[发明专利]PKCα-siRNA质粒载体的构建、筛选方法及应用在审
申请号: | 201410011031.7 | 申请日: | 2014-01-09 |
公开(公告)号: | CN103773789A | 公开(公告)日: | 2014-05-07 |
发明(设计)人: | 王金华;赵丽君 | 申请(专利权)人: | 江苏省肿瘤防治研究所 |
主分类号: | C12N15/66 | 分类号: | C12N15/66;C12Q1/68;G01N33/68 |
代理公司: | 北京纽乐康知识产权代理事务所(普通合伙) 11210 | 代理人: | 张朝元 |
地址: | 210000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | pkc sirna 质粒 载体 构建 筛选 方法 应用 | ||
1.一种PKCα-siRNA质粒载体的构建及其筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)设计及合成靶向PKCα的siRNA,进一步包括以下步骤:
1.1)根据基因库PKCα基因序列筛选出候选序列;
1.2)根据RNAi目标序列的选取原则优化siRNA序列;
1.3)确定靶向PKC-α的siRNA的目标序列;
2)构建PKC-α siRNA的重组质粒载体,进一步包括以下步骤:
2.1)退火连接单链目的基因片段;
2.2)Eco31I酶切质粒pEGFP-iLenti;
2.3)1%琼脂糖凝胶回收酶切线性空载体;
2.4)连接线性化质粒载体;
2.5)重组质粒转化大肠杆菌感受态细胞及扩增;
2.6)纯化重组质粒。
2.根据权利要求1所述的PKCα-siRNA质粒载体的构建及其筛选方法,其特征在于:步骤1.2)根据RNAi目标序列的选取原则优化siRNA序列,进一步包括以下步骤:
1.2.1)从转录本的AUG起始密码开始,寻找AA二连序列,记下其3’端的19个碱基序列,作为潜在的siRNA靶位点;
1.2.2)利用BLAST软件将候选序列和相应的基因组数据库进行比较,排除和其他编码序列或基因表达序列标签同源的候选序列;
1.2.3)选出合适的目标序列。
3.根据权利要求2所述的PKCα-siRNA质粒载体的构建及其筛选方法,其特征在于:步骤1.3)中确定的目标序列为:
5'-492 AAAGGCTGAGGTTGCTGAT-3',
5'-746 GAACAACAAGGAATGACTT-3',
5'-1114 AAGGATGTGGTGATTCAGGAT-3',
5'-1676 AATCCTTGTCCAAGGAGGCTG-3'。
4.权利要求1-3任一项所述的构建及其筛选方法获得的PKCα-siRNA 492质粒载体逆转肿瘤耐药表型的用途。
5.权利要求1-3任一项所述的构建及其筛选方法方法获得的PKCα-siRNA 492质粒载体提高肿瘤耐药细胞株的药物敏感性的用途。
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