[发明专利]IL-6R基因SNP位点的用途

说明书

技术领域

本发明属于生物医药技术领域，具体涉及IL-6R基因SNP位点的用途及其试剂盒和检查方法。

背景技术

类风湿关节炎(RA)是以对称性、多关节、小关节病变为主的慢性全身性自身免疫性疾病，以关节滑膜炎为主要病理特征。作为一种常见的，慢性的，系统炎症性自身免疫性疾病，其发病率约为0.4％～1％左右，80％患者发病年龄在20～45岁，男女之比为1∶2.4。类风湿关节炎发展至晚期可致关节强直和畸形，功能严重受损甚至残废，严重影响了患者的生活质量，因此该疾病每年给社会造成巨大的财力物力损失。类风湿性关节炎与环境、细菌、病毒、遗传、性激素及精神状态等因素密切相关。

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)是指存在于某一(些)群体、正常个体的基因组DNA中单碱基的序列差异，并且在人群中的分布频率至少要在1％以上(Brookes AJ.Gene，1999，234(2)：177-186)，人类遗传基因的多态性在遗传信息上的本质表现，90％以上是由SNP所引起的。因为其多态信息量大，目前已成为继限制性片段长度多态性(RFLP)标志和微卫星即短串联重复(STR)标志后的第三代遗传标志。

从基础医学到临床医学的各个领域，SNP都存在巨大的应用价值。SNP的研究为基因诊断，尤其是疾病的早期诊断提供更多依据有重要意义。SNP由于其分布广、密度高而被期望在诸如癌症、糖尿病、高血压、忧郁症和哮喘等复杂疾病的研究中起重要作用，这些复杂疾病是多个遗传变异位点与环境因子共同作用的结果，由于发病原因复杂，涉及的基因数量多，已成为国际上疾病基因组学研究的重点。目前已有实验将SNP应用于肿瘤预后及易感性的判断，例如肺癌致癌物的易感性存在个体差异，即肺癌的基因易感性，研究较多的是代谢酶基因多态性，如人细胞色素P450-CYP450和髓过氧化酶MPO等。法国研究者证实，MPO基因启动子(463G/A)多态性导致该基因较低的表达，可以降低肺癌患病的危险性(Chewier I，Stucker l，Houllier AM，et al.pharmacogenetics，2003，13(2)：729-739)。日本学者发现了HER-2基因编码区的一个SNP与胃癌的发展及恶性程度有关(Kuraoka K，Matsumura S，Hamai Y，et al.Int J Cancer，2003，107(4)：593-596)。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是为类风湿关节炎易感性的诊断或类风湿关节炎药物的个体化治疗提供一种解决方法。

为此，本发明公开了IL-6R基因SNP位点在制备诊断类风湿关节炎易感性的检测试剂盒中的用途。

在一些实施例中，所述IL-6R基因SNP位点为IL-6R基因-183A/G(rs4845617)和D358A/C(rs2228145)。

本领域技术人员将能通过能够检测SNP位点的任何方法或技术在个体的核酸中进行在本文所公开的一个或几个SNP标记上存在的核苷酸的分析。例如，一个人能用本发明所述的方法通过进行Taqman法、质谱法、DNA微阵列法、测序法、微测序、杂交、限制性片段分析、寡核苷酸连接检测、等位基因特异性PCR-HRM或联合应用上述方法检测SNP位点生物标记。当然，这一列表仅是示例性的，并且绝不用于限制本发明。本领域技术人员可使用任何合适的方法来实现这种检测。

本发明第二方面公开了IL-6R基因SNP位点单倍型或IL-6R和IL-6基因SNP位点单倍型在制备诊断类风湿关节炎易感性的检测试剂盒中的用途。

正如本领域所熟知，“单倍型”是指遗传标记的任何组合。单倍型能包含两个或更多的等位基因。发现本文所述的单倍型(或“风险单倍型”)在具有患类风湿关节炎风险的个体中比在健康个体中更频繁和更显著。因此，这些单倍型对于检测类风湿关节炎风险，或者个体对于类风湿关节炎的敏感性具有预测价值。“风险单倍型”因此旨在包括本文所述的与类风湿关节炎高度相关和显著相关的标记上的一种单倍型或单倍型组合。

本领域技术人员能通过本领域所熟知的检测SNP位点的序列的方法来进行单倍型的检测。

在一些实施例中，IL-6R基因SNP位点单倍型为IL-6R基因SNP位点rs4845617和rs2228145单倍型，为G-A、A-A或G-C单倍型。

其中G-A单倍型增加RA患病风险，A-A和G-C单倍型降低RA患病风险。