[发明专利]一种乳腺癌病理学图像有丝分裂核自动分割方法有效
申请号: | 201610040330.2 | 申请日: | 2016-01-21 |
公开(公告)号: | CN105719294B | 公开(公告)日: | 2018-09-25 |
发明(设计)人: | 梁毅雄;陈再良;廖胜辉;王磊;向遥;郭璠;邹北骥 | 申请(专利权)人: | 中南大学 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/136;G06T7/194 |
代理公司: | 长沙市融智专利事务所 43114 | 代理人: | 龚燕妮 |
地址: | 410083 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 乳腺癌 病理学 图像 有丝分裂 自动 分割 方法 | ||
1.一种乳腺癌病理学图像有丝分裂核自动分割方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1:对待分割的原始图像进行高斯平滑处理,获得平滑图像;
步骤2:从平滑图像中提取r(x,y),g(x,y),b(x,y)通道,按以下公式计算获得BR图像;
步骤3:利用不同尺度的LoG滤波器对BR图像进行卷积滤波,以每个像素点的最大响应作为滤波图像L(x,y);
步骤4:采用Otsu算法计算滤波图像的二值化阈值T,利用二值化阈值T对滤波图像进行前景和背景分割,获得标记图M(x,y);
步骤5:以标记图中值为0或2的像素对应在待分割的原始图中的像素作为背景像素,待分割的原始图中的其余像素为前景像素,利用背景像素集与前景像素集分别训练前景颜色模型p(z;θf)和背景颜色模型p(z;θb);
步骤6:根据待分割的原始图像I(x,y)、标记图M(x,y)、前景颜色高斯模型和背景颜色高斯模型构建s-t图G={V,E},采用最大流的方法计算s-t图G的最小割,并用最小割对s-t图G进行分割,更新标记图M(x,y);
步骤7:返回步骤5,重新训练前景和背景颜色模型,更新s-t图G中边的权重,计算最大流对s-t图G进行分割,进而更新M(x,y)直到满足迭代中止条件,进入步骤8;
步骤8:对最新的标记图中每个像素与1进行“与”位运算,得到二值分割结果图;
对所述步骤4中的标记图M(x,y)按以下公式进行计算:
所述构建的s-t图G={V,E},其中,V为节点集合,包含待分割的原始图像中的所有像素点以及一个前景标识点和一个背景标识点,共W×H+2个节点;
E为边的集合,包含相邻边和关系边;
其中,W和H分别表示待分割的原始图像的宽度和高度;
其中,所述相邻边是指每个像素点与其四邻域像素的连接边,共2×[4×W×H-3×(W+H)+2]条边;所述关系边是指每个像素分别到前景标识点和背景标识点的连接边,共2×W×H条边;
相邻边的权重按公式计算获得;
其中,zi,zj∈R3分别表示相邻像素i和j的颜色RGB矢量,参数γ=40,参数β则由下式计算:
关系边的权重按以下公式计算获得:
ωb(x,y)=-log(p(z;θf)),
其中,ωf(x,y)和ωb(x,y)分别表示像素(x,y)到前景标识点和背景标识点的权重,参数λ=9γ。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述前景颜色模型p(z;θf)和背景颜色模型p(z;θb)按以下过程获得:
首先,采用K均值算法分别对前景像素和背景像素进行聚类,获得前景颜色模型的聚类结果数量为Kf,背景颜色模型的聚类结果数量为Kb;
其次,用聚类结果来初始化训练前景高斯模型和背景高斯模型:
前景高斯模型:
背景高斯模型:
其中,表示第k个高斯分布模型,πk、μk和∑k分别为该高斯分布模型的先验概率、均值和协方差矩阵,N表示所有用于训练模型的像素的个数,Nk表示属于第k类像素的个数,zT表示矢量z的转置;
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤6中用最小割对图G进行分割,更新标记图M(x,y)是指将像素分割成前景点和背景点两类,然后按照以下规则更新标记图:
M(x,y)=2,if节点(x,y)属于背景点。
4.根据权利要求1-3任一项所述的方法,其特征在于,采用9×9大小的结构元素对步骤8获得的分割结果进行形态学开操作,得到最终的分割结果图。
5.根据权利要求1-3任一项所述的方法,其特征在于,所述步骤2中不同尺度的LoG滤波器的尺度取值依次为20,21,22。
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