[发明专利]一种杏鲍菇菌种鉴别的方法及专用DNA条形码片段有效
申请号: | 201610555271.2 | 申请日: | 2016-07-14 |
公开(公告)号: | CN105969891B | 公开(公告)日: | 2018-02-06 |
发明(设计)人: | 赵鹏;纪森鹏;周军辉;高兴喜 | 申请(专利权)人: | 鲁东大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司11245 | 代理人: | 关畅,白艳 |
地址: | 264025 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 杏鲍菇 菌种 鉴别 方法 专用 dna 条形码 片段 | ||
1.一种专用DNA条形码在鉴别或辅助鉴别杏鲍菇菌种中的应用。
所述专用DNA条形码为序列3第21-374位核苷酸所示的DNA片段。
2.检测杏鲍菇菌种基因组中是否含有权利要求1中所述专用DNA条形码的物质在鉴别杏鲍菇菌种中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述物质为如下1)或2):
1)用于扩增所述专用DNA条形码的引物对;
2)含有所述引物对的PCR试剂或试剂盒。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于:所述引物对由引物1和引物2组成;所述引物1为序列表中序列1所示的单链DNA分子,所述引物2为序列表中序列2所示的单链DNA分子;
所述PCR试剂中,所述引物1和所述引物2的摩尔比为1:1,
所述引物1和所述引物2的浓度均为10 μmol/L。
5.一种鉴别或辅助鉴别杏鲍菇菌种的方法,包括如下步骤:检测待测样品中是否含有权利要求1中所述专用DNA条形码;如果含有,则待测样品为或候选为杏鲍菇菌种;如果不含有,则待测样品不为或候选不为杏鲍菇菌种。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:
所述检测待测样品中是否含有权利要求1中所述专用DNA条形码的方法包括如下步骤:
1)用序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成的引物对对待测样品进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;
2)测序所述PCR扩增产物,将所述PCR扩增产物的序列与所述专用DNA条形码进行比对,若同源性大于99%,则待测样品中含有所述专用DNA条形码,若同源性小于等于99%,则待测样品中不含有所述专用DNA条形码。
7.根据权利要求5或6所述的方法,其特征在于:
所述PCR扩增的模板为待测样品的基因组DNA。
8.检测杏鲍菇菌种基因组中是否含有权利要求1中所述专用DNA条形码的物质,其为如下1)或2):
1)用于扩增所述专用DNA条形码的引物对;
2)含有所述引物对的PCR试剂或试剂盒。
9.根据权利要求8所述的物质,其特征在于:
所述引物对由引物1和引物2组成;所述引物1为序列表中序列1所示的单链DNA分子,所述引物2为序列表中序列2所示的单链DNA分子;
所述PCR试剂中,所述引物1和所述引物2的摩尔比为1:1,
所述引物1和所述引物2的浓度均为10 μmol/L。
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