[发明专利]牦牛胴体性状候选基因检测试剂盒及其检测方法无效
申请号: | 201410023938.5 | 申请日: | 2014-01-17 |
公开(公告)号: | CN103866001A | 公开(公告)日: | 2014-06-18 |
发明(设计)人: | 胡江;罗玉柱;刘秀;李少斌;潘红梅 | 申请(专利权)人: | 甘肃农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 兰州振华专利代理有限责任公司 62102 | 代理人: | 张真 |
地址: | 730070 *** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 牦牛 胴体 性状 候选 基因 检测 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种牦牛胴体性状候选基因PCR-SSCP检测引物,其特征在于:
ANK1-F:5’-TATTCACTTGGGGAACTCGTC-3';
ANK1-R:5’-TAATGGTCCCAGAGGTCAGTCA-3'。
2.一种牦牛胴体性状候选基因PCR-SSCP检测试剂盒,其特征在于包括有PCR反应液,ANK1*B的DNA标准样;去离子水,10%过硫酸铵,上样变性缓冲液,TEMED,12%的非变性聚丙烯酰胺凝胶Arc:Bis=37.5:1;
所述的上样变性缓冲液,包括98%去离子甲酰胺,0.025%溴酚蓝,0.025%二甲苯青,10mmol/L EDTA pH8.0;
所述的PCR反应液的反应液:总体积20μL,其中10×buffer缓冲液为2.0μL,Mg2+浓度为2.5mM,dNTPs的终浓度为100μM,引物ANK1-F:
5’-TATTCACTTGGGGAACTCGTC-3'和ANK1-R:
5’-TAATGGTCCCAGAGGTCAGTCA-3'各0.1μM,Taq聚合酶0.5U,ddH2O补充体积至20μL。
3.一种牦牛胴体性状候选基因PCR-SSCP检测方法,其特征在于,检测步骤如下:
(1)样品采集:牦牛颈静脉采血10ml,ACD抗凝,-20℃冻存;
(2)基因组DNA的提取:用常规的酚-氯仿抽提法从冻存血样中提取基因组DNA;
(3)聚合酶链式反应:
PCR反应体系:总体积20μL,其中10×buffer缓冲液为2.0μL,Mg2+浓度为2.5mM,dNTPs的终浓度为100μM,引物ANK1-F和ANK1-R各0.1μM,Taq聚合酶0.5U,模板DNA50ng,ddH2O补充体积至20μL;反应条件:预变性94℃5min,变性94℃30s,退火59℃30s,延伸72℃30s,共35个循环,最后延伸72℃7min;
引物序列为:
ANK1-F:5’-TATTCACTTGGGGAACTCGTC-3';
ANK1-R:5’-TAATGGTCCCAGAGGTCAGTCA-3';
(4)PCR产物的SSCP检测:
取2μl的PCR产物加入8μl的上样变性缓冲液,包括98%去离子甲酰胺、0.025%溴酚蓝、0.025%二甲苯青、10mmol/L EDTA pH8.0,98℃变性10min,立即冰浴10min;12%的非变性聚丙烯酰胺凝胶,350V电压条件下,4℃电泳22h,银染法显色后拍照;
(5)结果判断:
对牦牛ANK1基因第2内含子的PCR-SSCP检测,有5个等位基因,控制牦牛胴体性状的等位基因为ANK1*B;
对牦牛胴体性状无影响的等位基因为ANK1*A。
4.如权利要求2所述的牦牛胴体性状候选基因PCR-SSCP检测试剂盒的使用方法,其特征在于步骤为:
(A)待检牦牛基因组DNA1μL/50ng与试剂盒中PCR扩增液混合,反应条件:预变性94℃5min,变性94℃30s,退火59℃30s,延伸72℃30s,共35个循环,最后延伸72℃7min;
(B)用步骤(A)中扩增的PCR产物和ANK1*B的DNA标准样与试剂盒中SSCP检测试剂各组分混合进行SSCP检测;
(C)步骤(B)中检测到的带型与ANK1*B标准样带型一致的样品为携带控制牦牛胴体性状等位基因的个体。
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