[发明专利]一种北方根结线虫LAMP快速检测方法及应用有效
申请号: | 201210070924.X | 申请日: | 2012-03-16 |
公开(公告)号: | CN102586461A | 公开(公告)日: | 2012-07-18 |
发明(设计)人: | 彭德良;何旭峰;彭焕 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京兆君联合知识产权代理事务所(普通合伙) 11333 | 代理人: | 胡敬红 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 北方 线虫 lamp 快速 检测 方法 应用 | ||
1.一种北方根结线虫LAMP快速检测方法,以北方根结线虫DNA为模板,LAMP反应体系试剂中包括引物混合物、反应缓冲液和反应酶,所述引物混合物有如下引物:
①MHF3:5’-GAATATGAGGTGACATGTTAGG-3’,
②MHB3:5’-TCAATGTTTCTGCAGTTCG-3’,
③MHFIP:5’-TGAAAAAAATATTGCTGGCGTCCACCTTAATCGGGTTTAAGACT-3’,
④MHBIP:5’-TCTATCCTTATCGGTGGATCACTCCACAAATTATCGCAGTTAGCT-3’,
⑤MHLB:5’-GGCTCGTGGATCCATGAAGAACG-3’。
2.根据权利要求1所述的检测方法,所述引物混合液为:外引物MHF3和MHB3各0.2μmol/L,内引物MHFIP和MHBIP各1.6μmol/L,环引物MHLB为0.4μmol/L,所述反应缓冲液:6mmol/L dNTP,20mmol/L Tris-HCl的pH为8.8,10mmol/L KCl,5mmol/LMgSO4,10mmol/L(NH4)2SO4,0.1%Triton x-100;反应酶:8U Bst DNA聚合酶大片段。
3.根据权利要求1或2所述的检测方法,还包括观察检测结果步骤,其特征在于:在LAMP反应完的体系加入显色剂,观察显色情况。
4.根据权利要求3所述的检测方法,所述显色剂为SYBR green I。
5.根据权利要求1或2所述的检测方法,还包括观察检测结果步骤,其特征在于:取LAMP扩增产物在琼脂糖凝胶电泳中电泳可观察到梯形带。
6.根据权利要求1或2所述的检测方法,还包括观察检测结果步骤,其特征在于:引物混合物中MHFIP或MHBIP的5’端带有生物素标记,在LAMP反应产物中加入20pmol/L的FITC标记的探针,63℃保温5min,冷却到室温,取8μL的杂交液加入100μl PBS缓冲液,将LFD试纸浸入到杂交后的溶液中,通过观察LFD试纸上的条带,所述探针序列为:
MH-FITC-Probe:5’-CTCGTGGATCCATGAAGAAC-3’,MH-FITC-Probe的5’端用FITC标记。
7.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,所述LAMP反应条件:将引物混合液、反应缓冲液、反应酶混合均匀后加入1μl DNA模板后,61~65℃保温30~60min,82℃保温5min。
8.根据权利要求1所述的检测方法,所述北方根结线虫DNA的提取试剂组分配方如下:
1)WLB溶液:500mmol/L KCl,10mmol/L Tris-HCl,15mmol/L MgCl2,1.0mmol/L DTT,4.5%Tween20,等体积混匀,过滤灭菌;
2)蛋白酶K:20mg/mL蛋白酶K。
9.根据权利要求8所述的检测方法,所述北方根结线虫DNA的提取方法为:挑取单头根结线虫放入装有10μlddH2O的0.2mL离心管中,加入8μl的WLB溶液,2μl蛋白酶K溶液,放入液氮中,再放入37℃水浴锅中,待融化后放入液氮中,重复6~7次,然后在-80℃下冷冻30min;将离心管转移到65℃下温育90min,95℃反应10min处理后上清液作为线虫DNA模板直接用于LAMP和PCR反应。
10.权利要求1-9所述任一检测方法在诊断植物、土壤的北方根结线虫感染情况或鉴别北方根结线虫中的应用。
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