[发明专利]一种荧光探针检测血吸虫DNA的方法有效

专利信息
申请号: 201611206727.0 申请日: 2016-12-23
公开(公告)号: CN106701940B 公开(公告)日: 2021-08-24
发明(设计)人: 赵松;杨坤;李伟;张键锋;羊海涛;郭利川;刘小曼;王智宏;应清界 申请(专利权)人: 江苏省血吸虫病防治研究所;江苏奇天基因生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6844 分类号: C12Q1/6844;C12Q1/6888
代理公司: 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 代理人: 崔自京
地址: 214000 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 荧光 探针 检测 血吸虫 dna 方法
【权利要求书】:

1.一种非诊断目的的荧光探针检测血吸虫DNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:将扩增体系与血吸虫DNA混合,进行等温扩增;在等温扩增过程中用荧光探针法对扩增产物进行实时检测,有荧光信号放大为阳性,说明存在血吸虫DNA;所述扩增体系包括以下组分:Tris缓冲液、醋酸钾、醋酸镁、二硫苏糖醇、聚乙二醇、ATP、dNTPs、磷酸肌酸、单链结合蛋白、重组酶、UvsY蛋白、核酸外切酶、荧光探针、DNA聚合酶和血吸虫DNA特异性引物;

所述血吸虫DNA特异性引物由正向引物和反向引物组成:

正向引物序列:

5'-TACCTCAAGAAGTAATGTCCTTCCATTGTG-3',

反向引物序列:

5'-ATGCGAGGTTTCAGGAGACCAAGAAGAACG-3';

所述荧光探针序列为:

5'-CATAGGAGGTCATCTTGTTCAAGGTCAAGTCTCACCATCAACTCTTA-3'

所述等温扩增的温度为35~45℃;

所述等温扩增的时间为5~20min;

所述扩增体系包括以下浓度的组分:Tris缓冲液30~50mM、醋酸钾50~150mM、醋酸镁8~30mM、二硫苏糖醇4~9mM、质量浓度为5.5~7.8%的聚乙二醇、ATP 1~6mM、dNTPs 0.1~0.4mM、磷酸肌酸20~100ug/μL、单链结合蛋白300~1000ng/μL 、重组酶50~500ng/μL 、UvsY蛋白50~200ng/μL 、核酸外切酶30~200ng/μL 、荧光探针50~150nM、DNA聚合酶60~150ng/μL 、正向引物200~600nM和反向引物200~600nM;

所述扩增体系为冷冻干燥后的粉末状扩增体系,用终浓度为6%(w/v),分子量为35000的聚乙二醇溶液作为缓冲溶液将所述扩增体系重新溶解后与血吸虫DNA混合,进行等温扩增;

所述血吸虫DNA的体积为0.5~1.5μL ,浓度为10~100ng/μL 。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述扩增体系的体积为25~100μL 。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述等温扩增在恒温条件下进行,所述等温扩增的温度为37~42℃。

4.根据权利要求1或3所述的方法,其特征在于,所述等温扩增的时间为10~20min。

5.一种检测血吸虫DNA用等温扩增体系,其特征在于,包括以下含量的组分:Tris缓冲液30~50mM、醋酸钾50~150mM、醋酸镁8~30mM、二硫苏糖醇4~9mM、质量浓度为5.5~7.8%的聚乙二醇、ATP 1~6mM、dNTPs 0.1~0.4mM、磷酸肌酸20~100ug/μL、单链结合蛋白300~1000ng/μL 、重组酶50~500ng/μL 、UvsY蛋白50~200ng/μL 、核酸外切酶30~200ng/μL 、荧光探针50~150nM、DNA聚合酶60~150ng/μL 、正向引物200~600nM和反向引物200~600nM;

所述正向引物序列:

5'-TACCTCAAGAAGTAATGTCCTTCCATTGTG-3',

所述反向引物序列:

5'-ATGCGAGGTTTCAGGAGACCAAGAAGAACG-3';

所述荧光探针序列为:

5'-CATAGGAGGTCATCTTGTTCAAGGTCAAGTCTCACCATCAACTCTTA-3'。

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