[发明专利]用软件建立体内屏障晶体结构模型及其制备方法和应用

权利要求书

1.一种用软件建立体内屏障晶体结构模型,其特征是用计算机软件NAMD或DS或MS或GROMACS或AMBER或VMD或CHARMM建立血脑屏障或皮肤屏障或胃肠道或鼻、口腔粘膜屏障或神经突触前后膜或线粒体或叶绿体膜或内质网膜或核膜晶胞结构模型。

2.   根据权利要求1所述用软件建立体内屏障晶体结构模型的制备方法,其特征是由以下步骤构成:

(1).取大豆磷脂或卵磷脂或二棕榈酰磷脂酸 DPPA或二棕榈酰磷脂酰胆碱DPPP或二棕榈酰磷脂酰乙醇胺DPPE或二棕榈酰磷脂酰胆碱DPPC或二棕榈酰磷脂酰甘油 DPPG或二棕榈酰磷脂酰丝氨酸 DPPS或双肉豆蔻磷脂酸DMPA或双肉豆蔻磷脂酰丝氨酸DMPS或双肉豆蔻磷脂酰乙醇胺 DMPE或双肉豆蔻磷脂酰胆碱 DMPC或双肉豆蔻磷脂酰甘油DMPG或二月桂酰磷脂酰甘油DLPG或二月桂酰磷脂酰胆碱DLPC或二油酰磷脂酰甘油DOPG或二油酰磷脂酰胆碱DOPC或二硬脂酰磷脂酰胆碱DSPC或二硬脂酰磷脂酰甘油DSPG或胆固醇，单独或按不同比例混合建立双层脂质体晶胞结构模型;

(2).将(1)建立的脂质双分子层晶胞结构中，插入血脑屏障或皮肤屏障或胃肠道、鼻、口腔粘膜屏障或神经突触前后膜或线粒体膜或叶绿体膜或内质网膜或核膜上表达的特异性相关蛋白即脂蛋白或糖蛋白后，模拟血脑屏障或皮肤屏障或胃肠道、鼻、口腔粘膜屏障或神经突触前后膜或线粒体膜或叶绿体膜或内质网膜和核膜屏障模型;

(3).将(2)建立的屏障模型结构中加入不同的药物即中药有效成分或中药复方或化合物或蛋白质或多肽、或小肽或基因或microRNA后，用计算机软件NAMD或DS或MS或GROMACS或AMBER或VMD或CHARMM进行分子动力学模拟，通过分析均方位移Mean Square Displacement, MSD 计算出扩散系数，检测它们血脑屏障或皮肤屏障或胃肠道、鼻、口腔粘膜屏障或神经突触前后膜或线粒体膜或叶绿体膜或内质网膜或核膜透过作用能力的大小; 

(4).加入川芎嗪实施对应用血脑屏障透过作用。

3.    权利要求1所述用软件建立体内屏障晶体结构模型在药物筛选中的应用, 该模型平台，能快速有效地筛选出透血脑屏障或皮肤屏障或胃肠道、鼻、口腔粘膜屏障或神经突触前后膜或线粒体膜或叶绿体膜或内质网膜或核膜的有效药物，用于进一步的药理实验。