[发明专利]用于鉴定条斑紫菜耐高温品系TM-18的方法、分子标记及其构建方法无效
| 申请号: | 201310280334.4 | 申请日: | 2013-07-04 |
| 公开(公告)号: | CN103343122A | 公开(公告)日: | 2013-10-09 |
| 发明(设计)人: | 严兴洪;贾威;黄林彬 | 申请(专利权)人: | 上海海洋大学 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海伯瑞杰知识产权代理有限公司 31227 | 代理人: | 吴瑾瑜 |
| 地址: | 201306 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 鉴定 紫菜 耐高温 品系 tm 18 方法 分子 标记 及其 构建 | ||
1.用于鉴定条斑紫菜耐高温品系TM-18的分子标记,其特征在于,含有如SEQID No.1所示的核苷酸序列。
2.权利要求1所述用于鉴定条斑紫菜耐高温品系TM-18的分子标记,其特征在于,核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
3.用于鉴定条斑紫菜耐高温品系TM-18的分子标记的特异性扩增引物,其特征在于,正向引物和反向引物的核苷酸序列分别如SEQ ID No.2和No.3所示。
4.权利要求3所述的特异性扩增引物应用于鉴定条斑紫菜耐高温品系TM-18。
5.鉴定条斑紫菜耐高温品系TM-18的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)总DNA的提取:收集新鲜的待鉴定条斑紫菜叶状体,液氮研磨,提取总DNA;
(2)使用权利要求3所述的特异性扩增引物,对步骤(1)中所获得的总DNA进行PCR扩增;
(3)取步骤(2)的PCR扩增产物进行电泳检测,PCR扩增产物中出现长度为341bp的特异性片段,则所鉴定的条斑紫菜为条斑紫菜耐高温品系TM-18;若没有出现341bp的特异性片段,则所鉴定的条斑紫菜不是条斑紫菜耐高温品系TM-18。
6.权利要求5所述鉴定条斑紫菜耐高温品系TM-18的方法,其特征在于,步骤(2)所述PCR扩增的条件为:93~95℃预变性4.5~6min;93~94.5℃变性27~35s,51~52.5℃退火40~50s,71~73℃延伸40~50s,以上三个步骤重复32~40个循环;71~73℃延伸6~8min。
7.权利要求5所述鉴定条斑紫菜耐高温品系TM-18的方法,其特征在于,步骤(2)所述PCR扩增的条件为:94℃预变性5min;94℃变性30s,52℃退火45s,72℃延伸45s,以上三个步骤重复35个循环;72℃延伸7min。
8.权利要求1或2所述用于鉴定条斑紫菜耐高温品系TM-18的分子标记的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)总DNA的提取:收集新鲜的条斑紫菜叶状体,液氮研磨,提取总DNA;
(2)SRAP标记分析:使用SRAP成套引物对步骤(1)中所得总DNA进行SRAP-PCR扩增;引物组合ME1/EM6的扩增产物即为鉴定条斑紫菜耐高温品系TM-18的分子标记TM1;
所述引物ME1序列为:
5’-TGAGTCCAAACCGGATA-3’
所述引物EM6序列为:
5’-GACTGCGTACGAATTGCA-3’。
9.权利要求8所述的构建方法,其特征在于,步骤(2)所述SRAP-PCR反应程序为:93~95℃预变性4.5~6min;93~95℃变性50s~1min,34~36℃退火50s~1min,71~73℃延伸50s~1min,重复4~7个循环;93~95℃变性50s~1min,47~48.5℃退火50s~1min,71~73℃延伸1.5~2.5min,重复32~40个循环;71~73℃延伸9~12min。
10.权利要求8所述的构建方法,其特征在于,步骤(2)所述SRAP-PCR反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性1min,35℃退火1min,72℃延伸1min,重复5个循环;94℃变性1min,48℃退火1min,72℃延伸2min,重复35个循环;72℃延伸10min。
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