[发明专利]同时定量南美白对虾中两种致病菌活菌的方法在审
申请号: | 201610016285.7 | 申请日: | 2016-01-12 |
公开(公告)号: | CN105543367A | 公开(公告)日: | 2016-05-04 |
发明(设计)人: | 赵勇;肖莉莉;张昭寰;娄阳;杜苏萍;潘迎捷 | 申请(专利权)人: | 上海海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/63;C12R1/42 |
代理公司: | 上海伯瑞杰知识产权代理有限公司 31227 | 代理人: | 曹莉 |
地址: | 201306 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 同时 定量 南美 对虾 中两种 致病菌 方法 | ||
1.一种同时定量南美白对虾中两种致病菌活菌的方法,其特征在于,所述 方法包括如下步骤:
S1、将叠氮溴化丙锭母液加入待测的南美白对虾虾液匀浆中,获得叠氮溴化 丙锭-样品混合液;暗处理后曝光,高速离心,收集菌体;
S2、对所述菌体进行DNA提取;
S3、以提取得到的DNA为模板,以副溶血性弧菌的tlh基因和沙门氏菌的 orgC基因作为靶基因,进行多重荧光定量PCR扩增反应,输出相应的循环阈值;
S4、将所述循环阈值分别与副溶血性弧菌标准曲线、沙门氏菌标准曲线进行 对照,获得副溶血性弧菌和沙门氏菌的活菌浓度。
2.根据权利要求1所述的同时定量南美白对虾中两种致病菌活菌的方法, 其特征在于,步骤S1中,所述叠氮溴化丙锭母液的制备包括:每1mg叠氮溴化 丙锭溶解于980μLddH2O中获得2mM的母液,并于-20℃下避光保存。
3.根据权利要求1所述的同时定量南美白对虾中两种致病菌活菌的方法, 其特征在于,步骤S1中,所述南美白对虾虾液匀浆是在每225ml蛋白胨水中加 入25g生鲜南美白对虾,均质处理2~5min而得。
4.根据权利要求1所述的同时定量南美白对虾中两种致病菌活菌的方法, 其特征在于,步骤S1中,所述叠氮溴化丙锭-样品混合液中叠氮溴化丙锭的浓度 为100μM,暗处理的时间为15~20min,曝光的时间为15~20min。
5.根据权利要求1所述的同时定量南美白对虾中两种致病菌活菌的方法, 其特征在于,步骤S2中,所述提取是按照天根细菌基因组DNA提取试剂盒的说 明书进行的。
6.根据权利要求1所述的同时定量南美白对虾中两种致病菌活菌的方法, 其特征在于,步骤S3中,所述多重荧光定量PCR扩增反应采用的副溶血性弧菌 正引物的序列如SEQIDNO.1所示,副溶血性弧菌反引物的序列如SEQIDNO.2 所示,沙门氏菌正引物的序列如SEQIDNO.3所示,沙门氏菌反引物的序列如 SEQIDNO.4所示。
7.根据权利要求1所述的同时定量南美白对虾中两种致病菌活菌的方法, 其特征在于,步骤S3中,所述多重荧光定量PCR扩增反应中,副溶血性弧菌探 针标记FAM作为报告基团,其序列如SEQIDNO.5所示;沙门氏菌探针标记HEX 作为报告基团,其序列如SEQIDNO.6所示。
8.根据权利要求1、6或7所述的同时定量南美白对虾中两种致病菌活菌的 方法,其特征在于,所述多重荧光定量PCR扩增反应体系为每20μL,包括2μ L10×PCRBuffer、1.2μL浓度为50mM的MgSO4溶液、0.5μL浓度为10mM 的dNTPsmix溶液、0.2μL浓度为5U/μL的TaqDNA聚合酶、0.5μL浓度 为10μM的副溶血性弧菌正引物和反引物、0.5μL浓度为10μM的沙门氏菌 正引物和反引物、0.2μL浓度为10μM的副溶血性弧菌探针、0.2μL浓度为 10μM的沙门氏菌探针、DNA模板1μL以及ddH2O12.7μL。
9.根据权利要求1所述的同时定量南美白对虾中两种致病菌活菌的方法, 其特征在于,所述多重荧光定量PCR扩增反应的条件为:95℃预变性2min,95℃ 变性15s,60℃退火1min,进行40个循环。
10.根据权利要求1所述的同时定量南美白对虾中两种致病菌活菌的方法, 其特征在于,步骤S4中,所述副溶血性弧菌标准曲线是以已知副溶血性弧菌活 菌浓度的南美白对虾虾液匀浆为对象,利用其菌落计数的结果和多重荧光定量 PCR输出的Ct值构建的标准曲线;所述沙门氏菌标准曲线是以已知沙门氏菌活 菌浓度的南美白对虾虾液匀浆为对象,利用其菌落计数的结果和多重荧光定量 PCR输出的Ct值构建的标准曲线。
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