[发明专利]一种荧光探针检测血吸虫DNA的方法有效
| 申请号: | 201611206727.0 | 申请日: | 2016-12-23 |
| 公开(公告)号: | CN106701940B | 公开(公告)日: | 2021-08-24 |
| 发明(设计)人: | 赵松;杨坤;李伟;张键锋;羊海涛;郭利川;刘小曼;王智宏;应清界 | 申请(专利权)人: | 江苏省血吸虫病防治研究所;江苏奇天基因生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/6888 |
| 代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 崔自京 |
| 地址: | 214000 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 荧光 探针 检测 血吸虫 dna 方法 | ||
1.一种非诊断目的的荧光探针检测血吸虫DNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:将扩增体系与血吸虫DNA混合,进行等温扩增;在等温扩增过程中用荧光探针法对扩增产物进行实时检测,有荧光信号放大为阳性,说明存在血吸虫DNA;所述扩增体系包括以下组分:Tris缓冲液、醋酸钾、醋酸镁、二硫苏糖醇、聚乙二醇、ATP、dNTPs、磷酸肌酸、单链结合蛋白、重组酶、UvsY蛋白、核酸外切酶、荧光探针、DNA聚合酶和血吸虫DNA特异性引物;
所述血吸虫DNA特异性引物由正向引物和反向引物组成:
正向引物序列:
5'-TACCTCAAGAAGTAATGTCCTTCCATTGTG-3',
反向引物序列:
5'-ATGCGAGGTTTCAGGAGACCAAGAAGAACG-3';
所述荧光探针序列为:
5'-CATAGGAGGTCATCTTGTTCAAGGTCAAGTCTCACCATCAACTCTTA-3'
所述等温扩增的温度为35~45℃;
所述等温扩增的时间为5~20min;
所述扩增体系包括以下浓度的组分:Tris缓冲液30~50mM、醋酸钾50~150mM、醋酸镁8~30mM、二硫苏糖醇4~9mM、质量浓度为5.5~7.8%的聚乙二醇、ATP 1~6mM、dNTPs 0.1~0.4mM、磷酸肌酸20~100ug/μL、单链结合蛋白300~1000ng/μL 、重组酶50~500ng/μL 、UvsY蛋白50~200ng/μL 、核酸外切酶30~200ng/μL 、荧光探针50~150nM、DNA聚合酶60~150ng/μL 、正向引物200~600nM和反向引物200~600nM;
所述扩增体系为冷冻干燥后的粉末状扩增体系,用终浓度为6%(w/v),分子量为35000的聚乙二醇溶液作为缓冲溶液将所述扩增体系重新溶解后与血吸虫DNA混合,进行等温扩增;
所述血吸虫DNA的体积为0.5~1.5μL ,浓度为10~100ng/μL 。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述扩增体系的体积为25~100μL 。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述等温扩增在恒温条件下进行,所述等温扩增的温度为37~42℃。
4.根据权利要求1或3所述的方法,其特征在于,所述等温扩增的时间为10~20min。
5.一种检测血吸虫DNA用等温扩增体系,其特征在于,包括以下含量的组分:Tris缓冲液30~50mM、醋酸钾50~150mM、醋酸镁8~30mM、二硫苏糖醇4~9mM、质量浓度为5.5~7.8%的聚乙二醇、ATP 1~6mM、dNTPs 0.1~0.4mM、磷酸肌酸20~100ug/μL、单链结合蛋白300~1000ng/μL 、重组酶50~500ng/μL 、UvsY蛋白50~200ng/μL 、核酸外切酶30~200ng/μL 、荧光探针50~150nM、DNA聚合酶60~150ng/μL 、正向引物200~600nM和反向引物200~600nM;
所述正向引物序列:
5'-TACCTCAAGAAGTAATGTCCTTCCATTGTG-3',
所述反向引物序列:
5'-ATGCGAGGTTTCAGGAGACCAAGAAGAACG-3';
所述荧光探针序列为:
5'-CATAGGAGGTCATCTTGTTCAAGGTCAAGTCTCACCATCAACTCTTA-3'。
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