[发明专利]IL-6R基因SNP位点的用途有效
申请号: | 201110412140.6 | 申请日: | 2011-12-12 |
公开(公告)号: | CN102517383A | 公开(公告)日: | 2012-06-27 |
发明(设计)人: | 尤崇革;谢小冬;施星臣;施鑫鹤 | 申请(专利权)人: | 尤崇革;谢小冬 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 730030 甘肃省兰州市城*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | il 基因 snp 用途 | ||
1.IL-6R基因SNP位点在制备诊断类风湿关节炎易感性的检测试剂盒中的用途。
2.如权利要求1所述的用途,其特征在于所述IL-6R基因SNP位点为rs4845617和rs2228145。
3.IL-6R基因SNP位点单倍型或IL-6R和IL-6基因SNP位点单倍型在制备诊断类风湿关节炎易感性的检测试剂盒中的用途。
4.如权利要求3所述的用途,其特征在于所述IL-6R基因SNP位点单倍型为IL-6R基因SNP位点rs4845617和rs2228145单倍型,G-A、A-A或G-C单倍型。
5.如权利要求3所述的用途,其特征在于所述IL-6R和IL-6基因SNP位点单倍型为IL-6和IL-6R两个基因的五个SNP位点IL-6-rs1800796/rs1800797/rs1800795/IL-6R-rs4845617/IL-6R-rs2228145单倍组合,为C-G-G-G-A、G-G-G-A-C、G-G-G-G-A、C-G-G-A-C、G-G-G-A-A或G-G-G-G-C单倍组合。
6.如权利要求1或3中所述检测试剂盒,包括基因组DNA抽提试剂、PCR反应体系试剂和HRM荧光染料试剂,所述PCR反应体系包括dNTP、MgCl2、Taq DNA聚合酶、PCR反应缓冲液和引物,其特征在于所述引物为分别针对IL-6R基因SNP位点rs4845617和rs2228145的引物对,和/或分别针对IL-6基因SNP位点rs1800796、rs1800797和rs1800795的引物对。
7.如权利要求6所述的检测试剂盒,其特征在于所述针对IL-6R基因SNP位点rs4845617的引物对的核酸序列如SEQ ID No.1~2所示,针对IL-6R基因SNP位点rs2228145的引物对的核酸序列如SEQ ID No.3~4所示;针对IL-6基因SNP位点rs1800796的引物对的核酸序列如SEQ ID No.5~6所示;针对IL-6基因SNP位点rs1800797的引物对的核酸序列如SEQ ID No.7~8所示;针对IL-6基因SNP位点rs1800795的引物对的核酸序列如SEQ ID No.9~10所示。
8.如权利要求6所述的检测试剂盒,其特征在于所述Taq DNA聚合酶为realstart酶。
9.如权利要求6所述的检测试剂盒,其特征在于所述HRM荧光染料为EvaGreen、Syto9、Resolight和SupperGreen中之一。
10.一种类风湿性关节炎易感性的检测方法,包括下列步骤:
a)基因组DNA的抽提;
b)PCR检测:PCR反应体系包含10-30ng基因组DNA,1×PCR Buffer,0.25UTaq DNA聚合酶,0.2mM dNTP,0.3μM上下游引物,1×HRM荧光染料,Mg2+浓度根据HRM荧光染料的种类不同变化;PCR扩增条件为预变性95℃2min,变性94℃10sec,退火延伸60℃30sec,共30-40个循环;
c)HRM检测:条件为96℃30sec,50℃30sec,熔解曲线数据收集从83℃到90℃,温度上升率0.05℃/s;
d)基因分型:依据熔解曲线峰型的改变进行基因分型;
其中所述上下游引物为分别针对IL-6R基因SNP位点rs4845617和rs2228145的引物对,和/或分别针对IL-6基因SNP位点rs1800796、rs1800797和rs1800795的引物对。
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