[发明专利]一种快速检测五种β-地中海贫血突变的试剂盒及其应用无效

专利信息
申请号: 201310556987.0 申请日: 2013-11-11
公开(公告)号: CN103602736A 公开(公告)日: 2014-02-26
发明(设计)人: 尹爱华;张彦;何天文;陈汉彪;杜丽 申请(专利权)人: 广东省妇幼保健院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 代理人: 苏运贞;裘晖
地址: 511442 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 快速 检测 地中海贫血 突变 试剂盒 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种快速检测五种β-地中海贫血突变的试剂盒,其特征在于包括-28位点引物对、CDs41/42和CDs71/72位点引物对、CD17位点引物对和IVS-Ⅱ-654位点引物对:

-28位点引物对:

上游引物为:5’-CCAATCTACTCCCAGGAGCA-3’;

下游引物为:5’-ACTTCTCCTCAGGAGTCAGGT-3’;

CDs41/42和CDs71/72位点引物对:

上游引物为:5’-GAAGACTCTTGGGTTTCTGA-3’;

下游引物为:5’-AGAAAACATCAAGGGTCCCA-3’;

CD17位点引物对:

上游引物为:5’-AGACACCATGGTGCACCTGAC-3’;

下游引物为:5’-GGCAGAGAGAGTCAGTGCCTA-3’;

IVS-Ⅱ-654位点引物对:

上游引物为:5’-GTGTACACATATTGACCAAATCAGGGTA-3’;

下游引物为:5’-GGTAGCTGGATTGTAGCTGC-3’。

2.根据权利要求1所述的快速检测五种β-地中海贫血突变的试剂盒,其特征在于:所述的试剂盒将-28位点引物对及CDs41/42和CDs71/72位点引物对按1:1的比例在放置在一起,CD17位点引物对、IVS-Ⅱ-654位点引物对分别放置。

3.根据权利要求1所述的快速检测五种β-地中海贫血突变的试剂盒,其特征在于:所述的试剂盒还包含Taq DNA聚合酶、dNTP、染料、MgCl2、PCR缓冲液、水和对照模板;

所述的染料为SYBR Green I;

所述的水为双蒸水或超纯水;

所述的对照模板包括正常样本和已知阳性对照突变位点样本。

4.根据权利要求3所述的快速检测五种β-地中海贫血突变的试剂盒,其特征在于:所述的正常样本为经测序证实的无β-珠蛋白基因突变的人DNA模板样本;

所述的已知阳性对照突变位点样本为-28、CD17、CDs41/42、CDs71/72、IVS-Ⅱ-654位点突变的纯合子及杂合子的人的阳性DNA模板。

5.根据权利要求1所述的快速检测五种β-地中海贫血突变的试剂盒,其特征在于:含有-28位点引物对、CDs41/42和CDs71/72位点引物对、CD17位点引物对、IVS-Ⅱ-654位点引物对、2倍浓度的Master Mix、MgCl2、水和对照模板;

所述的2倍浓度的Master Mix为罗氏制药有限公司生产的LightCycler480High Resolution Melting Master中的浓度为2×conc.的Master Mix,其中含有Taq DNA聚合酶、PCR缓冲液、dNTP和染料。

6.一种应用上述试剂盒进行快速检测五种β-地中海贫血突变的使用方法,其特征在于包括以下步骤:

(1)抽提样本基因组DNA,制备DNA模板;

(2)配制反应体系,具体如下:取3个PCR反应管,PCR反应管1中加入-28位点的引物对及CDs41/42和CDs71/72位点的引物对、DNA模板、2倍浓度的Master Mix、MgCl2和水;PCR反应管2中加入CD17位点的引物对、DNA模板、2倍浓度的Master Mix、MgCl2和水;PCR反应管3中加入IVS-Ⅱ-654位点的引物对、DNA模板、2倍浓度的Master Mix、MgCl2和水;

(3)分别用步骤(2)配制的反应体系进行PCR扩增,分别得到相应的PCR产物,同时扩增含有对照模板的反应体系;

(4)将步骤(3)得到的PCR产物使用LightCycler480进行高分辨率熔解曲线分析;

(5)结果判断:以无β-珠蛋白基因突变的正常样本曲线作为基线,得到对应的熔解曲线图,与阳性对照突变位点熔解曲线图进行比对从而确定是否存在突变,熔解曲线形状与已知阳性对照突变位点熔解曲线图不一致的,需重新检测或者测序明确基因型。

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