[发明专利]一种提取基因组DNA的提取液、其应用及利用该提取液快速高效提取烟草基因组DNA的方法在审
申请号: | 201410499415.8 | 申请日: | 2014-09-19 |
公开(公告)号: | CN104342433A | 公开(公告)日: | 2015-02-11 |
发明(设计)人: | 王元英;向小华;吴新儒;焦禹顺;屈旭;刘贯山;孙玉合;程亚增;龚达平 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院烟草研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
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地址: | 266000 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 提取 基因组 dna 应用 利用 快速 高效 烟草 方法 | ||
技术领域
本发明涉及生物学研究的基础技术技术领域,特别涉及一种快速高效提取烟草基因组DNA的方法。
背景技术
烟草作为分子生物学研究的常用模式植物,在基因工程各项研究中的作用越发重要。由于烟草叶片富含多糖、蛋白和酚类物质,且含有大量的生物碱(如:烟碱)及其它多种次生物质,这就给为DNA的提取带来了极大困难,如酚类物质可以氧化成醌类物质可引起DNA降解、变色;蛋白与DNA结合造成DNA纯度下降,并影响后续分析;残存的多糖能抑制连接酶、限制性酶及PCR聚合酶的生物酶活,运用目前常用的方法不是费用高昂,操作繁琐,就是获得DNA纯度不高,得率低,且多糖、蛋白质的除去不彻底,影响后续试验的进行。
目前所常植物DNA提取方法主要有CTAB法、高盐低pH法、SDS裂解法及果胶酶解法等,在市场上也出现了各种提取DNA的试剂盒。本实验室常用试剂盒提取烟草基因组DNA,现参照试剂盒提供的步骤操作进行,具体操作步骤如下:(1)取烟草新鲜叶片组织0.1g,加入液氮充分研磨,每个样品3个重复。(2)将研磨好的粉末迅速转移到预先装有700μL 65℃预热缓冲液GP1的离心管中(实验先加β-巯基乙醇,使终浓度达0.1%),迅速颠倒混匀后,65℃温育20min,期间颠倒混匀3-4次。(3)加入700μL氯仿,充分混匀,12000rpm离心5min.(4)取上清液转入一新的离心管中,加入700μL缓冲液GD2,充分混匀。(5)将混匀的液体转到吸附柱CB3中,12000rpm离心30s,弃掉废液。(6)向吸附柱中加入500μL缓冲液GD,12000rpm离心30s,倒掉废液。(7)向吸附柱中加入600μL漂洗液PW,12000rpm离心30s,倒掉废液。(8)重复步骤(7)。(9)将吸附柱放入收集管中,12000rpm离心2min,倒掉废液。将吸附柱于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附柱中的漂洗液。(10)将吸附柱置于另一干净的离心管中,加入100μL TE,室温放置2-5min,12000rpm离心2min,将溶液收集到离心管中,得到的溶液即为DNA溶液。
目前所运用的DNA提取方法大体表现为操作繁琐需要,需多种成分使细胞裂解破碎,内含物释放,再经过抽提,一般需用氯仿等有机溶剂除去蛋白质和多糖等杂质,乙醇沉淀等操作步骤,大体都表现为时间长,完成一次提取要3.5个小时左右,价格昂贵,每个样品的费用在1美元左右,且DNA得率较低,用于简单的检测还可以,若用于大批量的检测则需要再次提取,这样不但耽误了实验进程,还会增加更大的工作量。
发明内容
为了解决现有技术中存在的问题,本发明提出了。
为达到以上目的,本发明采取的技术方案是:
一种提取基因组DNA的提取液,由以下组分组成:
(0.1M Tris、1M KCl、10mM EDTANa2,pH=9.5),还含有0.75%(w/v)PVP(Polyvinylpyrrolidone,聚乙烯吡咯烷酮)和0.36%(w/v)按等重量混合的NaHSO3/Na2S2O3混合物。
一种如上所述的提取基因组DNA的提取液的用途,所述提取液用于提取烟草基因组DNA。
一种快速高效提取烟草基因组DNA的方法,具体的步骤如下:
(1)取烟草的幼嫩叶片组织0.1g于无菌离心管中,加液氮研磨至粉末状,每个样品3个重复;
(2)每管加入600μL预热DNA提取缓冲液(0.1M Tris、1M KCl、10mM EDTANa2,pH=9.5),同时附加0.75%(w/v)PVP(Polyvinylpyrrolidone,聚乙烯吡咯烷酮)和0.36%(w/v)NaHSO3/Na2S2O3,摇匀后于65℃水浴45min,期间颠倒混匀3-4次;
(3)加入200μL 5M(pH=5.8)KAC,摇匀后室温静置15min待反应充分后,13000rpm离心10min;
(4)将上清液转入另一新的无菌离心管,加入165μL预冷的异丙醇,-20℃放置30min,可见絮状沉淀;
(5)将上述离心管中溶液11000rpm离心8min,弃废液留沉淀;
(6)用500μL的70%乙醇洗涤沉淀两次,无水乙醇洗涤一次,11000rpm离心3min,弃废液;
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