[发明专利]一种用于扩增子测序的建库方法无效
申请号: | 201410391037.1 | 申请日: | 2014-08-11 |
公开(公告)号: | CN104153004A | 公开(公告)日: | 2014-11-19 |
发明(设计)人: | 林芹;于丹;李胜彬;陈华;陶晔;曾亮 | 申请(专利权)人: | 上海美吉生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C40B40/06 |
代理公司: | 上海晨皓知识产权代理事务所(普通合伙) 31260 | 代理人: | 成丽杰 |
地址: | 201314 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 扩增 子测序 方法 | ||
1.一种用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)PCR扩增富集目标区域:对待测样品基因组DNA,针对目标区域设计引物序列,所述引物序列在正向引物和反向引物的5’端设有随机碱基序列和接头序列,进行PCR扩增,回收PCR产物;
(2)PCR扩增引入测序接头:将步骤(1)所得到的PCR产物进行混样,设计引物序列,所述引物序列包含与步骤(1)中的接头序列互补的序列,对混样进行PCR扩增,回收PCR产物,即得到用于扩增子测序的DNA文库。
2.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,在所述步骤(2)之后还包括测序并对测序数据进行生物信息学分析的步骤。
3.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,在所述步骤(1)之前还包括提取待测样品基因组DNA的步骤。
4.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,步骤(1)中回收PCR产物时采用凝胶电泳法切胶回收目的条带。
5.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,步骤(2)中在将PCR产物进行混样后还包括磁珠纯化的步骤。
6.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,步骤(2)中的引物序列中,在正向引物的5’端带有P5序列;在反向引物的5’端带有Index序列和P7序列。
7.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,步骤(2)中回收PCR产物时采用磁珠法或凝胶电泳法。
8.根据权利要求2所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,所述测序步骤通过一代测序平台或高通量测序平台进行。
9.一种用于扩增子测序的DNA文库,其根据权利要求1至8任一项所述的方法构建得到。
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