[发明专利]对治疗性化合物敏感性降低的乙型肝炎变异株、变异株的检测及其用途在审
申请号: | 201610030881.0 | 申请日: | 2009-04-03 |
公开(公告)号: | CN105648110A | 公开(公告)日: | 2016-06-08 |
发明(设计)人: | 陈继明;陈立怡;黎青龙;袁孟峰 | 申请(专利权)人: | 香港大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 彭昶 |
地址: | 中国香港*** | 国省代码: | 中国香港;81 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 治疗 化合物 敏感性 降低 乙型肝炎 变异 检测 及其 用途 | ||
1.HBV基因组中的寡核苷酸组在制备用于测定HBV的基因型的试剂盒中的用途,其中所述寡核苷酸组包括以下基因型的核苷酸:基因型A:T451和T586;基因型B:A321、T324和G408;基因型C:A491和G633;基因型D:T289、A290和T867;基因型E:C705、C706、T837、C840和C843;基因型F:A628、T837和A838;基因型G:T306、T936和G939;以及基因型H:T493、A494、A838、A840、G841和C842。
2.权利要求1的用途,所述试剂盒还用于测定从患者生物样品中提取的HBV是否对LMV、ADV和/或对其它核苷/核苷酸类似物、干扰素或其它抗HBV药剂或其组合的敏感性下降,并且其中所述寡核苷酸组还包括编码HBVDNA聚合酶中的以下的突变的核苷酸:rtL80I、rtL82M、rtF166L、rtQ215S和rtM204I/V/S+/-rtL180M。
3.权利要求1的用途,所述试剂盒还用于测定从患者生物样品中提取的HBV是否对LMV、ADV和对其它核苷/核苷酸类似物、干扰素和/或其它抗HBV药剂或其组合的敏感性下降,并且其中所述寡核苷酸组还包括编码HBV核心启动子和/或前核心区中的选自以下的突变的核苷酸:A1752G/T、T1753C、T1754C、C1856T、C1862T、G1898A和G1899A。
4.权利要求1的用途,所述试剂盒还用于测定HBV对抗体的反应性例如疫苗逃逸、免疫球蛋白疗法逃逸或抗HBV血清学检测逃逸或其组合是否降低的试剂盒中的用途,并且其中所述寡核苷酸组还包括编码HBV包膜蛋白中的选自以下的突变的核苷酸:sQ101、sL104、sC107、sS/T114、sT115、sT116、sC121、sK/R122、sT123、sC124、sI/T126、sQ129、sG130、sN/T131、sF/Y134、sP135、sS136、sC137、sC138、sC139、sT/S140、sK141、sP142、sN146、sC147、sT148、sP153、sS154、sS155、sA157、sF/L158、sA/G159、sW163、sS167和sA/D168。
5.权利要求3的用途,其中所述寡核苷酸组包括编码所述核心启动子和/或前核心区中的突变的核苷酸,所述突变包括:A1752G/T、T1753C、T1754C、C1856T、C1862T、G1898A和G1899A。
6.权利要求4的用途,其中所述寡核苷酸组包括编码HBV包膜蛋白中的突变的核苷酸,所述突变包括:sQ101、sL104、sC107、sS/T114、sT115、sT116、sC121、sK/R122、sT123、sC124、sI/T126、sQ129、sG130、sN/T131、sF/Y134、sP135、sS136、sC137、sC138、sC139、sT/S140、sK141、sP142、sN146、sC147、sT148、sP153、sS154、sS155、sA157、sF/L158、sA/G159、sW163、sS167和sA/D168。
7.权利要求1-6中任一项的用途,其中所述试剂盒同时检测HBV变异株的多个突变和/或基因型,其中可用肉眼观察结果。
8.权利要求7的用途,其中所述试剂盒包含:
a)寡核苷酸阵列,用于分析含有可变序列的靶序列;
b)具有足够大小和间距的斑点的阵列,可供肉眼观测各个斑点;和
c)含有生物素标记的核苷酸和酶的反应试剂。
9.权利要求8的用途,其中所述酶是反转录酶或DNA聚合酶。
10.权利要求8的用途,其中延伸的每个寡核苷酸可通过由链霉抗生物素碱性磷酸酶或辣根过氧化物酶催化的比色反应来检测。
11.权利要求10的用途,其中在比色反应中的底物是BCIP/NBT或4-氯-1-萘酚。
12.一种用于检测HBV变异株的突变和/或基因型的试剂盒,其中所述试剂盒包含具有用于检测所述HBV变异株的突变和/或基因型的核苷酸序列的载玻片,其中所述核苷酸序列是权利要求1-6中任一项所使用的寡核苷酸组。
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