[发明专利]用于预测年龄和鉴别诱发或者抑制早衰试剂的方法

权利要求书

1.一种基于受试者表观基因组预测受试者年龄的方法，该方法包括：

(a)获得受试者的生物样品；

(b)确定如图9、表S3、S4和/或S5任一所示的在受试者表观基因组中与年龄相关的一套表观遗传标记的甲基化状态；及

(c)对比受试者与年龄相关的一套表观遗传标记的甲基化状态和年龄相关的参考人群的相同标记的甲基化状态，以获得用于预测受试者年龄的一个值或者一个值的范围，从而基于受试者的表观基因组预测受试者的年龄。

2.权利要求1的方法，其中在(b)中，确定甲基化状态包括：

(a)从样品中分离基因组DNA或核DNA；

(b)使分离的基因组DNA或核DNA与一种或多种的探针反应，所述探针与未修饰的胞嘧啶的做出不同的反应，以便胞嘧啶转化为尿嘧啶；

(c)通过检测胞嘧啶或尿嘧啶的存在，分析在样品分离的基因组DNA或核DNA中的CpG二核苷酸胞嘧啶位置上的甲基化状态，胞嘧啶或尿嘧啶的存在表明在原CpG二核苷酸中分别存在5-甲基胞嘧啶或未经修饰的胞嘧啶；及

(d)从(c)中确定5-甲基胞嘧啶或未经修饰的胞嘧啶最初呈现在各自与年龄相关的表观遗传标记的比例，或者，可选择地，从(c)中确定最初呈现在各自与年龄相关的表观遗传标记5-甲基胞嘧啶与未经修饰的胞嘧啶的比或者未经修饰的胞嘧啶与5-甲基胞嘧啶的比。

3.权利要求1的方法，其中在(b)中，确定甲基化状态包括：

(a)从样品中分离基因组DNA或核DNA；

(b)用一种或多种限制性内切酶培育分离的基因组DNA或核DNA，所述的限制性内切酶(i)可识别特定DNA序列；(ii)受到CpG二核苷酸的影响，在内部或接近限制性内切酶的鉴别点或者分裂位点，及(iii)基于在所述CpG二核苷酸的胞嘧啶的C-5位位置上存在或不存在甲基基团DNA裂解方式的不同；

(c)在样品中分离的基因组DNA或核DNA中，通过表明在内部或接近限制性内切酶的鉴别点或者分裂位点的原CpG二核苷酸中存在5-甲基胞嘧啶的限制性内切酶在潜在的分裂位点的抗分裂，分析CpG二核苷酸C位的甲基化状态，限制性内切酶的分裂敏感性可以表明存在未修饰的胞嘧啶；

(d)从(c)中确定5-甲基胞嘧啶或未修饰的胞嘧啶最初呈现在各自与年龄相关的表观遗传标记的比例，或者，可选择地，从(c)中确定最初呈现在各自与年龄相关的表观遗传标记5-甲基胞嘧啶与未经修饰的胞嘧啶的比或者未经修饰的胞嘧啶与5-甲基胞嘧啶的比。

4.权利要求1的方法，在(b)中，由选自于图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的5个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的10个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的15个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的20个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的25个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的30个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的35个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的40个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的45个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的50个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的55个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的60个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的65个或以上的与年龄相关的表观遗传标记；选自图9，表格S3、S4和/或S5受试者表观基因组的70个或以上的与年龄相关的表观遗传标记，可确定甲基化状态。