[发明专利]检测油菜素内酯生物合成基因内是否存在突变体的方法有效
申请号: | 201611080210.1 | 申请日: | 2016-11-30 |
公开(公告)号: | CN106755338B | 公开(公告)日: | 2020-04-28 |
发明(设计)人: | 杜俊波;孙歆;孙孟园;尚静;刘江;杨文钰;杨峰;舒凯;刘卫国;王小春;雍太文;杨辉;李壮 | 申请(专利权)人: | 四川农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 | 代理人: | 易小艺 |
地址: | 611131 四川省*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 油菜 内酯 生物 合成 基因 是否 存在 突变体 方法 | ||
1.检测油菜素内酯生物合成基因内是否存在突变体的方法,其特征在于:包括以下步骤:
(1)获得检测样品植物;将T-DNA pBIB-BASTA用根癌农杆菌介导的方法转化进入拟南芥Col-0,获得转基因样品植株;
(2)用1μM油菜素内酯喷施样品植物,恢复其矮小皱缩表型;表型为发育迟缓、莲座宽度变小、植株高度降低、荚果长度减小;
(3)按照Qiangen公司生产的RNA提取试剂盒及说明书提取总RNA,取2μg总RNA用Invitrogen公司的M-MLV反转录酶按照其说明书进行反转录后得到cDNA;
(4)RT-PCR检测,取100ng总RNA对应的cDNA,用宝生物生产的ExTaq酶按照其说明书进行PCR扩增;若发现油菜素内酯合成途径中关键基因未表达,则为存在突变体;其中所述关键基因为dwf5,未表达的基因序列如SEQ ID NO:1所示。
2.根据权利要求1中所述的检测油菜素内酯生物合成基因内是否存在突变体的方法,其特征在于:所述检测方法中包括步骤:提取检测样品植物的基因组DNA,用引物P1和P2扩增得到DNA片段,发现DNA片段长度减小,经测序鉴定后发现检测样品植物中缺失一段DNA序列。
3.根据权利要求2中所述的检测油菜素内酯生物合成基因内是否存在突变体的方法,其特征在于:所述引物P1序列为:5’-CATAAAATGGGAGATTGGGAGT-3’
引物P2序列为:5’-CATAGGTGCAACACTTAATCCA-3’。
4.根据权利要求1所述的检测油菜素内酯生物合成基因内是否存在突变体的方法,其特征在于:所述PCR扩增条件如下:95℃,2min;95℃,15s;55℃,30s;72℃,2min,第2至第4步重复29个循环;72℃延伸10min。
5.根据权利要求1中所述的检测油菜素内酯生物合成基因内是否存在突变体的方法,其特点在于:所述PCR扩增中引物序列如下:
DWF5-F:5’-ATGACTCGAGCTCTGCTGCTG-3’;
DWF5-R:5’-TCATACGTATATCCCTAAAAC-3’;
以EF1a为内参基因,EF1ɑ-F:5’-CAGGCTGATTGTGCTGTCCT-3’;
EF1ɑ-R:5’-TCAAGTAGCAAAATCACGGCGCTT-3’。
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