[发明专利]鉴定待测品种是否为中棉所63的方法及其专用引物组有效
申请号: | 201410245213.0 | 申请日: | 2014-06-04 |
公开(公告)号: | CN104004845A | 公开(公告)日: | 2014-08-27 |
发明(设计)人: | 付小琼;叶武威;杨付新;黄殿成 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院棉花研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 455000 河南省*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴定 品种 是否 63 方法 及其 专用 引物 | ||
1.一种鉴定或辅助鉴定待测棉花是否为中棉所63的方法,包括如下步骤:
以待测棉花的基因组DNA为模板,分别采用CIR62引物对、CS62引物对、NAU1070引物对、NAU1102引物对、NAU1186引物对、NAU2026引物对、NAU2173引物对、NAU2277引物对、NAU2343引物对、NAU1196引物对、NAU1085引物对、NAU1255引物对、NAU1369引物对、NAU1233引物对、NAU1269引物对、NAU2272引物对、NAU1187引物对、NAU1375引物对、CS51引物对、NAU1028引物对、NAU2342引物对、NAU868引物对、HAU1300引物对、NAU6094引物对、DPL0238引物对、NAU1362引物对、NAU859引物对、HAU2786引物对、CGR6410引物对和NAU0478引物对进行PCR扩增,如果PCR扩增产物满足标准1)至标准30)中的28条以上,待测棉花为中棉所63或待测棉花为候选的中棉所63;
所述CIR62引物对由序列表的序列1所示的单链DNA分子和序列表的序列2所示的单链DNA分子组成;所述CS62引物对由序列表的序列3所示的单链DNA分子和序列表的序列4所示的单链DNA分子组成;所述NAU1070引物对由序列表的序列5所示的单链DNA分子和序列表的序列6所示的单链DNA分子组成;所述NAU1102引物对由序列表的序列7所示的单链DNA分子和序列表的序列8所示的单链DNA分子组成;所述NAU1186引物对由序列表的序列9所示的单链DNA分子和序列表的序列10所示的单链DNA分子组成;所述NAU2026引物对由序列表的序列11所示的单链DNA分子和序列表的序列12所示的单链DNA分子组成;所述NAU2173引物对由序列表的序列13所示的单链DNA分子和序列表的序列14所示的单链DNA分子组成;所述NAU2277引物对由序列表的序列15所示的单链DNA分子和序列表的序列16所示的单链DNA分子组成;所述NAU2343引物对由序列表的序列17所示的单链DNA分子和序列表的序列18所示的单链DNA分子组成;所述NAU1196引物对由序列表的序列19所示的单链DNA分子和序列表的序列20所示的单链DNA分子组成;所述NAU1085引物对由序列表的序列21所示的单链DNA分子和序列表的序列22所示的单链DNA分子组成;所述NAU1255引物对由序列表的序列23所示的单链DNA分子和序列表的序列24所示的单链DNA分子组成;所述NAU1369引物对由序列表的序列25所示的单链DNA分子和序列表的序列26所示的单链DNA分子组成;所述NAU1233引物对由序列表的序列27所示的单链DNA分子和序列表的序列28所示的单链DNA分子组成;所述NAU1269引物对由序列表的序列29所示的单链DNA分子和序列表的序列30所示的单链DNA分子组成;所述NAU2272引物对由序列表的序列31所示的单链DNA分子和序列表的序列32所示的单链DNA分子组成;所述NAU1187引物对由序列表的序列33所示的单链DNA分子和序列表的序列34所示的单链DNA分子组成;所述NAU1375引物对由序列表的序列35所示的单链DNA分子和序列表的序列36所示的单链DNA分子组成;所述CS51引物对由序列表的序列37所示的单链DNA分子和序列表的序列38所示的单链DNA分子组成;所述NAU1028引物对由序列表的序列39所示的单链DNA分子和序列表的序列40所示的单链DNA分子组成;所述NAU2342引物对由序列表的序列41所示的单链DNA分子和序列表的序列42所示的单链DNA分子组成;所述NAU868引物对由序列表的序列43所示的单链DNA分子和序列表的序列44所示的单链DNA分子组成;所述HAU1300引物对由序列表的序列45所示的单链DNA分子和序列表的序列46所示的单链DNA分子组成;所述NAU6094引物对由序列表的序列47所示的单链DNA分子和序列表的序列48所示的单链DNA分子组成;所述DPL0238引物对由序列表的序列49所示的单链DNA分子和序列表的序列50所示的单链DNA分子组成;所述NAU1362引物对由序列表的序列51所示的单链DNA分子和序列表的序列52所示的单链DNA分子组成;所述NAU859引物对由序列表的序列53所示的单链DNA分子和序列表的序列54所示的单链DNA分子组成;所述HAU2786引物对由序列表的序列55所示的单链DNA分子和序列表的序列56所示的单链DNA分子组成;所述CGR6410引物对由序列表的序列57所示的单链DNA分子和序列表的序列58所示的单链DNA分子组成;所述NAU0478引物对由序列表的序列59所示的单链DNA分子和序列表的序列60所示的单链DNA分子组成;
