[发明专利]一种基因联合检测方法及试剂盒有效
| 申请号: | 201410849552.X | 申请日: | 2014-12-30 |
| 公开(公告)号: | CN104480215A | 公开(公告)日: | 2015-04-01 |
| 发明(设计)人: | 唐涛;周细武 | 申请(专利权)人: | 宁波有成生物医药科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
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| 地址: | 315040 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基因 联合 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种基因联合检测方法,可同时检测KRAS、PIK3CA、BRAF和EGFR基因总共16种突变。
2.如权利要求1所述的基因联合检测方法,其特征在于,检测的突变包括:
KRAS基因突变:
PIK3CA基因突变:
BRAF基因突变:V600E(Cosmic ID 476)
EGFR基因突变:19号外显子的缺失突变、L858R(Cosmic ID 6224,c.2573T>G)和T790M(Cosmic ID 6240,c.2369C>T)。
3.如权利要求1所述的基因联合检测方法,其特征在于,包含了表1中P-SEQ-1~P-SEQ-34特异性探针。
4.一种基因联合检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求3所述特异性探针。
5.如权利要求4所述的一种基因联合检测试剂盒,包括以下操作步骤:
模板变性:将模板DNA加入PCR管中,置于PCR仪上,设置温度为95~100℃,维持3~10min,再冷却至25℃;
杂交:在变性后的模板中加入MLPA Buffer和探针的混合物,其中探针的浓度为0.5~10nM;MLPA Buffer中含有Tris-HCl(50~500mM,pH8.2~9.0),KCl(2~5M),MgCl2(0.5~5M),EDTA(0.5~5mM);在PCR仪上运行杂交程序:95℃1min;60℃16~24h;
连接:杂交反应结束后,在每个PCR管中加入超纯水和连接酶,在PCR仪上运行连接程序:50~58℃10~30min;95~100℃10~30min;冷却至20℃;
PCR扩增:连接反应结束后进行PCR扩增,在每个PCR管中加入PCR通用引物、dNTPs和Taq酶,在PCR仪上运行PCR程序;
检测:可以采用琼脂糖电泳、聚丙烯酰胺电泳及毛细管电泳等方法检测扩增的核酸片段。
6.如权利要求4所述的一种基因联合检测试剂盒,待检测样品包括新鲜病理组织、石蜡包埋病理组织、石蜡切片、唾液、痰液、尿液和血液。
7.一种用于检测KRAS、PIK3CA、BRAF和EGFR基因总共16种突变的探针,其特征在于,由P-SEQ-1~P-SEQ-34的寡核苷酸探针或序列与其有至少70%同一性的寡核苷酸组成。
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