[发明专利]用于果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测的引物及其应用在审

专利信息
申请号: 201510422771.4 申请日: 2015-07-17
公开(公告)号: CN105154523A 公开(公告)日: 2015-12-16
发明(设计)人: 王周利;蔡瑞;岳田利;袁亚宏 申请(专利权)人: 西北农林科技大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01
代理公司: 西安恒泰知识产权代理事务所 61216 代理人: 李郑建;孙雅静
地址: 712100 陕*** 国省代码: 陕西;61
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摘要:
搜索关键词: 用于 果汁 中脂环酸 芽孢 杆菌 pcr 检测 引物 及其 应用
【说明书】:

技术领域

发明属于食品微生物检测技术领域,具体涉及用于果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测的引物及其应用。

背景技术

脂环酸芽孢杆菌(Alicylobacillusspp.)是一类嗜酸、耐热的革兰氏阳性芽孢杆菌的统称,杆状、产芽孢,且严格需氧。这类细菌可以生长的pH值范围为2.0-6.0,最适pH值为3.0-5.0;可以生长的温度范围为20-60℃,最适生长温度为45-50℃。由于这类细菌可以耐受普通的巴氏杀菌,可以在低pH值及高温条件下存活甚至生长,因此这类细菌也称为“嗜酸耐热菌”。脂环酸芽孢杆菌可以在果汁中生长代谢产生愈创木酚、2,6-二溴苯酚、2,6-二氯苯酚等物质,使果汁的口感、风味变差并形成白色沉淀或雾状浑浊。因此,脂环酸芽孢杆菌是果汁产业中关键的质量安全因子之一,对果汁的生产加工及出口贸易构成了严重威胁。

目前,国际通用的脂环酸芽孢杆菌检测方法依然是培养法,虽然其简单易于操作,但工作量大、耗时长、检测严重滞后于生产实际。同时,研究开发的常规PCR、TaqMan实时荧光定量PCR、傅里叶变换红外光谱和电子鼻等检测方法主要针对于A.acidoterrestris,且尚未真正应用于食品工业实际样本的分析。因此,适用于脂环酸芽孢杆菌快速检测的方法较少,研究建立高效、快速的检测方法,及时识别与发现果汁中脂环酸芽孢杆菌污染,切实保障果汁品质及质量安全,一直是工业化生产和科研工作者研究的热点。

发明内容

针对现有技术中的缺陷和不足,本发明设计了一种用于果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测的引物,并将其应用在果汁中脂环酸芽孢杆菌的SYBRGreenI荧光定量PCR检测方法中。

为了实施上述目标,本发明采用的主要技术方案如下:

一种用于果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测的引物,该引物根据脂环酸芽孢杆菌16SrDNA基因序列的保守区域设计获得,该引物包括上游引物序列SEQIDNO.1和下游引物序列SEQIDNO.2;

所述的上游引物序列SEQIDNO.1为5’-ATGCGTAGATATGTGGAGGA-3’;

所述的下游引物序列SEQIDNO.2为5’-CAGGCGGAGTGCTTATTG-3’。

所述的引物在果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测中的应用。

具体的,所述的果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测为果汁中脂环酸芽孢杆菌的SYBRGreenI荧光定量PCR检测。

更具体的,检测方法包括采用免疫磁性分离技术进行果汁样品的预处理,然后利用权利要求1中的引物进行果汁样品中脂环酸芽孢杆菌的SYBRGreenI荧光定量PCR检测。

再具体的,所述的SYBRGreenI荧光定量PCR检测方法的模板为脂环酸芽孢杆菌样品总DNA,SYBRGreenI荧光定量PCR检测方法的反应体系包括无菌超纯水、SYBRGreenIPremixEx-TaqTM、上游引物序列SEQIDNO.1、下游引物序列SEQIDNO.2和脂环酸芽孢杆菌样品总DNA。

进一步的,所述的反应体系包括12.5μL的SYBRGreenIPremixEx-TaqTM、0.5μL的浓度为10μM上游引物SEQIDNO.1、0.5μL的浓度为10μM下游引物SEQIDNO.2、1.0μL的脂环酸芽孢杆菌样品总DNA和10.5μL的无菌超纯水。

一种用于果汁中脂环酸芽孢杆菌PCR检测的试剂盒,该试剂盒中含有权利要求1所述的上游引物序列SEQIDNO.1和下游引物序列SEQIDNO.2。

与现有技术相比,本发明的优点为:

本发明对脂环酸芽孢杆菌中10个不同属共15个种的16SrDNA基因序列进行比较,并设计了基于脂环酸芽孢杆菌保守区域的引物。通过软件评价和对实际菌株的检测,说明获得的引物和建立的方法具有非常好的扩增特异性。本发明建立的SYBRGreenI荧光定量PCR检测方法灵敏度高、特异性强,可以简单快速的判断样品中是否含有脂环酸芽孢杆菌,具有非常广阔的应用前景。

附图说明

图1是对脂环酸芽孢杆菌进行16SrDNA基因序列分析,在此基础上进行引物设计(以A.acidoterrestrisDSM-3923为例,其中,→为上游引物FP,←为下游引物RP);

图2是SYBRGreenI荧光定量PCR的特异性评价结果图;图2(A)和图2(B)分别表示不同种菌体的PCR扩增曲线和熔解曲线图;

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