[发明专利]焦磷酸测序法检测EML4-ALK融合基因的引物对及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201410828515.0 申请日: 2014-12-25
公开(公告)号: CN104911251A 公开(公告)日: 2015-09-16
发明(设计)人: 邵棠;陈庆 申请(专利权)人: 邵棠
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人: 肖明芳
地址: 江苏省南京市江宁国家高新园*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 磷酸 测序法 检测 eml4 alk 融合 基因 引物 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种焦磷酸测序法检测EML4-ALK融合基因的引物对,所述的EML4-ALK为EML4-ALK variant 1和EML4-ALK variant 3中的任意一种或两种,其特征在于,所述引物对包括:

(1)对于EML4-ALK variant 1基因,

扩增引物为:

上游引物:5′-CACACCTGGGAAAGGACCTAAA-3′,

下游引物:5′-CGGAGCTTGCTCAGCTTGTACT-3′,

其中下游引物的5′端进行生物素标记;

测序引物为:

5′-TGGGAAAGGACCTAAA-3′;

(2)对于EML4-ALK variant 3基因:

扩增引物为:

上游引物:5′-TGCAGACAAGCATAAAGATGTCAT-3′,

下游引物:5′-TTGGGGTTGTAGTCGGTCAT-3′,

其中上游引物的5′端进行生物素标记;

测序引物:

5′-GTGCTTCCGGCGGTA-3′。

2.一种焦磷酸测序法检测EML4-ALK融合基因的试剂盒,所述的EML4-ALK为EML4-ALK variant 1和EML4-ALK variant 3中的任意一种或两种,其特征在于,所述试剂盒包含如下所述的引物对:

(1)对于EML4-ALK variant 1基因,

扩增引物为:

上游引物:5′-CACACCTGGGAAAGGACCTAAA-3′,

下游引物:5′-CGGAGCTTGCTCAGCTTGTACT-3′,

其中下游引物的5′端进行生物素标记;

测序引物为:

5′-TGGGAAAGGACCTAAA-3′;

(2)对于EML4-ALK variant 3基因:

扩增引物为:

上游引物:5′-TGCAGACAAGCATAAAGATGTCAT-3′,

下游引物:5′-TTGGGGTTGTAGTCGGTCAT-3′,

其中上游引物的5′端进行生物素标记;

测序引物:

5′-GTGCTTCCGGCGGTA-3′。

3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒包括质控品,所述质控品包括阳性对照品和阴性对照品。

4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述的阳性对照品为含有EML4-ALK variant 1和EML4-ALK variant 3的质粒的混合液,所述的阴性对照品为不含EML4-ALK variant 1和EML4-ALK variant 3的质粒溶液。

5.权利要求1所述的引物对在制备检测EML4-ALK融合基因的试剂中的应用。

6.权利要求2所述的试剂盒在制备检测EML4-ALK融合基因的试剂中的应用。

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