[发明专利]一种人体肠道十大优势菌定量检测试剂盒在审

专利信息
申请号: 201610040729.0 申请日: 2016-01-21
公开(公告)号: CN105506137A 公开(公告)日: 2016-04-20
发明(设计)人: 徐威;郑杰 申请(专利权)人: 浙江同创医学检验中心有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/10;C12Q1/04
代理公司: 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 代理人: 汤东凤
地址: 310000 浙江省杭州*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 人体 肠道 优势 定量 检测 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种人体肠道十大优势菌定量检测试剂盒,其特征在于,包括标本采集管、厚壁管、 BufferA、10%SDS、2*SybGreenPCR预混液、标准品、阴性质控品和阳性质控品,所述标本 采集管有50支,规格为500±50mg,内含2ml粪便DAN稳定剂;所述厚壁管有50支,规格为2ml; 所述BufferA有1瓶,规格为500ml,其主要成分为氯化钠和Tris-Hcl;所述10%SDS有一支, 规格为10ml,其主要成分为10%十二烷基硫酸钠;所述2*SybGreenPCR预混液有10份,规格 为1200ul/管,其主要成分为反应缓冲液、SybGreen荧光染料、DNTPs、引物;所述标准品有10 支,规格为1011拷贝数/每支,标准品内含人工构建的质粒;所述阴性质控品有2份,规格为 500ul/管,其主要成分为生理盐水;所述阳性质控品有10分,规格为500ul/管,其主要成分 为已知拷贝数的灭活的克隆菌培养液;所述试剂盒在使用时需准备无水乙醇、酚、酚-氯仿- 异戊醇、氯仿-异戊醇以及样本均质器和离心机。

2.根据权利要求1所述的人体肠道十大优势菌定量检测试剂盒,其特征在于,其使用步 骤方法为:

(1)样本采集:

使用样品采集托盘留取好粪便;旋下样本采集管管帽,取出与管帽相连接的定量采集 器;将采集器下端垂直于样品采集托盘中的粪便按压几次,确认粪便充满整个采集器;将采 集器放回样品采集管,旋紧管帽;按压管帽上部突出装置,使粪便掉入管体下部DNA保存液 中,然后剧烈晃动几次,确保混匀;贴上相应信息标签,完成采样;

样本处理与DNA提取:

称量0.3g硅胶珠(直径0.1mm)加入厚壁管中;将粪便标本从采集管中转移到厚壁管中 (体积大概为1.2ml),加入BufferA400ul,同时加入酚150ul;样品均质器击打两次;放入- 80℃冰箱中10min,随后60℃温浴2min,混匀;冻融后冰上放置1min;加入110ul10%SDS冰 上放置10min;混合液加入150ul氯仿-异戊醇(v/v,24:1),15g,离心5min取上清;上清分别 用等体积的酚、酚-氯仿-异戊醇(v/v,25:24:1)、氯仿-异戊醇(v/v,24:1)各抽提2次、2次、1 次,每次均15g离心5min取上清;氯仿-异戊醇抽提之后,上清加入1/10体积的醋酸钠(3M, pH5.2);用2倍体积的无水乙醇沉淀过夜;沉淀过夜之后,15g离心10min后,真空干燥或者于 烘箱干燥10min,溶于300ul无菌水中;

PCR扩增:

取N个(N=阴性质控品+待测样本+阳性质控品)PCR反应管,每管分别加入2×SybGreen PCR预混液反应液10ul、引物1.2ul(上、下游引物分别为0.6ul)、ROX0.5ul、去离子水 7.3ul、模板1ul(也可按照每人份的用量,计算2×SybGreenPCR预混液、引物、ROX、去离子 水各自所需总量,三者混匀后分装19ul于单个PCR反应管中);于上述PCR反应管中分别加入 处理后的阴性质控品、待测样本混浊液(请吸打混匀后吸取)、阳性质控品及标准品1ul 3000rpm离心30秒,放入PCR扩增仪;设置循环条件为,94℃3分钟,1个循环;93℃15秒→60℃ 45秒,40个循环(每个循环结束后读取反应管的荧光值);设置完成后,保存文件,运行程序;

结果换算:

报告所定义的值=定量检测结果/该样本DNA浓度,即为每ng粪便微生物总DNA中所含 待测菌的DNA拷由贝数。

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