[发明专利]革兰氏阳性细菌核酸提取方法有效
申请号: | 201210162646.0 | 申请日: | 2012-05-23 |
公开(公告)号: | CN102796727A | 公开(公告)日: | 2012-11-28 |
发明(设计)人: | 张岩;孙义民;杨萍;张亮 | 申请(专利权)人: | 博奥生物有限公司;清华大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68;C12R1/445;C12R1/34 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 102206 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 革兰氏 阳性 细菌 核酸 提取 方法 | ||
1.一种破除革兰氏阳性细菌的细胞壁的试剂,由提取液A和提取液B组成;
所述提取液A按照如下方法制备:将Tris、EDTA、SDS、Tween 80、Triton X-100、Brij 58、3-[(3-胆固醇氨丙基)二甲基氨基]-1-丙磺酸、十二烷基肌氨酸钠、β-巯基乙醇和水混合,得到提取液A,所述Tris在所述提取液A中的浓度为5-20mM;所述EDTA在所述提取液A中的浓度为5-20mM;所述SDS、所述Tween 80、所述Triton X-100、所述Brij 58、所述3-[(3-胆固醇氨丙基)二甲基氨基]-1-丙磺酸、所述十二烷基肌氨酸钠在所述提取液A中的浓度均为0.05%-0.2%(体积百分含量);所述β-巯基乙醇在所述提取液A中的浓度为0.1-0.5%(体积百分含量);
所述提取液B按照如下方法制备:将水饱和酚、乙醇和吡咯烷酮混合,得到提取液B,所述水饱和酚、所述乙醇和所述吡咯烷酮的体积比为(99-98)∶1∶1。
2.根据权利要求1所述的试剂,其特征在于:
所述提取液A和所述提取液B均为独立包装;
所述提取液A的pH值为7.2-7.8,所述提取液A的pH值具体为7.5;
所述提取液B的pH值为5-8,所述提取液B的pH值具体为7.5。
3.根据权利要求1或2所述的试剂,其特征在于:
所述提取液A中,所述Tris在所述提取液A中的浓度为10mM;
所述EDTA在所述提取液A中的浓度为10mM;
所述SDS、所述Tween 80、所述Triton X-100、所述Brij 58、所述3-[(3-胆固醇氨丙基)二甲基氨基]-1-丙磺酸、所述十二烷基肌氨酸钠在所述提取液A中的浓度均为0.1%;
所述β-巯基乙醇在所述提取液A中的浓度为0.1%;
所述提取液B中,所述水饱和酚、所述乙醇、所述吡咯烷酮的体积比为98∶1∶1。
4.一种破除革兰氏阳性细菌的细胞壁的方法,包括如下步骤:
先将权利要求1-3中任一所述的试剂中的所述提取液A与革兰氏阳性细菌混匀,再加入权利要求1-3中任一所述的试剂中的所述提取液B,混合,反应,得到反应液;离心收集上层水相,即得到去除细胞壁革兰氏阳性细菌裂解液。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:
所述革兰氏阳性细菌的菌体湿重、所述提取液A和所述提取液B的配比为1μg-5g∶400μl∶400μl,所述革兰氏阳性细菌的菌体湿重、所述提取液A和所述提取液B的配比具体为5mg∶400μl∶400μl。
6.根据权利要求4或5所述的方法,其特征在于:
所述反应时间为12-18min;所述反应时间具体为15min;
所述反应温度为60-70℃;所述反应温度具体为65℃。
7.根据权利要求4-6中任一所述的方法,其特征在于:
所述离心的温度为0-4℃;所述离心的温度具体为4℃;
所述离心的时间为5-10分钟;所述离心的时间具体为5、8或10分钟;
所述离心的转速为10000-15000rpm,所述离心的转速具体为12000rpm,离心半径为10cm。
8.根据权利要求4-7中任一所述的方法,其特征在于:在所述反应后和所述离心前,还包括如下步骤:将所述反应液静置的步骤;所述静置温度为0-4℃,所述静置时间为2-5分钟;所述静置温度具体为0℃,所述静置时间具体为5分钟。
9.根据权利要求4-8中任一所述的方法,其特征在于:所述混合的方式采用震荡混匀,所述混合的时间为10-15分钟;所述混合的时间具体为15分钟。
10.根据权利要求4-9中任一所述的方法,其特征在于:在所述离心收集上层水相的步骤后,还包括将所述上层水相与氯仿混匀,得到混合液,离心收集上清液,得到去除细胞壁革兰氏阳性细菌裂解液。
11.根据权利要求4-10中任一所述的方法,其特征在于:
所述上层水相与所述氯仿的体积比为1∶(0.8-1.5),所述上层水相与所述氯仿的体积比具体为1∶1。
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