[发明专利]检测PIK3CA基因突变的试剂盒及其检测方法在审
| 申请号: | 201510213332.2 | 申请日: | 2015-04-29 | 
| 公开(公告)号: | CN104774963A | 公开(公告)日: | 2015-07-15 | 
| 发明(设计)人: | 王弢;李宗飞;孙爱娟;李杰;张丽 | 申请(专利权)人: | 苏州工业园区为真生物医药科技有限公司 | 
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 | 
| 代理公司: | 北京同恒源知识产权代理有限公司 11275 | 代理人: | 王贵君 | 
| 地址: | 215123 江苏省苏州市工*** | 国省代码: | 江苏;32 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 检测 pik3ca 基因突变 试剂盒 及其 方法 | ||
1.检测PIK3CA基因突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含有针对PIK3CA基因突变位点的LNA锁核酸修饰的特异探针。
2.根据权利要求1所述检测PIK3CA基因突变的试剂盒,其特征在于:所述锁核酸修饰的特异探针的核苷酸序列为CTC+TCT+GAA+ATC+ACT+GAGCAGGAG-PO4或CCAC+CA+TGA+TG+TGCATCATTC-PO4,其中“+”后的T,G,A或C为锁核酸修饰碱基。
3.根据权利要求1所述检测PIK3CA基因突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还包含检测PIK3CA基因突变的引物,所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1与SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.2与SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.3与SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5与SEQ ID NO.6或SEQ ID NO.5与SEQ ID NO.7。
4.根据权利要求1所述检测PIK3CA基因突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还包括PCR缓冲液、dNTPs、Eva Green和二氯化镁。
5.根据权利要求4所述检测PIK3CA基因突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中各组分的终浓度如下:1×PCR buffer、2.5mM MgCl2、dNTP 250μM、引物250nM、探针500nM、1×EVE GREEN、DNA聚合酶1U和DNA模板2-20ng。
6.权利要求1-5任一项所述检测PIK3CA基因突变的试剂盒在非疾病诊断中检测PIK3CA基因突变的方法,其特征在于,包括如下步骤:
a.设计检测PIK3CA基因突变的引物和针对PIK3CA基因突变位点的LNA锁核酸修饰的特异探针;
b.从待测样品中提取模板DNA,然后利用步骤a得到的引物和特异探针进行荧光定量PCR扩增反应;
c.根据扩增曲线判读Ct值,再根据熔解曲线判读Tm值。然后根据Ct值及Tm值判断待测样品中PIK3CA基因突变情况,若溶解曲线最高峰的Tm值在相应突变的范围内,并且Ct<45,表明扩增区段发生突变。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:所述LNA锁核酸修饰的特异探针的核苷酸序列为CTC+TCT+GAA+ATC+ACT+GAGCAGGAG-PO4或CCAC+CA+TGA+TG+TGCATCATTC-PO4,其中“+”后的T,G,A或C为锁核酸修饰碱基。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:所述检测PIK3CA基因突变的引物SEQ ID NO.1与SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.2与SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.3与SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5与SEQ ID NO.6或SEQ ID NO.5与SEQ ID NO.7。
9.根据权利要求6所述检测PIK3CA基因突变的方法,其特征在于:所述荧光定量PCR扩增反应的条件如下:95℃预变性5min;95℃变性10s,60℃退火15s,72℃延伸25s,50个循环;95℃变性1min,40℃退火1min,65-95℃熔解,每秒钟升温0.02℃,每摄氏度收集25次荧光信号,最后40℃保存。
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