[发明专利]基于PCR用于平行检测生物材料的测定在审
申请号: | 201380061190.1 | 申请日: | 2013-10-22 |
公开(公告)号: | CN104812915A | 公开(公告)日: | 2015-07-29 |
发明(设计)人: | 王林发;黄英勇;奥克托布尔·迈克尔·塞申斯;达尼埃尔·伊丽莎白·安德森 | 申请(专利权)人: | 新加坡国立大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N33/53;C07K19/00 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 郑斌;彭鲲鹏 |
地址: | 新加坡*** | 国省代码: | 新加坡;SG |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 pcr 用于 平行 检测 生物 材料 测定 | ||
1.用于检测和/或量化样品中至少一种靶分子的探针,其包含:
a)对所述靶分子之一具有特异性的至少一种结合伴侣;以及与其连接的
b)寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含:
i)第一序列,其与用于扩增所述寡核苷酸的正向引物序列互补;
ii)第二序列,其与用于扩增所述寡核苷酸的反向引物序列互补;
和
iii)位于所述第一序列和所述第二序列之间的是核苷酸鉴定序列或条形码,其中所述条形码充当所述靶分子的指示物并且由一定数目的以独特顺序排列的核苷酸组成,并且进一步,其中由所述核苷酸的数目和性质提供的所述核苷酸的独特排列的数目大于所述样品中靶分子的数目。
2.根据权利要求1所述的探针,其中所述结合伴侣具有对所述靶分子具有特异性的多种表位。
3.根据权利要求1或2所述的探针,其中所述结合伴侣本身包含至少一种肽和/或蛋白质,所述肽和/或蛋白质包含至少一种对待检测的所述靶分子具有特异性的表位。
4.根据权利要求3所述的探针,其中所述结合伴侣包含多种表位。
5.根据前述权利要求中任一项所述的探针,其中所述核苷酸鉴定序列或条形码包含若干个核苷酸,所述若干个核苷酸选自18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6和5个核苷酸。
6.根据前述权利要求中任一项所述的探针,其中所述核苷酸鉴定序列或条形码包括或包含至少一个用于切割所述核苷酸鉴定序列或条形码的限制性酶切位点。
7.根据前述权利要求中任一项所述的探针,其中所述探针还具有有助于在多重测定中鉴定所述靶分子的至少一种另外的标签或标记。
8.根据权利要求7所述的探针,其中所述标签或标记可通过PCR扩增并且因此包含短DNA序列。
9.根据权利要求7或8所述的探针,其中所述标签或标记在远离所述结合伴侣的位点处与所述探针连接。
10.根据权利要求9所述的探针,其中将所述标签或标记并入寡核苷酸b)的所述引物序列i)或ii)的至少之一中。
11.根据前述权利要求中任一项所述的探针,其中所述靶分子选自:肽、蛋白质、脂质或碳水化合物。
12.用于在多重测定中检测至少一个样品中的至少一种靶分子的多种探针,其中每种探针包含:
a)对至少一种所述靶分子具有特异性的至少一种结合伴侣;以及与其连接的
b)寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含:
i)第一序列,其与用于扩增所述寡核苷酸的正向引物序列互补;
ii)第二序列,其与用于扩增所述寡核苷酸的反向引物序列互补;
和
iii)位于所述第一序列和所述第二序列之间的核苷酸鉴定序列或条形码,其中所述条形码充当所述靶分子的指示物并且由一定数目的以独特顺序排列的核苷酸组成,并且进一步,其中由所述核苷酸的数目和性质提供的所述核苷酸的独特排列的数目大于所述样品中靶分子的数目;以及
c)有助于在多重测定中鉴定所述靶分子的标签或标记。
13.根据权利要求12所述的多种探针,其中所述第一序列和所述第二序列是多种探针共有的。
14.根据权利要求12或13所述的多种探针,其中至少两种所述探针具有不同结合伴侣,从而可鉴定至少一个样品中的多种不同靶分子。
15.根据权利要求12至14中任一项所述的多种探针,其中用于检测特定类型或组的靶分子的探针具有第一共有所述标签或标记;或者用于检测另一特定类型或组的靶分子的探针具有第二共有所述标签或标记;或者用于鉴定特定样品的探针具有另一共有所述标签或标记。
16.根据权利要求15所述的多种探针,其中所述标签或标记是在寡核苷酸b)的引物区i)或ii)的至少之一或两者中提供的短核苷酸序列。
17.根据权利要求12至16中任一项所述的多种探针,其中所述靶分子选自:肽、蛋白质、脂质或碳水化合物。
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