[发明专利]用于筛选肠癌和/或胃癌的基因标志物的方法、用该方法筛选的基因标志物及其用途

权利要求书

1.用于检测肠癌的基因标志物，包括一个或多个选自以下的基因：ADAM金属肽酶域20(ADAM20)、F盒和富亮氨酸重复蛋白7(FBXL7)、卵泡抑素(FST)、TP53凋亡效应器(PERP)、普列克底物蛋白同源相似域家族A成员3(PHLDA3)、Runt相关转录因子1移动伴侣1(RUNX1T1)、互养蛋白γ 2(SNTG2)、精子相关抗原4(SPAG4)、硫酸酯酶1(SULF1)和NME/NM23核苷二磷酸激酶(NME3)。

2.权利要求1所述的基因标志物，包括ADAM20、FBXL7、FST、PERP、PHLDA3、RUNX1T1、SNTG2、SPAG4、SULF1和NME3。

3.权利要求1或2所述的基因标志物在用于检测肠癌的方法中的用途。

4.用于检测胃癌的基因标志物，包括一个或多个选自以下的基因：Rho GTP酶激活蛋白28(ARHGAP28)、BMP结合内皮调控者(BMPER)、染色体9开放读码框92(C9orf92)、钙依赖分泌激活者2(CADPS2)、钙粘蛋白11(CDH11)、F盒和富亮氨酸重复蛋白7(FBXL7)、间质同源框2(MEOX2)、氧化一氮合成酶1(NOS1)、抑瘤素M受体(OSMR)、细胞膜调控蛋白paralemmin2(PALM2)、磷酸二酯酶10A(PDE10A)、RNA结合模体单链相互作用蛋白3(RBMS3)、硫酸酯酶1(SULF1)、wntless Wnt配体分泌调节者(WLS)、Wilms瘤1作用蛋白(WTIP)、锌指蛋白518B(ZNF518B)、锌指蛋白714(ZNF714)和RadS2模体包含1(RDM1)。

5.权利要求4所述的基因标志物，包括ARHGAP28、BMPER、C9orf92、CADPS2、CDH11、FBXL7、MEOX2、NOS1、OSMR、PALM2、PDE10A、RBMS3、SULF1、WLS、WTIP、ANF518B、ZNF714和RDM1。

6.权利要求4或5所述的基因标志物在用于检测胃癌的方法中的用途。

7.一种用于检测肠癌的方法，包括以下步骤：

(a)测定正常样品和受试者样品中权利要求1或2所述的基因标志物的5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)的含量；

(b)用正常样品中所述基因标志物的5-hmC含量作为参照，将受试者样品中对应的基因标志物的5-hmC含量标准化；

(c)对步骤(b)中经标准化的所述基因标志物的5-hmC含量进行数学关联，并获得评分；和

(d)根据所述评分获得检测结果。

8.一种用于检测胃癌的方法，包括以下步骤：

(a)测定正常样品和受试者样品中权利要求4或5所述的基因标志物的5-hmC含量；

(b)用正常品中所述基因标志物的5-hmC含量作为参照，将受试者样品中对应的基因标志物的5-hmC含量标准化；

(c)对经标准化的所述基因标志物的5-hmC含量进行数学关联，并获得评分；和

(d)根据所述评分获得检测结果。

9.权利要求7或8所述的方法，其中步骤(a)是测定所述基因标志物全长或其片段上的5-hmC的含量。

10.权利要求7或8所述的方法，其中所述样品是来自正常人或受试者体液中游离的DNA片段，或来源于细胞器、细胞以及组织中的完整基因组DNA。

11.权利要求10所述的方法，其中所述体液是血液、尿液、汗液、痰液、粪便、脑脊液、腹水、胸水、胆汁或胰腺液。

12.一种用于检测肠癌的试剂盒，包括：

(a)用于测定权利要求1或2所述的基因标志物的5-hmC含量的试剂；和

(b)说明书。

13.一种用于检测胃癌的试剂盒，包括：

(a)用于测定权利要求4或5所述的基因标志物的5-hmC含量的试剂；和

(b)说明书。