[发明专利]一种产气肠杆菌特异性PCR检测引物有效
申请号: | 201210412342.5 | 申请日: | 2012-10-25 |
公开(公告)号: | CN102952880A | 公开(公告)日: | 2013-03-06 |
发明(设计)人: | 陈雪峰;杨国梁;王军毅;高强;张宇飞;黄雪娜 | 申请(专利权)人: | 浙江省淡水水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/10;C12N15/11 |
代理公司: | 湖州金卫知识产权代理事务所(普通合伙) 33232 | 代理人: | 裴金华;戴心同 |
地址: | 313000 浙江省湖州市吴*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 产气肠杆菌 特异性 pcr 检测 引物 | ||
技术领域
本发明涉及一种用于检测的引物,具体涉及一种用于检测产气肠杆菌 PCR检测的引物,属于生物检测技术领域。
背景技术
产气肠杆菌(Enterobacter aerogenes)为革兰氏阴性菌,主要存在于人和动物的肠道内,亦可存在水、土壤及腐败物中,同时它也是一种重要的条件致病菌。当宿主机体状态改变或细菌进入肠道以外的部位,往往会引起感染。近年来,由于第三代和第四代头孢菌素、碳青酶烯类等超广谱抗菌药物在临床上的广泛使用,使该菌的耐药菌株明显增多,有些菌株已经表现为多重耐药。多重耐药使得临床上对该菌引起的疾病的治疗趋于复杂化。多重耐药的一个主要原因是未能在第一时间辨明病原菌,在不明病原菌的情况下,滥用药物,从而导致细菌的耐药性的出现,导致多重耐药的产生。因此,临床上迫切需要一种快速、精准的检测手段,辨明病原,从而针对性地防治。
传统的细菌鉴定方法主要是通过细菌生理生化特性进行分类,需要大量的时间进行生理生化反应的结果判读,不利于及时诊断病因,查找病原。PCR技术具有操作简便、快速、灵敏度高、特异性强等特点,已逐步应用于细菌的快速检测。然而,通过对现有技术的文献检索发现,目前尚未有利用PCR技术检测产气肠杆菌的报道。
发明内容
本发明的目的在于提供一种产气肠杆菌特异性PCR检测引物。该引物可用于产气肠杆菌的PCR检测,具有检测时间短,成本低,检测结果特异性高,结果易判断,实用性强。
本发明是通过以下的技术方案实现的:
一种产气肠杆菌特异性PCR检测引物,包括正向引物和反向引物:
正向引物F:5’-GTAACCGGTGAAACCGAAAGC-3’
反向引物R:5’- GATGCCGCCTTCGTAGTGGAAATGG -3’。
所述引物在用于产气肠杆菌的PCR检测时,具体如下操作:
步骤一,提取样品DNA,PCR法扩增;
PCR检测体系为20 μL的反应体系,具体为:
10×PCR buffer(含Mg2+) 2 μL,
2.5mmol/L的dNTP 1.6 μL,
5 U/μL 的rTaq酶 0.16 μL,
20 μM的引物对 0.8 μL,
模板DNA 1-2 μL,
最后用灭菌双蒸水补至20 μL;
PCR检测反应程序为:94℃预变性4min;进入循环,94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸45s,30个循环;72℃延伸5min,降温至4℃,结束。
步骤二,取10μL PCR扩增产物,1%琼脂糖凝胶电泳检测,判断样品种是否含有产气肠杆菌;所述判断具体为:1%凝胶电泳电泳检测扩增产物,若电泳结果在201bp出现单一条带,则说明样品种含有产气肠杆菌;反之,则样品中不含产气肠杆菌。
与现有技术相比,本发明具有如下的有益效果:采用本发明的检测方法检测产气肠杆菌所需时间短、特异性强、灵敏度高。本发明避免了采用传统鉴定方法操作繁琐、耗时长、准确性低、检出率低等缺点。同时,本发明所涉及的仪器设备、试剂等较为常用,一般基层实验室即可开展检测工作,实用性更强。本发明检测靶点具有单一特异性,检测结果特异,易于判定。
附图说明
图1为实施例中PCR检测方法特异性评估实验凝胶电泳结果图;
图2为实施例中PCR检测方法灵敏度评价实验凝胶电泳结果图;
图3为实施例中临床样品检测凝胶电泳结果图。
具体实施方式
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件例如Sambrook等分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Habor Laboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
步骤一,设计特异性扩增产气肠杆菌的引物对
引物序列为: F:5’-GTAACCGGTGAAACCGAAAGC-3’
R:5’- GATGCCGCCTTCGTAGTGGAAATGG -3’;
步骤二,DNA模板制备
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