[发明专利]一种鱼肠道弧菌的LAMP检测方法在审
| 申请号: | 201610045022.9 | 申请日: | 2016-01-22 |
| 公开(公告)号: | CN105755115A | 公开(公告)日: | 2016-07-13 |
| 发明(设计)人: | 周顺;高志鑫;张敏 | 申请(专利权)人: | 青岛农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/63 |
| 代理公司: | 北京市诚辉律师事务所 11430 | 代理人: | 唐宁 |
| 地址: | 266109 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 肠道 弧菌 lamp 检测 方法 | ||
1.鱼肠道弧菌LAMP检测方法,其特征在于包括下述步骤
(1)根据鱼肠道弧菌LuxR基因,设计并合成以下两对引物:
FIP引物:5’-AAGCGTAACCATGCCGCCAC-TACGCGTGGTGTCTATAGCA-3’
BIP引物:5’-AGTTCAGCCATGAAGTTGGGCA-TGGTTTATGAATTGCCCCCT-3’
F3引物:5’-TTTGCCGCTCAGCTAACC-3’
B3引物:5’-CCCAACCCCAAGTTGAGTT-3’
(2)配制LAMP反应体系
反应体系的终浓度为:外引物F3和B3各5pmol/μl,内引物FIP和BIP各20pmol/μl,dNTP0.25mM,Tris-Cl20mM,KCl10mM,(NH4)2SO410mM,MgSO44mM,0.1%TritonX-100,8UBstDNA聚合酶和1μlDNA模板,加双蒸水使反应体系总体积达到25μl。
(3)LAMP反应体系扩增:将上述反应体系进行扩增反应,反应温度58℃到65℃,反应时间为30min到90min.
(4)扩增产物检测:2%琼脂糖凝胶电泳;产物加入SYBRGreenI,观察反应管中颜色变化。
2.如权利要求1所叙述的鱼肠道弧菌LAMP检测方法,其特征在于步骤3中的最适反应温度是64℃,反应时间45min。
3.一种用于鱼肠道弧菌LAMP检测的引物组,其包括以下四条引物:
FIP引物:5’-AAGCGTAACCATGCCGCCAC-TACGCGTGGTGTCTATAGCA-3’
BIP引物:5’-AGTTCAGCCATGAAGTTGGGCA-TGGTTTATGAATTGCCCCCT-3’
F3引物:5’-TTTGCCGCTCAGCTAACC-3’
B3引物:5’-CCCAACCCCAAGTTGAGTT-3’。
4.一种用于鱼肠道弧菌LAMP检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求3所述特异性寡核苷酸引物组、10×反应缓冲液、dNTP、BstDNA聚合酶8U/μl。
5.如权利要求5所述的试剂盒,其特征在于所述10×反应缓冲液包含:Tris-Cl200mM,KCl100mM,(NH4)2SO4100mM,MgSO420mM,1%TritonX-100。
6.如权利要求4或5所述的试剂盒,其特征在于所述试剂盒还包括SYBRGreenI显色液、阴性对照、和/或阳性对照。
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