[发明专利]一种与小麦苗期耐低磷能力相关的SNP位点及其应用有效
| 申请号： | 201410520103.0 | 申请日： | 2014-09-30 |
| 公开（公告）号： | CN104293939A | 公开（公告）日： | 2015-01-21 |
| 发明（设计）人： | 何中虎;李法计;肖永贵;夏先春;陈新民;李思敏 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院作物科学研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 关畅;白艳 |
| 地址： | 100081 北京市海淀*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 小麦 苗期 耐低磷 能力 相关 snp 及其 应用 | ||
1.一种辅助鉴定小麦耐低磷能力的方法，是检测待测小麦的1B染色体132.6cM位置的基因的第56位脱氧核糖核苷酸是A还是G还是A和G,以确定待测小麦1B染色体132.6cM位置的基因的基因型是AA还是AG还是GG，根据所述待测小麦的基因型确定耐低磷能力：GG基因型的待测小麦的耐低磷能力高于或候选高于AG或AA基因型的待测小麦；所述GG基因型为1B染色体132.6cM位置的基因的第56位脱氧核糖核苷酸为G的纯合体，所述AG因型1B染色体132.6cM位置的基因的第56位脱氧核糖核苷酸为为A和G的杂合体，所述AA因型为1B染色体132.6cM位置的基因的第56位脱氧核糖核苷酸为A的纯合体。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述检测待测小麦的1B染色体132.6cM位置的基因的第56位脱氧核糖核苷酸是A还是G还是A和G包括PCR扩增和对PCR扩增产物进行基因分型鉴定两个步骤；
所述PCR扩增所用的引物对满足如下条件:以所述待测小麦的基因组DNA为模板进行PCR扩增的产物含有1B染色体132.6cM位置的基因的第56位脱氧核糖核苷酸。
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于：所述PCR扩增所用的引物由序列表中序列1所示的单链DNA分子、序列表中序列2所示的单链DNA分子和序列表中序列3所示的单链DNA分子组成的引物组；
所述序列1所示的单链DNA分子的5’末端添加特异荧光序列FAM；
所述序列2所示的单链DNA分子的5’末端添加特异荧光序列HEX；
所述基因分型鉴定采用荧光酶标仪；
所述耐低磷中磷的终浓度为0.25m mol/L；
所述1B染色体132.6cM位置的基因的核苷酸序列为序列表中序列4。
4.一种辅助鉴定小麦的耐低磷能力的试剂，是待测小麦的1B染色体132.6cM位置的基因的第56位脱氧核糖核苷酸是A还是G还是A和G的物质。
5.根据权利要求4所述的试剂，其特征在于：所述物质为由序列表中序列1所示的单链DNA分子、序列表中序列2所示的单链DNA分子和序列表中序列3所示的单链DNA分子组成的引物组；
所述序列1所示的单链DNA分子的5’末端具体添加特异荧光序列FAM；
所述序列2所示的单链DNA分子的5’末端具体添加特异荧光序列HEX。
6.辅助鉴定小麦的耐低磷能力的试剂盒，含有权利要求4或5所述的试剂。
7.权利要求4或5所述的试剂或权利要求6所述的试剂盒在辅助检测小麦耐低磷能力的应用；
或权利要求4或5所述的试剂或权利要求6所述的试剂盒在制备辅助检测小麦耐低磷能力产品中的应用。
8.权利要求1-7所述的方法、试剂或试剂盒在选育耐低磷小麦中的应用。
9.一种与小麦耐低磷能力相关的SNP位点，该位点为小麦的1B染色体132.6cM位置的基因的第56位脱氧核糖核苷酸，该第56bp位核苷酸为A和/或G；小麦的1B染色体132.6cM位置的基因的核苷酸序列为序列表中序列4。
10.一种与小麦耐低磷能力相关的含有SNP位点的DNA片段，其核苷酸序列为序列表中序列4，其中，该序列第56bp处碱基为A和/或G；且该DNA片段在小麦1B染色体上的132.6cM位置。
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