[发明专利]用于果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测的引物及其应用在审
| 申请号: | 201510422771.4 | 申请日: | 2015-07-17 |
| 公开(公告)号: | CN105154523A | 公开(公告)日: | 2015-12-16 |
| 发明(设计)人: | 王周利;蔡瑞;岳田利;袁亚宏 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
| 代理公司: | 西安恒泰知识产权代理事务所 61216 | 代理人: | 李郑建;孙雅静 |
| 地址: | 712100 陕*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 果汁 中脂环酸 芽孢 杆菌 pcr 检测 引物 及其 应用 | ||
技术领域
本发明属于食品微生物检测技术领域,具体涉及用于果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测的引物及其应用。
背景技术
脂环酸芽孢杆菌(Alicylobacillusspp.)是一类嗜酸、耐热的革兰氏阳性芽孢杆菌的统称,杆状、产芽孢,且严格需氧。这类细菌可以生长的pH值范围为2.0-6.0,最适pH值为3.0-5.0;可以生长的温度范围为20-60℃,最适生长温度为45-50℃。由于这类细菌可以耐受普通的巴氏杀菌,可以在低pH值及高温条件下存活甚至生长,因此这类细菌也称为“嗜酸耐热菌”。脂环酸芽孢杆菌可以在果汁中生长代谢产生愈创木酚、2,6-二溴苯酚、2,6-二氯苯酚等物质,使果汁的口感、风味变差并形成白色沉淀或雾状浑浊。因此,脂环酸芽孢杆菌是果汁产业中关键的质量安全因子之一,对果汁的生产加工及出口贸易构成了严重威胁。
目前,国际通用的脂环酸芽孢杆菌检测方法依然是培养法,虽然其简单易于操作,但工作量大、耗时长、检测严重滞后于生产实际。同时,研究开发的常规PCR、TaqMan实时荧光定量PCR、傅里叶变换红外光谱和电子鼻等检测方法主要针对于A.acidoterrestris,且尚未真正应用于食品工业实际样本的分析。因此,适用于脂环酸芽孢杆菌快速检测的方法较少,研究建立高效、快速的检测方法,及时识别与发现果汁中脂环酸芽孢杆菌污染,切实保障果汁品质及质量安全,一直是工业化生产和科研工作者研究的热点。
发明内容
针对现有技术中的缺陷和不足,本发明设计了一种用于果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测的引物,并将其应用在果汁中脂环酸芽孢杆菌的SYBRGreenI荧光定量PCR检测方法中。
为了实施上述目标,本发明采用的主要技术方案如下:
一种用于果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测的引物,该引物根据脂环酸芽孢杆菌16SrDNA基因序列的保守区域设计获得,该引物包括上游引物序列SEQIDNO.1和下游引物序列SEQIDNO.2;
所述的上游引物序列SEQIDNO.1为5’-ATGCGTAGATATGTGGAGGA-3’;
所述的下游引物序列SEQIDNO.2为5’-CAGGCGGAGTGCTTATTG-3’。
所述的引物在果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测中的应用。
具体的,所述的果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测为果汁中脂环酸芽孢杆菌的SYBRGreenI荧光定量PCR检测。
更具体的,检测方法包括采用免疫磁性分离技术进行果汁样品的预处理,然后利用权利要求1中的引物进行果汁样品中脂环酸芽孢杆菌的SYBRGreenI荧光定量PCR检测。
再具体的,所述的SYBRGreenI荧光定量PCR检测方法的模板为脂环酸芽孢杆菌样品总DNA,SYBRGreenI荧光定量PCR检测方法的反应体系包括无菌超纯水、SYBRGreenIPremixEx-TaqTM、上游引物序列SEQIDNO.1、下游引物序列SEQIDNO.2和脂环酸芽孢杆菌样品总DNA。
进一步的,所述的反应体系包括12.5μL的SYBRGreenIPremixEx-TaqTM、0.5μL的浓度为10μM上游引物SEQIDNO.1、0.5μL的浓度为10μM下游引物SEQIDNO.2、1.0μL的脂环酸芽孢杆菌样品总DNA和10.5μL的无菌超纯水。
一种用于果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测的试剂盒,该试剂盒中含有权利要求1所述的上游引物序列SEQIDNO.1和下游引物序列SEQIDNO.2。
与现有技术相比,本发明的优点为:
本发明对脂环酸芽孢杆菌中10个不同属共15个种的16SrDNA基因序列进行比较,并设计了基于脂环酸芽孢杆菌保守区域的引物。通过软件评价和对实际菌株的检测,说明获得的引物和建立的方法具有非常好的扩增特异性。本发明建立的SYBRGreenI荧光定量PCR检测方法灵敏度高、特异性强,可以简单快速的判断样品中是否含有脂环酸芽孢杆菌,具有非常广阔的应用前景。
附图说明
图1是对脂环酸芽孢杆菌进行16SrDNA基因序列分析,在此基础上进行引物设计(以A.acidoterrestrisDSM-3923为例,其中,→为上游引物FP,←为下游引物RP);
图2是SYBRGreenI荧光定量PCR的特异性评价结果图;图2(A)和图2(B)分别表示不同种菌体的PCR扩增曲线和熔解曲线图;
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