标准1):采用所述CIR062引物对时,满足如下带型:在500bp和400bp之间具有2条带、在200bp和150bp之间具有2条带;
标准2):采用所述CS62引物对时,满足如下带型:大于500bp具有2条带、在500bp和400bp之间具有2条带、在150-250bp之间具有3条带;
标准3):采用所述NAU1070引物对时,满足如下带型:在250bp和200bp之间具有2条带、在200bp和150bp之间具有1条带;
标准4):采用所述NAU1102引物对时,满足如下带型:大于500bp具有2条带、在250bp和200bp之间具有2条带;
标准5):采用所述NAU1186引物对时,满足如下带型:在500bp和400bp之间具有2条带、在200bp和150bp之间具有2条带;
标准6):采用所述NAU2026引物对时,满足如下带型:在400bp以上具有5条带、在400bp和300bp之间具有1条带、在200bp和150bp之间具有3条带;
标准7):采用所述NAU2173引物对时,满足如下带型:在250bp和200bp之间具有3条带;
标准8):采用所述NAU2277引物对时,满足如下带型:在250bp和200bp之间具有1条带、在150bp和100bp之间具有1条带;
标准9):采用所述NAU2343引物对时,满足如下带型:在400bp和300bp之间具有1条带、在250bp和200bp之间具有2条带;
标准10):采用所述NAU1196引物对时,满足如下带型:在400bp和250bp之间具有4条带、在200bp和150bp之间具有2条带;
标准11):采用所述NAU1085引物对时,满足如下带型:在500bp和400bp之间具有2条带、在250bp和200bp之间具有2条带;
标准12):采用所述NAU1255引物对时,满足如下带型:在500bp和400bp之间具有1条带、在250bp和200bp之间具有2条带;
标准13):采用所述NAU1369引物对时,满足如下带型:在400bp以上具有5条带、在250bp和200bp之间具有2条带;
标准14):采用所述NAU1233引物对时,满足如下带型:大于500bp具有2条带、在300bp和250bp之间具有2条带;
标准15):采用所述NAU1269引物对时,满足如下带型:在500bp和400bp之间具有1条带、在150bp以下具有2条带;
标准16):采用所述NAU2272引物对时,满足如下带型:在500bp以上具有1条带、在500bp和400bp之间具有1条带、在200bp和150bp之间具有1条带;
标准17):采用所述NAU1187引物对时,满足如下带型:在500bp以上具有1条带、在200bp和150bp之间具有2条带;
标准18):采用所述NAU1375引物对时,满足如下带型:在500bp以上具有1条带、在250bp和200bp之间具有2条带;
标准19):采用所述CS51引物对时,满足如下带型:在500bp以上具有1条带、在200bp和150bp之间具有2条带;
标准20):采用所述NAU1028引物对时,满足如下带型:在500bp以上具有2条带、在250bp和200bp之间具有2条带;
标准21):采用所述NAU2342引物对时,满足如下带型:在500bp和400bp之间具有1条带、在300bp和250bp之间具有1条带、在200bp和150bp之间具有2条带;
标准22):采用所述NAU868引物对时,满足如下带型:在500bp以上具有1条带、在500bp和400bp之间具有1条带、在250bp和200bp之间具有1条带、在200bp和150bp之间具有上1条带;
标准23):采用所述HAU1300引物对时,满足如下带型:在400bp以上具有4条带、在250bp和200bp之间具有3条带;
标准24):采用所述NAU6094引物对时,满足如下带型:在400bp以上具有4条带、在250bp和200bp之间具有2条带、在200bp和150bp之间具有2条带;
标准25):采用所述DPL0238引物对时,满足如下带型:在500bp以上具有4条带、在500bp和400bp之间具有2条带、在250bp和200bp之间具有2条带;
标准26):采用所述NAU1362引物对时,满足如下带型:在500bp以上具有2条带、在250bp和200bp之间具有2条带;
标准27):采用所述NAU859引物对时,满足如下带型:在500bp以上具有2条带、在400bp和300bp之间具有2条带、在250bp和200bp之间具有2条带;
标准28):采用所述HAU2786引物对时,满足如下带型:在500bp以上具有2条带、在500bp和400bp之间具有1条带、在400bp和300bp之间具有1条带、在250bp和200bp之间具有2条带;
标准29):采用所述CGR6410引物对时,满足如下带型:在300bp和150bp之间具有5条带、在150bp和100bp之间具有3条带;
标准30):采用所述NAU0478引物对时,满足如下带型:在250bp和150bp之间具有4条带、在150bp和100bp之间具有3条带。
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