[发明专利]基于DNA标签-PCR快速检测TGEV早期感染的方法在审
申请号: | 201510254430.0 | 申请日: | 2015-05-18 |
公开(公告)号: | CN104862417A | 公开(公告)日: | 2015-08-26 |
发明(设计)人: | 黄勇;童德文;赵晓民;邢娜;张秀娟 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京世誉鑫诚专利代理事务所(普通合伙) 11368 | 代理人: | 郭官厚 |
地址: | 712100 陕西*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 dna 标签 pcr 快速 检测 tgev 早期 感染 方法 | ||
1.一种基于DNA标签-PCR快速检测TGEV早期感染的方法,其特征在于,包括以下步骤:
Step1、制备TGEV特异性探针标记的磁性微粒MMP,所述TGEV特异性探针序列为:
5’NH2-T15CAAATATTTCGTTTAGTTCGAGTTGGTGTCCG;
Step2、制备TGEV特异性信号探针标记的纳米金颗粒AuNPs,所述特异性信号探针序列为:
5’SH-T15CGAATAGGAAGACTAGGCACGTTGACTTACTTGTACAGCTCG;
Step3、TGEV探针标记的MMP和AuNP与TGEV病毒RNA的杂交反应及目标DNA标签的洗脱:
3a、取500μl TGEV血清样本和100μl裂解液至1.5ml离心管中,煮沸15min使病毒RNA释放,4℃、12000rpm离心5min,取上清,所述裂解液:10mmol/L Tris-HC1,1mmol/L EDTA,15mmol/L NaCl,0.5%SDS,pH 8.0;
3b、在上述裂解上清中加入100μl、pH4.8的NaAc,再加入等体积异丙醇混匀,沉淀30min,12000rpm离心5min,去上清,加500μl75%乙醇洗涤2次,10μl TE缓冲液重悬病毒核酸,所述TE缓冲液:1M Tris buffer pH 8.0,1mM EDTA;
3c、取2μl标记后的磁性微粒MMP和10μl病毒核酸,加入17μl杂交缓冲液混匀,40℃杂交30min,杂交完毕后加入2μl标记后的纳米金颗粒AuNPs,混匀后50℃杂交40min,获得AuNP-MMP复合物,所述杂交缓冲液:5×SSC,0.1%Tween-20,0.2%SDS;
3d、每次取1ml TE缓冲液,洗2-3次,去除残留的杂交缓冲液、未结合的探针和DNA标签;
3e、用100μl新配置的DTT洗脱液与AuNP-MMP复合物在室温下作用10min,磁分离3min后取上清液,所述DTT洗脱液:0.5mol/L DTT,10mM Tris-HCl,1mM EDTA,pH 7.5;
3f、加入1/10体积的NaAc和2倍体积的无水乙醇,沉淀30min;
3g、4℃、12000rpm离心10min,弃上清,加入75%乙醇洗涤两次;
3h、4℃、12000rpm离心10min,弃上清,自然风干,加入3μl的H2O溶解DNA标签;
Step4、PCR检测与TGEV特异结合的DNA标签:
4a、以pEGFP-N1为模板,
上游引物F:ATAGCGGTTTGACTCACGGG,
下游引物R:CCCTTTGACGTTGGAGTCCA,
采用50μl体系:10×buffer 5μl,dNTP 4μl,上游引物1μl,下游引物1μl,Taq酶0.5μl,模板2μl,ddH2O 36.5μl,
反应程序如下:94℃预变性4min;94℃变性1min,56℃退火30s,72℃延伸105s,共30个循环;72℃延伸10min;
将pEGFP-N1扩增产物切胶回收,并浸泡到TE中4℃保存;
4b、以pEGFP-N1扩增产物和DNA标签为模板,
上游引物:AGCAGAAGAACGGCATCAAG,
下游引物:GCCATCTTGGCCAGATCCT,
采用25μl体系:10×buffer 2.5μl,dNTP2μl,上游引物0.5μl,下游引物0.5μl,Taq酶0.2μl,pEGFP-N1扩增产物0.5μl,纯化的DNA标签0.5μl,ddH2O 18.3μl,
反应程序如下:94℃预变性5min;94℃变性40s,57℃退火30s,72℃延伸30s,共30个循环;72℃延伸10min;
取25μl PCR扩增产物用1.0%的琼脂糖凝胶进行电泳并使用凝胶成像仪观察和记录结果。
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