[发明专利]一种杏鲍菇菌种鉴别的方法及专用DNA条形码片段有效
申请号: | 201610555271.2 | 申请日: | 2016-07-14 |
公开(公告)号: | CN105969891B | 公开(公告)日: | 2018-02-06 |
发明(设计)人: | 赵鹏;纪森鹏;周军辉;高兴喜 | 申请(专利权)人: | 鲁东大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司11245 | 代理人: | 关畅,白艳 |
地址: | 264025 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 杏鲍菇 菌种 鉴别 方法 专用 dna 条形码 片段 | ||
技术领域
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种杏鲍菇菌种鉴别的方法及专用DNA条形码片段。
背景技术
改革开放以来,我国食用菌产业迅速发展,已成为世界上最大的食用菌生产大国。杏鲍菇是近年来栽培成功的集食用、药用、食疗于一体的珍稀食用菌新品种。杏鲍菇营养丰富,富含蛋白质、碳水化合物、维生素及钙、镁、铜、锌等矿物质,可以提高人体免疫功能,对人体具有抗肿瘤、降血脂、润肠胃以及美容等作用。菌种在杏鲍菇产业的发展中起着重要的、不可替代的作用。近年来菌种事故多数是菌种错误造成的,不法从业者利用假冒伪劣菌种扰乱市场,谋取不当利益。因此,杏鲍菇菌种的真实性检测显得至关重要。常规检测手段主要有:肉眼感官观察、菌丝生长速度、农艺性状和商品性状检验、同工酶电泳法、ISSR法等。这些方法耗时多,具有一定的组织与发育阶段的特异性,结果不可靠。
DNA条形码技术利用一段通用的DNA序列,对物种进行快速准确鉴定。该技术鉴定样品不受其生长发育阶段影响、所需材料少,简单便捷,所需时间短,结果可靠,可以实现对杏鲍菇菌种快速准确的物种鉴定。
发明内容
本发明的一个目的是提供一种DNA片段。
本发明提供的DNA片段,为如下1)或2)或3):
1)、序列3所示的DNA片段;
2)、序列3第21-374位核苷酸所示的DNA片段;
3)、为与1)或2)所示片段的核苷酸序列同源性大于99%的片段。
本发明的另一个目的是提供所述DNA片段的新用途。
本发明提供了所述DNA片段在鉴别或辅助鉴别杏鲍菇菌种中的应用。
本发明第3个目的是提供检测杏鲍菇菌种基因组中是否含有所述DNA片段的物质的新用途。
本发明提供了检测杏鲍菇菌种基因组中是否含有所述DNA片段的物质在鉴别杏鲍菇菌种中的应用。
上述应用中,所述检测杏鲍菇菌种基因组中是否含有所述DNA片段的物质为如下1)或2):
1)用于扩增所述DNA条形码片段的引物对;
2)含有所述引物对的PCR试剂或试剂盒。
上述应用中,所述引物对由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成。
或所述PCR试剂中,所述引物1和所述引物2的摩尔比为1:1。
或所述PCR试剂中,所述引物1和所述引物2的浓度均为10μmol/L。
本发明第4个目的是提供一种鉴别或辅助鉴别杏鲍菇菌种的方法。
本发明提供的方法,包括如下步骤:检测待测样品中是否含有所述DNA片段;如果含有,则待测样品为或候选为杏鲍菇菌种;如果不含有,则待测样品不为或候选不为杏鲍菇菌种。
上述方法中,
所述检测待测样品中是否含有所述DNA片段的方法包括如下步骤:
1)用序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成的引物对对待测样品进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;
2)测序所述PCR扩增产物,将所述PCR扩增产物的序列与所述DNA片段进行比对,若同源性大于99%,则待测样品中含有所述DNA片段,若同源性小于等于99%,则待测样品中不含有所述DNA片段。
上述方法中,
所述PCR扩增的模板为待测样品的基因组DNA。
本发明第5个目的是提供检测杏鲍菇菌种基因组中是否含有所述DNA片段的物质。
本发明提供的检测杏鲍菇菌种基因组中是否含有所述DNA片段的物质,其为如下1)或2):
1)用于扩增所述DNA条形码片段的引物对;
2)含有所述引物对的PCR试剂或试剂盒。
上述物质中,所述引物对由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成。
或所述PCR试剂中,所述引物1和所述引物2的摩尔比为1:1。
或所述PCR试剂中,所述引物1和所述引物2的浓度均为10μmol/L。
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