[发明专利]用于检测痛风相关SNP位点的等位基因特异性引物及其应用有效

专利信息
申请号: 201410119246.0 申请日: 2014-03-27
公开(公告)号: CN104059965A 公开(公告)日: 2014-09-24
发明(设计)人: 杨会勇;王清瑶;刁勇;徐超尘 申请(专利权)人: 华侨大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 泉州市文华专利代理有限公司 35205 代理人: 陈智海
地址: 362000 福*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 用于 检测 痛风 相关 snp 等位基因 特异性 引物 及其 应用
【说明书】:

技术领域

发明涉及一种用于检测痛风相关SNP位点的等位基因特异性引物,及利用所述引物对外周血样品进行SNP分型检测的方法。

背景技术

作为第三代DNA遗传标记,单核苷酸多态性(SNP)具有分布广、数量大、易于检测和在基因组中相对稳定的特点,其不同基因型与个人及群体对重大疾病易感性及发展进程有很大相关性。对SNP进行检测是现代医学重点发展方向,也是个性化医疗的基础之一,因此对SNP分型检测方法的研究更是成为疾病研究特别是多基因疾病研究领域中的热点。但是目前大多数SNP分型检测方法都需要先提取样品DNA,然后才能加以检测。在进行大样本检测时,对血液等组织样品进行基因组提取,不仅操作繁琐,耗时费力,而且增加了样品间交叉污染的可能性,同时也增加了操作人员的感染风险。因此,目前对SNP的检测及与疾病的相关性研究多在相关实验室进行。由于临床样品需要在各临床治疗单位采集,要将这些样品集中到相关实验室,其保存和运输均需要较高的要求如低温等,这无形中增加了SNP检测的工作量和成本,极大地限制了SNP检测分析技术在临床领域的研究与应用。而SNP这一疾病相关遗传标记的检测要想进一步发展,最终走向临床,一种快速、安全、准确、经济和易于推广的检测方法是必须的前提。

目前已有直接针对血样进行PCR扩增的技术,但是这些技术多需要电泳检测,对于大样本检测而言工作量依然很大,而且很多凝胶染料如溴化乙啶(EB)等对操作人员有潜在的危害,因此也无法大规模推广应用。

痛风是一种高尿酸血症,据研究表明其发病有家族聚集的特点,且发病率随着人民生活水平的提高而逐渐升高,并且有低龄化的趋势。经研究,痛风代谢相关基因SNP的存在使个体之间对痛风的易感性有着明显的差异,针对痛风相关SNP检测对痛风早期诊断具有很大意义,因此本发明以痛风相关的SNP为研究对象.

发明内容

本发明所要解决的技术问题之一在于提供一种用于检测痛风相关SNP位点的等位基因特异性引物,扩增效率高、特异性好。

本发明是通过以下技术方案之一解决上述技术问题之一的:一种用于检测痛风相关SNP位点的等位基因特异性引物,包括针对SNP位点Rs1333049序列设计的引物对Fw91、Rn191,及针对SNP位点Rs6855911序列设计的引物对Fw11、Rn111;各引物具体为:

(1)针对SNP位点Rs1333049序列设计的引物对:

引物Fw91序列:TGGACACTCTAATCCCTGCTGAAAG;

引物Rn191序列:CAGGCGGATGCTCCTCTGCAAGT

(2)针对SNP位点Rs6855911序列设计的引物对:

引物Fw11序列:GGCAGTGGACATCTTTCAGGGTG;

引物Rn111序列:GTCTTCATCTACTTGGCATCATCTC

本发明是通过以下技术方案之二解决上述技术问题之一的:一种用于检测痛风相关SNP位点的等位基因特异性引物,包括针对SNP位点Rs1333049序列设计的引物对Fw91、Rn291,及针对SNP位点Rs6855911序列设计的引物对Fw11、Rn211;各引物具体为:

(1)针对SNP位点Rs1333049序列设计的引物对:

引物Fw91序列:TGGACACTCTAATCCCTGCTGAAAG;

引物Rn291序列:CAGGCGGATGCTCCTCTGCAAGC

(2)针对SNP位点Rs6855911序列设计的引物对:

引物Fw11序列:GGCAGTGGACATCTTTCAGGGTG;

引物Rn211序列:GTCTTCATCTACTTGGCATCATCTT

本发明所要解决的技术问题之二在于提供一种利用所述的引物对外周血样品进行SNP分型检测的方法,建立了一种高效快速和低成本地对目的基因进行SNP分型检测的方法。

本发明是通过以下技术方案解决上述技术问题之二的:一种所述的引物对外周血样品进行SNP分型检测的方法,包括以下步骤:

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