[发明专利]一种鉴定白菜A09染色体上的抗病毒病QTL—BrTuA09的分子标记及其应用有效
申请号: | 201610025560.1 | 申请日: | 2016-01-15 |
公开(公告)号: | CN105506130B | 公开(公告)日: | 2019-03-08 |
发明(设计)人: | 苏同兵;于拴仓;张凤兰;余阳俊;张德双;赵岫云;汪维红;卢桂香 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;白艳 |
地址: | 100097 北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 单链DNA分子 分子标记 种鉴定 染色体 白菜 分子标记辅助育种 抗病毒病 克隆基因 验证结果 病毒病 抗性 准确率 单株 可用 小种 应用 群体 | ||
1.一种鉴定或辅助鉴定待测大白菜品种对TuMV-C4病毒小种抗性的方法,是检测待测大白菜的基因型是CC基因型还是TT基因型还是TC基因型,根据所述大白菜的基因型确定所述大白菜品种对TuMV-C4病毒小种的抗性:TT基因型的大白菜品种对TuMV-C4病毒小种的抗性为感病,TC基因型的大白菜品种和CC基因型的大白菜品种对TuMV-C4病毒小种的抗性为抗病;
所述CC基因型为大白菜A09染色体上第9805886位的核苷酸为C的纯合体;
所述TT基因型为大白菜A09染色体上第9805886位的核苷酸为T的纯合体;
所述TC基因型为大白菜A09染色体上第9805886位的核苷酸为C和T的杂合体;
所述A09染色体上第9805886位的核苷酸基于的大白菜Brassica rapa pekinensis的参考全基因组序列的版本号为V1.5,下载地址为http://brassicadb.org/brad。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述检测待测大白菜的基因型是CC基因型还是TT基因型还是TC基因型的方法为如下A)或B):
A)直接测序大白菜的基因组DNA;
B)测序含有大白菜A09染色体上第9805886位脱氧核糖核苷酸的PCR扩增产物;
所述PCR扩增产物所用的引物为由序列表中序列2所示的单链DNA分子、序列表中序列3所示的单链DNA分子和序列表中序列4所示的单链DNA分子组成的成套引物A。
3.检测大白菜A09染色体上第9805886位的脱氧核糖核苷酸的物质的应用,其特征在于:
所述A09染色体上第9805886位的脱氧核糖核苷酸基于的大白菜Brassica rapapekinensis的参考全基因组序列的版本号为V1.5,下载地址为
所述物质为如下1)或2)或3):
1)由序列表中序列2所示的单链DNA分子、序列表中序列3所示的单链DNA分子和序列表中序列4所示的单链DNA分子组成的成套引物A;
2)含有1)所述的成套引物A的PCR试剂;
3)含有1)所述的成套引物A或2)所述的PCR试剂的试剂盒;
所述应用为如下a)-f)中的任意一种:
a)在鉴定或辅助鉴定待测大白菜品种对TuMV-C4病毒小种抗性中的应用;
b)在制备鉴定或辅助鉴定待测大白菜品种对TuMV-C4病毒小种抗性的产品中的应用;
c)在大白菜育种中的应用;
d)在制备辅助大白菜育种的产品中的应用;
e)在选育抗TuMV-C4病毒小种的大白菜中的应用;
f)在制备选育抗TuMV-C4病毒小种的大白菜的产品中的应用。
4.一种鉴定或辅助鉴定待测大白菜品种对TuMV-C4病毒小种抗性的产品,为检测大白菜A09染色体上第9805886位的脱氧核糖核苷酸的物质;
所述A09染色体上第9805886位的脱氧核糖核苷酸基于的大白菜Brassica rapapekinensis的参考全基因组序列的版本号为V1.5,下载地址为http://brassicadb.org/brad;
所述检测大白菜A09染色体上第9805886位的脱氧核糖核苷酸的物质为如下1)或2)或3):
1)由序列表中序列2所示的单链DNA分子、序列表中序列3所示的单链DNA分子和序列表中序列4所示的单链DNA分子组成的成套引物A;
2)含有1)所述的成套引物A的PCR试剂;
3)含有1)所述的成套引物A或2)所述的PCR试剂的试剂盒。
5.一种选育抗TuMV-C4病毒小种的大白菜品种的方法,包括选择TC基因型的大白菜品种或CC基因型的大白菜品种进行育种;
所述CC基因型为大白菜A09染色体上第9805886位的核苷酸为C的纯合体;
所述TC基因型为大白菜A09染色体上第9805886位的核苷酸为C和T的杂合体;
所述A09染色体上第9805886位的脱氧核糖核苷酸基于的大白菜Brassica rapapekinensis的参考全基因组序列的版本号为V1.5,下载地址为http://brassicadb.org/brad。
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