[发明专利]一种用于扩增子测序的建库方法无效

专利信息
申请号: 201410391037.1 申请日: 2014-08-11
公开(公告)号: CN104153004A 公开(公告)日: 2014-11-19
发明(设计)人: 林芹;于丹;李胜彬;陈华;陶晔;曾亮 申请(专利权)人: 上海美吉生物医药科技有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C40B40/06
代理公司: 上海晨皓知识产权代理事务所(普通合伙) 31260 代理人: 成丽杰
地址: 201314 上海*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 扩增 子测序 方法
【权利要求书】:

1.一种用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)PCR扩增富集目标区域:对待测样品基因组DNA,针对目标区域设计引物序列,所述引物序列在正向引物和反向引物的5’端设有随机碱基序列和接头序列,进行PCR扩增,回收PCR产物;

(2)PCR扩增引入测序接头:将步骤(1)所得到的PCR产物进行混样,设计引物序列,所述引物序列包含与步骤(1)中的接头序列互补的序列,对混样进行PCR扩增,回收PCR产物,即得到用于扩增子测序的DNA文库。

2.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,在所述步骤(2)之后还包括测序并对测序数据进行生物信息学分析的步骤。

3.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,在所述步骤(1)之前还包括提取待测样品基因组DNA的步骤。

4.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,步骤(1)中回收PCR产物时采用凝胶电泳法切胶回收目的条带。

5.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,步骤(2)中在将PCR产物进行混样后还包括磁珠纯化的步骤。

6.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,步骤(2)中的引物序列中,在正向引物的5’端带有P5序列;在反向引物的5’端带有Index序列和P7序列。

7.根据权利要求1所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,步骤(2)中回收PCR产物时采用磁珠法或凝胶电泳法。

8.根据权利要求2所述的用于扩增子测序的建库方法,其特征在于,所述测序步骤通过一代测序平台或高通量测序平台进行。

9.一种用于扩增子测序的DNA文库,其根据权利要求1至8任一项所述的方法构建得到。

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