[发明专利]一种遗传性视锥细胞营养不良疾病的致病突变及其检测试剂

说明书

技术领域

本发明属于生物医药领域，涉及一种遗传性视锥细胞营养不良疾病的致病突变及其检测试剂。

背景技术

视锥细胞营养不良(cone dystrophy；CD)是一组由遗传缺陷引起的进行性视网膜退行性疾病，这类疾病以视锥细胞的不可逆性凋亡为主要病理特征，疾病晚期部分患者可合并有视杆细胞的损害。CD患者的临床表现为幼年发生的中心视力的进行性下降，严重者可致盲。CD是临床上常见且危害较为严重的一类遗传性致盲疾病，是严重危害世界范围内工作年龄人群的一大类致盲眼病，CD在我国乃至世界范围内均有较高的发病率。我国是CD遗传资源大国，但目前CD相关的遗传学信息多来自西方国家，因此对我国CD患者进行深入的遗传学研究，探寻潜在的CD相关的新致病基因及致病突变显得尤为重要。

CD多为单基因遗传病，具有显著的临床及遗传异质性。CD的遗传异质性表现在众多基因缺陷均可致病，其常见的遗传模式有常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传及X连锁隐性遗传。迄今，全世界已鉴定出28个CD相关致病基因和32个连锁位点(www.RetNet.org)，且随着研究深入，该数目正逐年递增。与此同时，携带有相同致病基因突变甚至是相同致病突变的患者，其临床表现亦可能存在较大差异，即显著的临床异质性。目前仍有40％到50％(西方国家统计结果，我国比率更高)CD患者的致病基因尚未找到，提示存在大量CD的新致病基因有待挖掘。

针对CD的分子遗传学研究必须建立在一定的分子生物学技术的基础上。研究CD致病基因的一个重要目的是进行CD的分子诊断，鉴于其显著的遗传异质性，如何检测众多致病基因突变是目前的难题之一。基于连锁分析的定位克隆策略是鉴定单基因遗传病致病基因的经典方法，但是同时也面临一些困难：①通常需要多代家系，难以分析小家系和散发病例。②有时多代家系也不能定位致病位点。③难以在连锁区域内筛选出正确的致病基因。因此，鉴于CD疾病本身的性质及传统分析技术的局限性，寻求一种全新的CD致病基因的研究方法显得尤为迫切。

Leber congenital amaurosis 5(LCA5；MIM 611408)基因位于6号染色体长臂6q14.1位置，该基因含有9个外显子，其编码的LCA5蛋白是一种高度保守、广泛表达的纤毛蛋白。现有研究表明，LCA5基因突变可以引起雷伯氏先天性黑矇(Leber congenital amaurosis；LCA)、视网膜色素变性(retinitis pigmentosa；RP)及早发视网膜萎缩(early-onset retinal dystrophy；EORD)，然而LCA5基因突变与CD间的关系却从未被报道或得到证实。

发明内容

本发明的目的是针对上述缺陷，提供一种遗传性视锥细胞营养不良疾病的致病突变。

本发明的另一目的是提供该致病突变的应用。

本发明的又一目的是提供该致病突变的检测试剂。

本发明的目的可通过如下技术方案实现：

一种用于检测遗传性视锥细胞营养不良疾病的突变的LCA5基因，突变的LCA5基因为双等位基因杂合突变LCA5 p.[Ala212Pro]；[Tyr441Cys]。

野生型LCA5基因在Ensemble数据库中的基因编号为：ENSG00000135338，所述的突变的LCA5基因在物理位置为8022301的碱基由G突变为C，在物理位置为80197493的碱基由A突变为G，其他部分与野生型相同。

一种突变的LCA5蛋白，野生型LCA5蛋白在Ensemble数据库中的基因转录本编号为：ENST00000392959，突变的LCA5蛋白在该野生型蛋白的第212位氨基酸由丙氨酸突变为脯氨酸，第441位氨基酸由酪氨酸突变为半胱氨酸，其他部分与野生型相同。

本发明所述的突变的LCA5基因或者所述的突变的LCA5蛋白在制备遗传性视锥细胞营养不良疾病检测试剂或检测设备中的应用。

其中所述的检测试剂优选自：引物或引物对、探针、抗体、或核酸芯片中的一种或多种。

所述的检测设备优选包括含有检测突变的LCA5基因的基因芯片的检测平台。

一种检测遗传性视锥细胞营养不良疾病的试剂盒，所述的试剂盒包括：

(a)检测LCA5基因物理位置为80223015和80197493核苷酸位点的试剂；或检测LCA5蛋白第212位或第441位氨基酸位点的试剂；

(b)说明书。