[发明专利]用于检测痛风相关SNP位点的等位基因特异性引物及其应用有效
申请号: | 201410119246.0 | 申请日: | 2014-03-27 |
公开(公告)号: | CN104059965A | 公开(公告)日: | 2014-09-24 |
发明(设计)人: | 杨会勇;王清瑶;刁勇;徐超尘 | 申请(专利权)人: | 华侨大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 泉州市文华专利代理有限公司 35205 | 代理人: | 陈智海 |
地址: | 362000 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 痛风 相关 snp 等位基因 特异性 引物 及其 应用 | ||
1.一种用于检测痛风相关SNP位点的等位基因特异性引物,其特征在于:包括针对SNP位点Rs1333049序列设计的引物对Fw91、Rn191,及针对SNP位点Rs6855911序列设计的引物对Fw11、Rn111;各引物具体为:
(1)针对SNP位点Rs1333049序列设计的引物对:
引物Fw91序列:TGGACACTCTAATCCCTGCTGAAAG;
引物Rn191序列:CAGGCGGATGCTCCTCTGCAAGT;
(2)针对SNP位点Rs6855911序列设计的引物对:
引物Fw11序列:GGCAGTGGACATCTTTCAGGGTG;
引物Rn111序列:GTCTTCATCTACTTGGCATCATCTC。
2.一种用于检测痛风相关SNP位点的等位基因特异性引物,其特征在于:包括针对SNP位点Rs1333049序列设计的引物对Fw91、Rn291,及针对SNP位点Rs6855911序列设计的引物对Fw11、Rn211;各引物具体为:
(1)针对SNP位点Rs1333049序列设计的引物对:
引物Fw91序列:TGGACACTCTAATCCCTGCTGAAAG;
引物Rn291序列:CAGGCGGATGCTCCTCTGCAAGC;
(2)针对SNP位点Rs6855911序列设计的引物对:
引物Fw11序列:GGCAGTGGACATCTTTCAGGGTG;
引物Rn211序列:GTCTTCATCTACTTGGCATCATCTT。
3.一种利用权利要求1或2所述的引物对外周血样品进行SNP分型检测的方法,其特征在于:包括以下步骤:
步骤一:采用EDTA抗凝剂处理外周血,将外周血直接采集在EDTA抗凝管中,上下颠倒混匀,从血液样品中部吸取0.8μL作为模板;
步骤二:采用real-time PCR反应仪器进行real-time PCR扩增,其中反应体系和反应程序具体如下:
反应体系:反应体系的总体积为30μL,含有模板0.8μL、引物对中的两引物各0.4μmol/L、缓冲液3μL、MgCl23.5mmol/L、海藻糖2.5mmol/L、硫 酸铵10 mmol/L、甘油10%(w/v)、TW-20 0.1%(W/V)、dNTP 0.25 mmol/L、0.5x SYBR Green I染料和Taq DNA聚合酶1.8 U,其余成分为无菌水;其中,各组分的浓度均是以反应体系的总体积30μL为基准;
所述缓冲液为PCR buffer经NaOH调节pH值至9.3后的溶液;
所述引物对为下述引物对中的任一对:引物对Fw91、Rn191;引物对Fw91、Rn291;引物对Fw11、Rn111;引物对Fw11、Rn211;
反应程序为:
。
4.如权利要求3所述的利用引物对对外周血样品进行SNP分型检测的方法,其特征在于:所述步骤一中的模板也可采用滤纸干血样品,其制备方法如下:采集外周血时直接将0.8μL外周血滴在面积为0.5cm2的滤纸上,将带有血液样品的滤纸直接加入所述反应体系中。
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