[发明专利]绿壳蛋鸡啄羽相关基因检测用试剂盒及其实现方法在审
申请号: | 201510420030.2 | 申请日: | 2015-07-17 |
公开(公告)号: | CN104975097A | 公开(公告)日: | 2015-10-14 |
发明(设计)人: | 姚俊峰;王晓亮;杨长锁;王敏 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海交达专利事务所 31201 | 代理人: | 王毓理;王锡麟 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 蛋鸡 相关 基因 检测 试剂盒 及其 实现 方法 | ||
1.一种绿壳蛋鸡啄羽相关基因检测用试剂盒,其特征在于,包括:
1)用于PCR扩增以检测rs13640917基因用的引物对,即上游引物U和下游引物D,其中:
U如Seq ID No.1所示,即:5’‐CACAATGACCACGACAACG‐3’;
D如Seq ID No.2所示,即:5’‐ATCTCACGGAACCCAAATG‐3’;
2)限制性核酸内切酶AcuI,其序列为:
5’‐CTGAAG(N)16↓‐3’以及3’‐GACTTC(N)14↑‐5’
其中箭头所指位置为酶切位点,N表示任何碱基。
2.一种根据权利要求1所述试剂盒的实现方法,其特征在于,对待测鸡只的包括rs13640917C/T突变在内的基因组DNA为模板,采用所述引物进行PCR扩增,再用限制性核酸内切酶AcuI酶切所得的PCR扩增产物,电泳检测所得到的酶切产物并判断待测鸡只的rs13640917位的脱氧核糖核苷酸是野生型C或突变型T。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征是,所述的判断具体为:当电泳显示为两条带,即酶切产物为106bp和295bp两个片段,表示所述待测鸡只的基因型为CC,是野生型纯合体;当电泳显示为一条带,即酶切产物为401bp一个片段,表示所述待测鸡只的基因型为TT,是突变型纯合体;当电泳显示为三条带,即酶切产物为106bp、295bp及401bp三个片段,所述待测鸡只的基因型为CT,是杂合体。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征是,所述的PCR扩增,其扩增体系包括:鸡基因组DNA50ng、上、下游引物10pmol/L各0.3μL、Taq Mix7.5μL,并用ddH2O补充反应体系至15μL;PCR反应条件为:95℃变性5min;循环程序为95℃变性20s,60℃退火30s,72℃延伸30s,共35个循环;最后72℃延伸10min。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征是,所述的酶切,其反应体系包括:PCR反应混合物4μL、10×酶切缓冲液1μL、内切酶AcuI10U/μL0.4μL、ddH2O4.6μL,反应体系总体积10μL;通过恒温水浴37℃孵育1小时。
6.根据权利要求2所述的方法,其特征是,所述的电泳检测是指:对酶切产物进行1.5%琼脂糖凝胶电压8V/cm,时间30min的电泳,并通过凝胶成像系统观察结果。
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