息图中的各个连通域是否为切片组织,并剔除被判断为不是所述切片组织的所述连通域;
步骤5,保留剔除不是所述切片组织的所述连通域后的所述切片信息图并作为切片组织图片输出。
优选的,所述步骤4包括:
在经过剔除所述切片信息图中的污渍后的剩余的连通域中找出面积最大的连通域,并分别将其他的剩余的连通域的面积与所述面积最大的连通域的面积相比计算得到一面积差值,将所述面积差值在一预设的面积差值范围内的连通域判断为切片组织。
优选的,所述步骤4包括:
计算经过剔除所述切片信息图中的污渍后的剩余的连通域的RGB各通道的颜色均值,并分别根据剩余的各个连通域的RGB各通道的颜色值与RGB各通道的颜色均值处理得到对应的RGB差值,将同一个所述连通域的所述RGB差值均在一预设的RGB差值范围内所对应的所述连通域判断为切片组织。
优选的,所述步骤4中,将在所述切片信息图中与所述切片信息图的边缘相接触的连通域判断为不是所述切片组织的所述连通域。
优选的,所述步骤4中,将经过剔除所述切片信息图中的污渍后的剩余的连通域的亮度值在一预设的亮度范围内的连通域判断为是所述切片组织的所述连通域。
优选的,所述步骤3中,剔除所述切片信息图中的污渍的方法包括:
剔除面积小于一预设的面积的连通域;和/或
剔除长宽比例小于一预设的长宽系数的连通域;和/或
剔除面积占比系数小于一预设的面积占比系数的连通域。
优选的,在执行所述步骤2之前,首先执行下述步骤:
步骤1A,剪除所述空白切片的背景图以及所述组织切片的预览图的边缘部分,随后转向所述步骤2。
优选的,在执行所述步骤3之前,首先执行下述步骤:
步骤2A,对所述切片信息图进行图像二值化操作,随后转向所述步骤3。
优选的,在执行所述步骤3之前,首先执行下述步骤:
步骤2A,对所述切片信息图进行图像二值化操作;
步骤2B,对经过图像二值化处理后的切片信息图进行开运算,随后转向所述步骤3。
本发明的有益效果:本发明采用图像处理技术,通过对组织和杂质在颜色特征和几何形状特征上进行判别,尽可能有效的识别出组织部分,同时对大多数的杂质和污渍进行识别并将其剔除,从而更精确地分离出切片预览图中的组织部分。
附图说明
图1为本发明的识别切片组织的一种实施例的流程图;
图2为空白切片的背景图;
图3为拍摄的切片组织的预览图;
图4为剪除图3的边缘之后的图;
图5为切片组织的切片信息图;
图6为将图5经过图像二值化处理后的二值化图;
图7为将图6经过开运算之后的图;
图8为图7经过几何形状判别后的图;
图9为图8经过颜色判别后的图;
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