[发明专利]鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的成套引物有效

专利信息
申请号: 201510084410.3 申请日: 2015-02-16
公开(公告)号: CN104611452B 公开(公告)日: 2017-03-08
发明(设计)人: 杨腊英;黄俊生;刘磊;郭立佳;汪军;梁昌聪;王国芬;陈平亚;师雪茹 申请(专利权)人: 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司11245 代理人: 关畅,任凤华
地址: 571101 海*** 国省代码: 海南;46
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摘要:
搜索关键词: 鉴定 辅助 香蕉 枯萎 病菌 成套 引物
【说明书】:

技术领域

发明涉及生物技术领域中鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的成套引物。

背景技术

尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)是一种世界性分布的土传病原真菌,寄主范围广泛,可引起瓜类、茄科、香蕉、棉、豆科及花卉等100多种植物枯萎病的发生。尽管尖孢镰刀菌在整体上具有广泛的寄主范围,但单个菌株仅能侵染一种或少数几种植物种类。在不同的寄主上又分为不同的生理专化型,目前已报道的生理专化型有150多种,有些专化型依据对不同品种的特异性被进一步划分为不同的生理小种,大多数专化型包含2个或更多的生理小种,而一小部分是单型。某生理专化型可能在特定的植物种类上引起病害,但是属于其他专化型的菌株对同样的这种特定植物种类可能无害甚至对其有利。

香蕉枯萎病,又称香蕉镰刀菌枯萎病、巴拿马病、黄叶病,是由尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxyporum f.sp.Cubense,Foc)引起的破坏植株维管束而导致植株死亡的一种毁灭性病害,目前,除地中海、印度洋、南太平洋一些岛屿国家外,几乎所有香蕉种植区均有遭受该病害危害的报导。依据尖孢镰刀菌古巴专化型(Foc)对不同品种香蕉的侵染特异性将其划分为4个生理小种(race):其中1号生理小种(Foc1)侵染“大蜜哈”[Gros michel(AAA)]、Silk(AAB)、Taiwan Latundan(AAB)、IC2(AAAA)和粉蕉(ABB);2号生理小种(Foc2)只侵染杂种三倍体Bluggoe及ABB基因型的相关煮食蕉类;3号生理小种侵染野生揭尾蕉属(Heliconia spp.)而不是香蕉类,因而被划分出Foc;4号生理小种(Foc4)则侵染所有的Cavendish类香蕉(AAA)及其他对1号与2号生理小种敏感的蕉类。基于Foc4是否能在热带环境条件下对Cavendish类香蕉致病,又将Foc4进一步划分为“尖孢镰刀菌古巴专化型热带4号生理小种”(TR4)与“尖孢镰刀菌古巴专化型亚热带4号生理小种”(ST4),尖孢镰刀菌古巴专化型亚热带4号生理小种仅在亚热带条件下侵染Cavendish类香蕉。我国广东、广西、福建、海南、云南和台湾等主要香蕉种植区也均已发现香蕉枯萎病,且香蕉枯萎病的发病加重趋势明显。目前急需一套快速鉴定香蕉是否感染香蕉枯萎病菌的方法,为生产安全健康香蕉种苗保驾护航。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是如何鉴定香蕉枯萎病菌中的尖孢镰刀菌古巴专化型和/或尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种。

为解决上述技术问题,本发明提供了鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的成套引物,其名称为成套引物甲。

本发明所提供的成套引物甲,由名称为A的PCR引物对和名称为B的PCR引物对组成;

所述A由序列表中SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的两条单链DNA组成;所述B由序列表中SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的两条单链DNA组成。

本发明所要解决的另一个技术问题是如何鉴定香蕉枯萎病菌中的尖孢镰刀菌古巴专化型。

为解决上述技术问题,本发明提供了鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的PCR引物对。

本发明所提供的鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的PCR引物对,为所述B。

本发明所要解决的再一个技术问题是如何鉴定香蕉枯萎病菌中的尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种。

为解决上述技术问题,本发明提供了鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的PCR引物对。

本发明所提供的鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的PCR引物对,为所述A。

为解决上述技术问题,本发明还提供了鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的系统。

本发明所提供的鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的系统为下述Ll-Nn中的任一种:

Ll、含有所述成套引物甲的系统;

Mm、含有所述B的系统;

Nn、含有所述A的系统。

上述鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的系统,可包括通过PCR鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌所需的试剂和仪器。具体来说,鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的系统可包括所述成套引物甲、所述B或所述A以及PCR所需要的其它试剂和仪器。

上述鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的系统还可仅包括所述成套引物甲、所述B或所述A。

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