[发明专利]基于证据的胃癌预后分子标记物筛选方法有效
| 申请号: | 201310237953.5 | 申请日: | 2013-06-13 |
| 公开(公告)号: | CN103310129B | 公开(公告)日: | 2017-03-01 |
| 发明(设计)人: | 余科;张珊珊;谭海清;宓娅娜;赵凌云 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
| 主分类号: | G06F19/24 | 分类号: | G06F19/24 |
| 代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司33212 | 代理人: | 金祺 |
| 地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 证据 胃癌 预后 分子 标记 筛选 方法 | ||
1.基于证据的胃癌预后分子标记物筛选方法,其特征是包括以下步骤:
1)、为胃癌预后生物标记物的实验研究制定纳入标准:
包括在研究设计、研究人群、临床效应指标、生物标记物种类这些方面进行限制;
2)、制定研究证据检索策略:
全面而系统地检索临床研究证据数据库,包括PubMed、Embase、中国生物医学文献数据库(CBM),万方数据库和中国知识资源总库(CNKI);只检索以人为研究对象的研究,研究类型和出版语言不受限制;检索纳入研究的参考文献;
3)、初步筛选预后生物标记物:
将检索到的研究证据按照纳入标准,确定胃癌预后生物标记物的种类和数量,构建生物标记物数据库;
生物标记物按照研究设计方法、研究的数量和研究的样本量进行筛选,筛选出满足以下任意一个条件的生物标记物:(1)具有随机对照实验;(2)研究数量≥3并且研究样本量≥500;
4)、研究资料提取:
由2名研究者按照预先制定的研究资料提取内容及标准独立进行资料提取以及交叉核对,确保研究资料提取和质量评价的结果具有一致性,意见不一致时交由第3位研究者确定;
5)、 试验研究质量评估:
使用Newcastle-Ottawa Scale对纳入的研究进行质量评估,包括评价患者选择、退出随访、确认生物标记物状态的准确性、诊断准确性、预后指标评估的准确性和控制混杂因素的准确性;
6)、 标准化数据处理:
采用标准化统计策略,合并测量指标,评估生物标记物对胃癌预后的效能和价值;若存在系统综述和Meta分析研究,直接将数据列入最终结果,否则进行统计分析;标准化统计策略主要包括:Meta分析,亚组分析,敏感性分析,Meta回归分析,异质性评估,累积Meta分析,发表偏倚评估;
7)、 预后生物标记物筛选:
经过标准化数据处理的胃癌预后生物标记物研究,按照研究设计方法、研究质量、样本量、预后指标结果的显著性进行筛选,获得具有潜在应用价值的胃癌预后生物标记物;
8)、 根据筛选标准,筛选出具有潜在应用价值的胃癌预后生物标记物,并描述预后价值。
2.根据权利要求1所述的基于证据的胃癌预后分子标记物筛选方法,其特征是:
所述步骤7)的筛选标准如下:(1)具有一系列随机对照实验研究,合并样本量≧500例,OS、临床病理特征、PFS、复发、毒性等预后指标显著(p<0.05),无发表偏倚(p>0.05);(2)只有单篇随机对照实验研究,样本量≥300例,失访率<20%,研究质量高,OS、临床病理特征、PFS、复发、毒性等预后指标显著(p<0.05);(3)具有多个实验研究,合并样本量≥1000,OS、临床病理特征、PFS、复发、毒性等预后指标显著(p<0.05),无发表偏倚(p>0.05);(4)只有单个多中心大样本研究,样本量≧500例,失访率<20%,研究质量高,OS、临床病理特征、PFS、复发、毒性等预后指标显著(p<0.05)。
3.根据权利要求1或2所述的基于证据的胃癌预后分子标记物筛选方法,其特征是:
所述步骤1)为:
所述证据纳入标准为:(1)研究人群为胃癌患者;(2)评估生物标记物与临床效应指标之间的关系,临床效应指标必须是总体生存期(OS)、无进展生存期(PFS)、化疗药物敏感性、复发、毒副作用、临床病理特征等中的一种或几种;(3)生物标记物为基因突变、基因多态性、mRNA表达水平、蛋白表达水平、microRNA和微卫星中的一种或几种;(4)提供明确的生物标记物检测方法;(5)研究设计必须随机对照实验、横截面研究、队列研究或者系统综述(满足上述至少一种),分为前瞻性研究和回顾性研究;
排除下列研究:(1)没有对照组;(2)无分子标记物检测方法;(3)重复的研究;(4)细胞或者动物实验;(5)综述文章;(6)没有研究生物标记物与胃癌预后关系。
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