[发明专利]测定实时PCR循环阈值的通用方法

权利要求书

1.测定生长过程的生长曲线中的循环阈值Ct的方法，所述方法包括：

- 接收代表生长曲线的数据集，所述数据集包括多个数据点，每个数据点具有一对坐标值：循环数和在所述循环数处的生长过程的信号强度；

- 计算近似所述数据集的函数；

- 确定所述生长曲线的基线，所述基线是线性的；

- 用计算机系统计算其中所述函数的二阶导数中的最大值出现的函数的第一点；

- 用计算机系统确定在第一点相切于所述函数的切线；

- 用计算机系统计算所述切线和所述基线的交叉点，所述交叉点的循环数是循环阈值Ct。

2.权利要求1的方法，其中所述第一点具有xval的循环数和yval的信号强度，并且其中确定切线包括确定函数在{xval,yval}的斜率slp以获得作为yval+slp(x-xval)的切线，其中x是循环数。

3.权利要求1或2中任一项的方法，其中所述基线被确定为具有ax+b的函数形式，并且其中计算切线和基线的交叉点包括求解以下关于x的方程：

。

4.权利要求1-3中任一项的方法，其中所述基线是线性的。

5.权利要求1-4中任一项的方法，其中所述函数具有双S形的函数形式。

6.权利要求5的方法，其中所述双S形具有以下方程：

。

7.权利要求1-6中任一项的方法，其中所述生长过程是起始材料的扩增。

8.权利要求7的方法，其中所述扩增是聚合酶链式反应(PCR)扩增。

9.权利要求7或8中任一项的方法，其中所述起始材料包括目标核酸。

10.权利要求1-9中任一项的方法，其进一步包括：

- 在计算所述函数之前去除一部分数据点。

11.权利要求1-10中任一项的方法，其中所述基线从所述函数确定。

12.权利要求1-11中任一项的方法，其进一步包括：

- 计算所述函数的二阶导数。

13.计算机产品，所述计算机产品包括非临时性计算机可读介质，所述非临时性计算机可读介质存储多个指令，所述指令当执行时控制计算机系统以测定生长过程的生长曲线中的循环阈值Ct，所述指令包括：

- 接收代表生长曲线的数据集，所述数据集包括多个数据点，每个数据点具有一对坐标值：循环数和在所述循环数处的生长过程的信号强度；

- 计算近似所述数据集的函数；

- 确定所述生长曲线的基线，所述基线是线性的；

- 计算其中所述函数的二阶导数中的最大值出现的函数的第一点；

- 确定在第一点相切于所述函数的切线；

- 计算所述切线和所述基线的交叉点，所述交叉点的循环数是循环阈值Ct。

14.权利要求13的计算机产品，其中所述第一点具有xval的循环数和yval的信号强度，并且其中确定切线包括确定函数在{xval,yval}的斜率slp以获得作为yval+slp(x-xval)的切线，其中x是循环数。

15.权利要求13或14中任一项的计算机产品，其中所述基线被确定为具有ax+b的函数形式，并且其中计算切线和基线的交叉点包括求解以下关于x的方程：

。

16.权利要求13-15中任一项的计算机产品，其中所述函数具有双S形的函数形式，并且其中所述双S形具有以下方程：

，

其中所述指令进一步包括：

- 计算所述双S形函数的二阶导数。