[发明专利]基于实时荧光定量PCR的黔北麻羊FSHR基因组织表达谱的建立方法在审
申请号: | 201510244820.X | 申请日: | 2015-05-14 |
公开(公告)号: | CN104805214A | 公开(公告)日: | 2015-07-29 |
发明(设计)人: | 陈祥;龙威海;许厚强;冯文武;孙振梅;李鹏程 | 申请(专利权)人: | 贵州大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 贵阳中新专利商标事务所 52100 | 代理人: | 李亮;程新敏 |
地址: | 550025 贵州省贵*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 实时 荧光 定量 pcr 黔北麻羊 fshr 基因 组织 表达 建立 方法 | ||
1.一种基于实时荧光定量PCR的黔北麻羊FSHR基因组织表达谱的建立方法,其特征在于:采用Trizol法分别提取已屠宰的发情期产单羔和产双羔母羊的5种组织的总RNA,所述的5种组织包括下丘脑、垂体、卵巢、输卵管和子宫;并对提取的总RNA进行cDNA的反转录合成;以上述cDNA为模板,分别对FSHR和GAPDH进行常规PCR扩增;FSHR上游引物的序列为5’- CGAGTCATCCCAGAAGGAG-3’, FSHR下游引物的序列为5’- GGCAGGTTGGAGAACACATT- 3’; GAPDH上游引物的序列为5’ -CTGACCTGCCGCCTGGAGAAA -3’, GAPDH:下游引物的序列为5’ -GTAGAAGAGTGAGTGTCGCTT- 3’; 回收相应条带并与T-载体连接,转化DH5α感受态细胞,将鉴定为阳性的重组质粒进行测序,并将获得的重组质粒进行10倍比稀释后,将其作为模板,进行实时荧光定量PCR扩增,获得标准曲线;荧光定量PCR每个样品,并用ddH2O做阴性对照;采用2-△△Ct定量分析方法对山羊FSHR基因在发情期不同组织进行差异表达量分析,构建组织表达谱。
2.根据权利要求1所述的基于实时荧光定量PCR的黔北麻羊FSHR基因组织表达谱的建立方法,其特征在于:所述的对对FSHR和GAPDH进行常规PCR扩增时,PCR反应条件为:95 ℃预变性3 min;95 ℃变性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 min,34个循环;最后72 ℃延伸5 min,4 ℃保存;反应体系为20 μL:2×Taq PCR Master Mix 10 μL, DNA模板2 μL,上、下游引物各1.5 μL,加水至20 μL。
3.根据权利要求1所述的基于实时荧光定量PCR的黔北麻羊FSHR基因组织表达谱的建立方法,其特征在于:所述的回收相应条带并与T-载体连接,具体反应体系如下:胶回收的PCR产物3 μL;pUCm-T载体1 μL;10×Ligation Buffer 1 μL;50%PEG 4000 μl;Sterilized ddH2O 3 μl;T4 DNA Ligation 1 μL;混匀,16 ℃连接过夜。
4.根据权利要求1所述的基于实时荧光定量PCR的黔北麻羊FSHR基因组织表达谱的建立方法,其特征在于:所述的转化DH5α感受态细胞的转化步骤如下:取100 μL感受态细胞,置于冰上,完全解冻后将细胞均匀悬浮;将上述的连接液全部加入感受态细胞中混匀,冰上放置30 min;42℃水浴热激90 s,冰上放置15~20 min;加400 μL SOC培养基,37℃200~250 rpm振荡培养1小时;室温下4000rpm离心5 min,用枪头吸掉400 μl上清液,用剩余的培养基将细胞悬浮;将细菌涂布在预先用20 μL 100Mm IPTG和100 μL 20mg/ml X-gal涂布的氨苄青霉素平板上;平板在37℃下正向放置1小时以吸收过多的液体,然后倒置培养过夜。
5.根据权利要求1所述的基于实时荧光定量PCR的黔北麻羊FSHR基因组织表达谱的建立方法,其特征在于:所述的构建组织表达谱,具体是:首先计算各组织样品的目的基因与内参基因的Ct差值(△Ct=△Ct目的基因-△Ct内参基因),然后计算每个组织样品△Ct平均值,选取垂体组织为对照,用其它组织样△Ct减去垂体组织的△Ct,即△△Ct=(△△Ct目的基因-△△Ct内参基因)试验组-(△△Ct目的基因-△△Ct内参基因)对照组。
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