[发明专利]NPM1基因突变检测方法及其试剂盒无效
申请号: | 201110399166.1 | 申请日: | 2011-12-06 |
公开(公告)号: | CN102382896A | 公开(公告)日: | 2012-03-21 |
发明(设计)人: | 费敏 | 申请(专利权)人: | 苏州苏大赛尔免疫生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 215000 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | npm1 基因突变 检测 方法 及其 试剂盒 | ||
1.本发明提供NPM1基因突变检测方法,包括以下步骤:
(a)提取待检样本的DNA;
(b)用自行设计的用于检测NPM1基因12号外显子开放阅读框多种突变位点的扩增引物对步骤(a)中的待检样本DNA进行PCR扩增;
(c)用自行设计的用于检测NPM1基因12号外显子开放阅读框多种突变位点的测序引物对步骤(b)中扩增后的DNA进行测序;
(d)将步骤(c)中的测序结果与标准NPM1基因12号外显子开放阅读框进行比较,并进行序列分析,即可找出突变类型与突变位点。
2.本发明根据人5号染色体基因组序列登录号:NT_023133.13设计NPM1基因12号外显子开放阅读框相关引物如下,
NPM1基因12号外显子开放阅读框PCR扩增引物:
NPM1F:5’-TCGGGAGATGAAGTTGGAAGTA-3’(NT_023133.13:15648494~15648515);
NPM1R:5’-CATTTATCAAACACGGTAGGGA-3’(NT_023133.13:15648943~15648964);
NPM1基因12号外显子开放阅读框测序反应引物:
NPM1R2:5’-GGACAGCCAGATATCAACT-3’(NT_023133.13:15648899~15648917)。
3.本发明还提供NPM1基因突变检测试剂盒,包括:PCR Amplification Mixture;Primer(sense,antisense)、HotStarTaq酶、消化酶、Sequencing Mixture。
4.根据权利要求3述NPM1基因突变检测试剂盒,其特征在于NPM1基因突变检测试剂盒采用HotStarTaq DNA Polymerase作为热启动酶,扩增反应体系为:每50μl中含5μl的10倍扩增缓冲液、2μl浓度为25mM的Mg2+、2μl浓度为10mM的dNTPs、1.5μl浓度为10μM的正向引物、1.5μl浓度为10μM的反向引物、0.3μl的Taq DNA聚合酶、1μl的DNA模板、余量为mH2O,测序反应体系为:4μl的BigdyeV3.1、3μl的mH2O、1μl浓度为10μM的Sequencing引物(F,R)、2μl的PCR产物。
5.根据权利要求3述NPM1基因突变检测试剂盒,其特征在于NPM1基因突变检测试剂盒采用的扩增反应步骤为:先95℃反应15min,进入循环,循环中先94℃反应0.5min,然后56℃反应0.5min,然后72℃反应1min为一个循环,共反应35个循环然后72℃反应7min,最后4℃保存。
6.根据权利要求3述NPM1基因突变检测试剂盒,其特征在于NPM1基因突变检测试剂盒采用的测序反应步骤为:先94。℃反应0.5min,然后50。℃反应0.5min,然后60。℃反应2.0min为一个循环,共反应24个循环。
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