[发明专利]与番茄果实颜色性状相关的分子标记及应用

权利要求书

1.与番茄果实颜色性状相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记为番茄SlMYB12基因上如Seq ID No.8所示的DNA序列，所述DNA序列第207bp处存在一个SNP位点，此处碱基为C或A，此处碱基为C的对应于红果番茄，此处碱基为A的对应于粉果番茄；所述SNP位点位于番茄SlMYB12基因起始密码子上游第8616bp处。

2.与番茄果实颜色性状相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记为InDel标记InDel-p；

所述标记InDel-p是位于番茄SlMYB12基因起始密码子上游4kb处大小为603bp的DNA序列，该序列缺失的为粉果番茄；所述序列的核苷酸序列如Seq ID No.1所示。

3.用于检测权利要求1所述分子标记的特异性引物对，其特征在于，所述引物对包括：正向引物F 5’-GCCTTCTTCTACACCCTT-3’和反向引物R 5’-ACACCAGTGCTCCTCCTA-3’。

4.用于检测权利要求2所述分子标记的特异性引物对，其特征在于，所述引物对包括：正向引物F 5’-AGTGACGAACAACCGACCTA-3’和反向引物R 5’-CCTCACAAACGCGGACAAA-3’。

5.一种鉴定番茄果实颜色的方法，其特征在于，包括以下步骤：

1)提取待测番茄的基因组DNA；

2)以待测番茄的基因组DNA为模板，利用权利要求3或4的引物对，进行PCR扩增反应；

3)检测PCR扩增产物。

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，步骤2)中利用权利要求3的引物对进行PCR扩增，PCR反应体系为：含1.5mmol/L Mg²⁺的1×PCR反应缓冲液2μl，2.5mM dNTPs 0.8μl，10μM上、下游引物各0.3μl，2.5U/μl Taq DNA聚合酶0.4μl，20ng/μl DNA模板2μl，ddH₂O补齐至20μl；

PCR扩增程序为：94℃预变性5min；94℃变性30s，55℃退火30s，72℃延伸30s，35个循环；72℃延伸5min。

7.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，步骤2)中利用权利要求4的引物对进行PCR扩增，PCR反应体系为：含1.5mmol/L Mg²⁺的1×PCR反应缓冲液2μl，2.5mM dNTPs 0.8μl，10μM上、下游引物各0.3μl，2.5U/μl Taq DNA聚合酶0.4μl，20ng/μl DNA模板2μl，ddH₂O补齐至20μl；

PCR扩增程序为：94℃预变性5min；94℃变性20s，55℃退火20s，72℃延伸40s，35个循环；72℃延伸10min。

8.含有权利要求3或4所述引物对的用于检测番茄果实颜色的试剂盒。

9.权利要求1所述与番茄果实颜色性状相关的分子标记在番茄分子标记辅助育种中的应用。

10.权利要求2所述与番茄果实颜色性状相关的分子标记在番茄分子标记辅助育种中的应用。