[发明专利]一种检测人线粒体基因组特异性的引物组在审

专利信息
申请号: 201410780562.2 申请日: 2014-12-17
公开(公告)号: CN104480207A 公开(公告)日: 2015-04-01
发明(设计)人: 李洲;范嘉庚;李航 申请(专利权)人: 杭州吉洛生物医药科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 杭州求是专利事务所有限公司 33200 代理人: 邱启旺
地址: 310030 浙江省杭州*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 线粒体 基因组 特异性 引物
【说明书】:

技术领域

发明属基因组学领域,涉及一种新型人类线粒体全基因组序列的扩增引物。

背景技术

线粒体是真核生物细胞内非常重要的细胞器,是真核生物进行氧化代谢的主要部位,是糖类等物质在细胞中最终氧化释放能量的场所。线粒体自身具有一套独立的基因组,它只在卵母细胞中进行分裂,因此具有母系遗传的特点,即只通过女性向下一代进行传递。线粒体DNA基因突变的传递有一定数量上的特点。

每个细胞中含有大量线粒体,如果细胞内所有的线粒体DNA上的某一位点均为同一类型的碱基,即全部都是正常基因或同为突变基因,则该细胞为纯质的;如果细胞内所有的线粒体DNA上的某一位点同时存在正常基因和突变基因,则该细胞为异质的。当异质率到达一定的水平后,就有可能对细胞的正常功能产生影响。

研究显示,线粒体基因的突变会导致:KSS综合症,Leigh氏病或称亚急性坏死性脑肌病,ELAS综合症,MERRF综合症,Leber氏遗传性视神经萎缩症,Alper综合症,慢性进行性外眼肌麻痹,线粒体神经消化道脑肌病,Pearson综合症等。

长片段测序,对于样品以及Taq酶要求较高,也不能保证较高的准确性。本法方法设计16对引物,而后PCR产物直接测序,最后进行拼接的方法,能有效地提高数据的准确率,同时还能检测出线粒体基因的异质率。

发明内容  

本发明的目的是针对现有技术的不足,提供一种检测人线粒体基因组特异性的引物组,利用提供的引物,扩增出人类线粒体基因组的片段后进行测序拼接,从而确定某个人类个体的线粒体全基因组序列,在对其进行突变位点分析后,为线粒体相关疾病的治疗和预防提供相关依据。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的:一种检测人线粒体基因组特异性的引物组,该引物组包括:

第一引物对:如SEQ ID NO.1所示的的正向引物;如SEQ ID NO.2所示的的反向引物;

第二引物对:如SEQ ID NO.3所示的的正向引物;如SEQ ID NO.4所示的的反向引物;

第三引物对:如SEQ ID NO.5所示的的正向引物;如SEQ ID NO.6所示的的反向引物;

第四引物对:如SEQ ID NO.7所示的的正向引物;如SEQ ID NO.8所示的的反向引物;

第五引物对:如SEQ ID NO.9所示的的正向引物;如SEQ ID NO.10所示的的反向引物;

第六引物对:如SEQ ID NO.11所示的的正向引物;如SEQ ID NO.12所示的的反向引物;

第七引物对:如SEQ ID NO.13所示的的正向引物;如SEQ ID NO.14所示的的反向引物;

第八引物对:如SEQ ID NO.15所示的的正向引物;如SEQ ID NO.16所示的的反向引物;

第九引物对:如SEQ ID NO.17所示的的正向引物;如SEQ ID NO.18所示的的反向引物;

第十引物对:如SEQ ID NO.19所示的的正向引物;如SEQ ID NO.20所示的的反向引物;

第十一引物对:如SEQ ID NO.21所示的的正向引物;如SEQ ID NO.22所示的的反向引物;

第十二引物对:如SEQ ID NO.23所示的的正向引物;如SEQ ID NO.24所示的的反向引物;

第十三引物对:如SEQ ID NO.25所示的的正向引物;如SEQ ID NO.26所示的的反向引物;

第十四引物对:如SEQ ID NO.27所示的的正向引物;如SEQ ID NO.28所示的的反向引物;

第十五引物对:如SEQ ID NO.29所示的的正向引物;如SEQ ID NO.30所示的的反向引物;

第十六引物对:如SEQ ID NO.31所示的的正向引物;如SEQ ID NO.32所示的的反向引物。

本发明的有益效果是:本发明设计16对引物,而后PCR产物直接测序,最后进行拼接的方法,相比于现有技术中长片段测序,本发明所设计引物的扩增产物覆盖了整个线粒体的全基因组序列,每对引物的扩增产物长度在1200~1300bp,且相邻两对引物获得的序列重叠100~300bp。因此可以一次性地准确地获得线粒体基因组的信息,检测到线粒体基因组上的所有突变,辅助进行线粒体相关疾病的诊断。

附图说明   

图1是实施例1中提取的人类基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳图。

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