[发明专利]SNP标记及其应用、检测方法

说明书

本发明涉及生物技术领域，特别涉及SNP标记及其应用、检测方法。本发明采用全基因组测序对中国西域黑蜂大量个体进行全基因组测序，获得了中国西域黑蜂中21个特有的SNP信息，成为鉴定中国西域黑蜂的标志SNP位点。本发明提供的中国西域黑蜂蜜蜂特有的SNP位点在中国西方蜜蜂与其它地区西方蜜蜂的分化及中国西方蜜蜂对本地环境的适应性进化具有重要作用。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，特别涉及SNP标记及其应用、检测方法。

背景技术

我国蜜蜂饲养历史悠久，蜜蜂种质资源丰富，但是长久以来，我国境内仅发现存在东方蜜蜂，并无西方蜜蜂。东方蜜蜂采集能力稍次于西方蜜蜂，伴随着西方蜜蜂的引进，我国养蜂者越来越多的开始饲养西方蜜蜂，我国原生蜂种质资源受到威胁。如果能够在我国境内找到原生的西方蜜蜂对我国蜜蜂种质资源有着重要意义。中国蜜蜂种质资源委员会主任石巍老师与新疆自治区蜂业管理站工作人员一直从事加强对新疆原有伊犁黑蜂保护的工作，经过多年的努力，首次在中国新疆伊犁境内发现欧洲黑蜂自然种群，并且与目前国际上已知的西方蜜蜂亚种至少存在9万年的分化，证明中国也是西方蜜蜂的原产地，结束了我国没有西方蜜蜂自然种群分布的历史，这在畜禽资源研究方面具有很大的突破性意义。中国西域黑蜂个体较大、越冬性能好、抗逆性强、抗螨能力十分突出，而且蜂王产卵力强，能维持强群和蜂群极大的采集能力，既可作为推广普及的新品种，也可以作为育种素材，作进一步的深入育种研究，具有很好的发展前景。

中国发现西方蜜蜂，在国内外产生了较大的影响，为了更加深入的保护中国西域黑蜂，有效的利用中国西域黑蜂为我国蜜蜂育种工作服务，在“蜂产业技术体系”“物种资源保护”等课题的资助下，我们对中国西域黑蜂的研究工作取得突破性进展，利用全基因组重测序技术鉴定了中国西域黑蜂特有的21个SNP位点。

全基因组测序，即对一种生物的基因组中的全部基因进行测序，测定其DNA的碱基序列。全基因组测序覆盖面广，能检测个体基因组中的全部遗传信息，准确性高。每个个体从受精卵开始就继承了父母的DNA遗传信息，并且携带一生，不易改变。全基因组测序就是通过运用新一代高通量DNA测序仪，进行10-20倍覆盖率的个体全基因组测序，然后与该物种基因组精确图谱比较，得到完整的个体全基因组序列，破译个体全部的遗传信息的过程。全基因组重测序的个体，通过序列比对，可以找到特定物种(品种)特有的大量的单核苷酸多态性(SNP)位点。

目前，研究人员通常采用线粒体DNA的SNP位点信息来鉴定蜂种信息。线粒体DNA的SNP位点检测方法是首先提取个体基因组DNA，然后进行线粒体DNA的PCR扩增，进而测序，获得线粒体DNA序列SNP信息。

目前存在的技术问题：

(1)SNP位点信息少；

(2)蜂种鉴别准确性低；

(3)具有片面性。

发明内容

有鉴于此，本发明提供了SNP标记及其应用、检测方法。本发明采用全基因组测序对中国西域黑蜂大量个体进行全基因组测序，获得了中国西域黑蜂中21个特有的SNP信息，成为鉴定中国西域黑蜂的标志SNP位点。

为了实现上述发明目的，本发明提供以下技术方案：

本发明提供了一种SNP标记，其特征在于如下所示：

本发明还提供了所述SNP标记在物种鉴定中的应用；所述物种为中国西域黑蜂。

本发明还提供了所述SNP标记在中国西域黑蜂分子标记辅助育种中的应用。

本发明还提供了所述SNP标记在物种资源遗传多样性中的应用。

本发明还提供了所述SNP标记在物种适应性进化中的应用。