[发明专利]用于急性髓细胞白血病的诊断、预后和治疗的方法和组合物

权利要求书

1.一种预测患有急性髓细胞白血病的患者的生存率的方法，所述方法包括：

(a)分析从所述患者分离的遗传样品是否存在细胞遗传学异常，以及在基因FLT3、NPM1、DNMT3A、NRAS、CEBPA、TET2、WT1、IDH1、IDH2、KIT、RUNX1、MLL-PTD、ASXL1、PHF6、KRAS、PTEN、P53、HRAS和EZH2的至少一者中是否存在突变；以及

(b)(i)如果在基因FLT3、MLL-PTD、ASXL1和PHF6中的至少一者中存在突变，则预测所述患者的生存率差，或者(ii)如果在IDH2R140中存在突变和/或在CEBPA中存在突变，则预测所述患者的生存率良好。

2.权利要求1所述的方法，还包括：

如果存在以下情况，则预测患有由细胞遗传学限定的中度风险AML的患者的生存率为中度：

(i)在基因FLT3-ITD、TET2、MLL-PTD、DNMT3A、ASXL1或PHF6的任意一者中都不存在突变；

(ii)在CEBPA和FLT3-ITD中存在突变，或

(iii)在FLT3-ITD中存在突变但是不存在8号染色体三体。

3.权利要求1所述的方法，还包括：

如果存在以下情况，则预测所述患有由细胞遗传学限定的中度风险AML的患者的生存率不良：

(i)在不具有FLT3-ITD突变的患者中，在TET2、ASXL1或PHF6或MLL-PTD中存在突变，或

(ii)所述患者具有FLT3-ITD突变、以及TET2、DNMT3A、MLL-PTD中的突变、或8号染色体三体。

4.权利要求2所述的方法，其中生存率中度的所述患者能够生存大约18个月到大约30个月。

5.一种预测患有急性髓细胞白血病的患者生存率的方法，所述方法包括：

(a)检验来自所述患者的血液或骨髓的遗传样品在所述样品中的基因FLT3、NPM1、DNMT3A、NRAS、CEBPA、TET2、WT1、IDH1、IDH2、KIT、RUNX1、MLL-PTD、ASXL1、PHF6、KRAS、PTEN、P53、HRAS和EZH2的至少一者中是否存在突变；以及

(b)如果在基因FLT3-ITD、MLL-PTD、ASXL1、PHF6的至少一者中存在突变，则预测所述患者的生存率差，或者如果在CEBPA中存在突变和/或在IDH2的R140位存在突变，则预测所述患者的生存率良好。

6.权利要求5所述的方法，其中在患有由细胞遗传学限定的中度风险急性髓细胞白血病且具有FLT3-ITD突变的患者之中，以下至少一者与所述患者的不良预后以及总生存率差有关：8号染色体三体、或在TET2、DNMT3A或MLL-PTD中具有突变。

7.权利要求5所述的方法，其中在患有由细胞遗传学限定的中度风险急性髓细胞白血病且在FLT3-ITD基因中具有突变的患者之中，CEBPA基因的突变与所述患者的改善的预后和总生存率有关。

8.权利要求5所述的方法，其中在同时具有IDH1/IDH2和NPM1突变的由细胞遗传学限定的中度风险AML患者中，与IDH1和IDH2均为野生型的NPM1-突变的患者相比，总生存率提高。

9.权利要求5所述的方法，其中在患有急性髓细胞白血病的患者之中，IDH2R140突变与总生存率提高相关。

10.权利要求1至9中任意一项所述的方法，其中生存率差或不良的所述患者(不良风险)能存活小于或等于约10个月。

11.权利要求1至9中任意一项所述的方法，其中生存率良好的所述患者能存活大约32个月或更长时间。

12.一种预测患有急性髓细胞白血病的患者的生存率的方法，所述方法包括：

(a)检验来自所述患者的血液或骨髓的遗传样品在基因ASXL1和WT1中是否存在突变；以及

(b)如果检测到突变的ASXL1和WT1基因，则确定所述患者患有或将患有原发性难治性急性髓细胞白血病。