[发明专利]通过测序少量遗传物质的高通量基因分型

权利要求书

1.用于靶核酸的分析的方法，所述方法包括下列步骤：

i. 通过分离一个或少数靶细胞提供人或动物样品，其中靶核酸以100pg或更低的量存在，

ii.通过使用包括如下的方法生成所述靶核酸的简化代表性文库

*使用一种或多种限制性内切酶而使所述靶核酸片段化；

*连接衔接子至所述片段；和

*基于所述片段的尺寸选择所述衔接子-连接片段的子集，

iii.进行所述简化代表性文库的大规模平行测序，和

iv.通过分析由所述测序获得的结果而鉴定在所述靶核酸中的变体。

2.权利要求1的方法，其中选择所述衔接子-连接片段的子集是使用PCR-扩增而实施的。

3.权利要求1或2的方法，其中选择所述衔接子-连接片段的子集包括使用选择性引物的PCR扩增。

4.权利要求1的方法，其中生成简化代表性文库包括扩增片段的子集，当组合时，所述扩增片段的子集仅包含靶核酸的一部分。

5.权利要求1的方法，进一步包括

v.基于在所述靶核酸中鉴定的变体，构建基因型和/或单体型。

6.权利要求1的方法，其中提供样品进一步包括裂解所述一个或少数靶细胞。

7.权利要求1的方法，进一步包括所述靶核酸的全基因组扩增(WGA)。

8.权利要求1的方法，其中对所述简化代表性文库的测序确保在所述文库中的每个变体位置以高冗余度进行采样。

9.权利要求1和4-8中任一项的方法，其中所述一个或少数靶细胞来自非人类胚胎。