[发明专利]焦磷酸测序法检测EML4-ALK融合基因的引物对及试剂盒在审
申请号: | 201410828515.0 | 申请日: | 2014-12-25 |
公开(公告)号: | CN104911251A | 公开(公告)日: | 2015-09-16 |
发明(设计)人: | 邵棠;陈庆 | 申请(专利权)人: | 邵棠 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 肖明芳 |
地址: | 江苏省南京市江宁国家高新园*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 磷酸 测序法 检测 eml4 alk 融合 基因 引物 试剂盒 | ||
1.一种焦磷酸测序法检测EML4-ALK融合基因的引物对,所述的EML4-ALK为EML4-ALK variant 1和EML4-ALK variant 3中的任意一种或两种,其特征在于,所述引物对包括:
(1)对于EML4-ALK variant 1基因,
扩增引物为:
上游引物:5′-CACACCTGGGAAAGGACCTAAA-3′,
下游引物:5′-CGGAGCTTGCTCAGCTTGTACT-3′,
其中下游引物的5′端进行生物素标记;
测序引物为:
5′-TGGGAAAGGACCTAAA-3′;
(2)对于EML4-ALK variant 3基因:
扩增引物为:
上游引物:5′-TGCAGACAAGCATAAAGATGTCAT-3′,
下游引物:5′-TTGGGGTTGTAGTCGGTCAT-3′,
其中上游引物的5′端进行生物素标记;
测序引物:
5′-GTGCTTCCGGCGGTA-3′。
2.一种焦磷酸测序法检测EML4-ALK融合基因的试剂盒,所述的EML4-ALK为EML4-ALK variant 1和EML4-ALK variant 3中的任意一种或两种,其特征在于,所述试剂盒包含如下所述的引物对:
(1)对于EML4-ALK variant 1基因,
扩增引物为:
上游引物:5′-CACACCTGGGAAAGGACCTAAA-3′,
下游引物:5′-CGGAGCTTGCTCAGCTTGTACT-3′,
其中下游引物的5′端进行生物素标记;
测序引物为:
5′-TGGGAAAGGACCTAAA-3′;
(2)对于EML4-ALK variant 3基因:
扩增引物为:
上游引物:5′-TGCAGACAAGCATAAAGATGTCAT-3′,
下游引物:5′-TTGGGGTTGTAGTCGGTCAT-3′,
其中上游引物的5′端进行生物素标记;
测序引物:
5′-GTGCTTCCGGCGGTA-3′。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒包括质控品,所述质控品包括阳性对照品和阴性对照品。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述的阳性对照品为含有EML4-ALK variant 1和EML4-ALK variant 3的质粒的混合液,所述的阴性对照品为不含EML4-ALK variant 1和EML4-ALK variant 3的质粒溶液。
5.权利要求1所述的引物对在制备检测EML4-ALK融合基因的试剂中的应用。
6.权利要求2所述的试剂盒在制备检测EML4-ALK融合基因的试剂中的应用。
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